Thèse en cours

Caractérisation du rôle des petits ARNs non codants et du silencing inter-organisme lors de l'interaction plante-nématodes à galles
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Auteur / Autrice : Ange Dussutour
Direction : Stéphanie Jaubert
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Interactions Moléculaires et Cellulaires
Date : Inscription en doctorat le 01/12/2022
Etablissement(s) : Université Côte d'Azur
Ecole(s) doctorale(s) : Sciences de la vie et de la santé
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : ISA - INSTITUT SOPHIA AGROBIOTECH
Equipe de recherche : Interactions Plantes-Nématodes

Résumé

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Le « silencing » inter-organisme constitue une nouvelle voie du dialogue moléculaire lors des interactions parasitaires. Ce processus est basé sur l'échange de petits ARN non codants (ARNnc) entre un organisme parasite ou pathogène et son hôte. Identifié lors de l'interaction entre le nématode parasite de vertébré Heligmosomoides polygyrus et la souris (Buck et al. 2014), il a été récemment mis en évidence chez un champignon et un oomycète phytopathogènes en interaction avec la plante modèle Arabidopsis thaliana (Cai et al. 2018 ; Dunker et al., 2020). Les nématodes du genre Meloidogyne sont des ravageurs d'importance agronomique majeure. A ce jour, aucune étude n'a encore été menée pour caractériser les échanges de petits ARNnc lors des interactions plantes-nématodes. Le projet de thèse vise à caractériser le rôle des petits ARN de la plante et du nématode dans le processus de silencing inter-organisme lors de l'interaction entre une plante d'intérêt agronomique, la tomate Solanum lycopersicum, et le nématode à galles modèle Meloidogyne incognita. Des premiers travaux basés sur des techniques de séquençage ont permis d'identifier plusieurs candidats : des petits ARN de nématode et leur transcrit cible dans plante et des petits ARN de plante et leur transcrit cible dans le nématode. Des approches directes d'identification et d'analyses fonctionnelles permettront de valider et de déterminer le rôle des petits ARN identifiés lors de l'interaction plante-nématodes à galles. Ce projet ouvrira de nouvelles perspectives dans l'étude du dialogue hôte-parasites et le développement de nouvelles stratégies de lutte contre les ravageurs.