Exploration de la diversité de Carnobacterium maltaromaticum en vue d'identifier des souches protectrices anti-Listeria monocytogenes à robustesse élevée
| Auteur / Autrice : | Sara El Kheir |
| Direction : | Anne-Marie Junelles, Samir Taha |
| Type : | Thèse de doctorat |
| Discipline(s) : | Biotechnologies et industries alimentaires |
| Date : | Soutenance le 12/12/2016 |
| Etablissement(s) : | Université de Lorraine en cotutelle avec Université Libanaise |
| Ecole(s) doctorale(s) : | RP2E - Ecole Doctorale Sciences et Ingénierie des Ressources, Procédés, Produits, Environnement |
| Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Laboratoire d'ingénierie des biomolécules (Vandoeuvre-les-Nancy) |
| Jury : | Président / Présidente : Ziad Abdel-Razzak |
| Examinateurs / Examinatrices : Anne-Marie Junelles, Samir Taha, Marie-France Pilet, Marie-Christine Champomier-Vergès, Frédéric Borges | |
| Rapporteurs / Rapporteuses : Marie-France Pilet, Marie-Christine Champomier-Vergès | |
| DOI : | 10.70675/ee41add7z533ez489dzac4dz825761b1b5f7 |
Résumé
L'industrie alimentaire cherche constamment à améliorer les processus de conservation des aliments. La biopréservation s’impose comme une alternative à l’utilisation de conservateurs dits «chimiques» et fait appel à des micro-organismes sélectionnés en tant que cultures protectrices pour leurs propriétés antimicrobiennes naturels. L'objectif de cette étude était de tirer profit de la diversité de Carnobacterium maltaromaticum afin d’identifier des souches capables d'inhiber la croissance du pathogène alimentaire Listeria monocytogenes. Pour cela, une méthode de typage moléculaire permettant la reconnaissance fine de souches a été établie, puis une méthode de criblage d’activités antibactériennes à robustesse élevée a été mise au point. La méthode de typage moléculaire est une méthode MLVA (Multiple-locus variable-number tandem repeat (VNTR) analysis) avec 3 loci de VNTR (VNTR-A, VNTR-B, VNTR-C) permet de discriminer 15 génotypes différents au sein d’une collection de 24 souches. Cela confirme la grande diversité génotypique et phénotypique présente au sein de la population de C. maltaromaticum et la performance de la méthode. La méthode de criblage est basée sur la réalisation d’essais de compétition à haut débit où chaque membre d’une collection de C. maltaromaticum a été co-cultivé avec une souche bioluminescente de L. monocytogenes. Il a été montré que la production de luminescence est le reflet de la croissance de L. monocytogenes en micro-culture et qu’il est ainsi possible de tester la stabilité du pouvoir antagoniste de chaque membre de la collection dans de multiples conditions de cultures différentes. Cette méthode a ainsi permis d’identifier des souches de C. maltaromaticum dont la propriété anti-L. monocytogenes est peu influencée par les conditions de cultures. Outre l’intérêt fondamental que présente cette méthode pour l’étude des interactions compétitives dans l’aliment, elle a permis d’identifier des souches présentant un fort potentiel de valorisation dans le domaine de la biopréservation alimentaire