Interactions entre attaques de bioagresseurs et croissance des plantes par une approche modèle appliquée au caféier robusta en Ouganda. Effets sur la production

Interactions between pest attacks and plant growth using a model approach. Application to robusta coffee in Uganda with effects on production

• Auteur / Autrice : Houssem Triki
• Direction : Marc Jaeger
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Informatique
• Date : Inscription en doctorat le 03/01/2022
• Etablissement(s) : Université de Montpellier (2022-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Information, Structures, Systèmes (Montpellier ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : AMAP - botAnique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des végétations
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Axe Plantes numériques : modèles, analyses et données de l'organe aux écosystèmes

Mots clés

Mots clés libres

Système dynamique discret

Fspm

Caféier

GreenLab

Modelisation

Modèle d'attaque de bioagresseur

GreenLab

Discrete Dynamic system

Modèle d'attaquie de bioagresseur

Coffee Tree

Fspm

Modelling

Résumé

L'étude propose de construire un cadre conceptuel générique de simulation de croissance de plantes soumises à des attaques de bioagresseurs (ravageurs ou champignons) et permettant d'évaluer les effets directs et indirects sur la plante et son rendement. On vise donc à Les travaux seront donc à évaluer la dynamique organogénétique et la réactivité des plantes en terme de croissance et de production en réponse à une attaque visant soit des entrenœuds (provoquant la mort du rameau attaqué) soit la chute de la capacité de production (atteinte de la surface foliaire active). On exploitera le potentiel du modèle par cohorte GreenLab qui permet le passage de l'individu plante au peuplement avec un même formalisme, et qui étend le concept des compartiments d'organes à des cohortes qui groupent les organes par type et âges (ontologique et physiologiques). On proposera un nouveau modèle permettant le couplage avec des modèles de plusieurs types d'attaques par des bioagresseurs et la simulation des impacts sur la plante et donc la prévision de récolte L'approche sera développée sur le caféier dans le cadre de partenariats en Ouganda sur i) des attaques du scolyte des branchettes Black Twig Borer (BTB), et ii) sur les attaques du champignon de la rouille sur les feuilles.

This study aims to provide a generic conceptual framework for simulating the plants growth subjected to bio-aggressors (pests or fungi) attacks and to evaluate the direct and indirect effects on the plant and its yield. The aim is to evaluate the organogenetic dynamics and the reactivity of plants in terms of growth and production in response to an attack targeting either internodes (causing the death of the attacked shoot) or the fall in production capacity (reducing the active leaf area). We will exploit the potential of the GreenLab cohort model, which allows the passage from the individual plant to the stand with the same formalism, and which extends the concept of organ compartments to cohorts that group the organs by type and age (ontological and physiological). A new model will be proposed that allows coupling with models of several types of bioaggressors attacks and the simulation of impacts on the plant and therefore harvest forecasting. The approach will be developed on coffee in the framework of partnerships in Uganda on i) attacks by the Black Twig Borer (BTB), and ii) attacks by the leaf rust fungus.