Auteur / Autrice : | Florian Cogoni |
Direction : | Sylvain Cussat-blanc, Valérie Dastugue-Lobjois |
Type : | Projet de thèse |
Discipline(s) : | Informatique et Télécommunications |
Date : | Inscription en doctorat le 01/10/2019 |
Etablissement(s) : | Toulouse 1 |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Mathématiques, informatique et télécommunications (Toulouse) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : IRIT : Institut de Recherche en Informatique de Toulouse |
Equipe de recherche : REVA - Réel Expression Vie Artificielle |
Mots clés
Mots clés libres
Résumé
La lutte contre le cancer est un enjeu sociétal majeur du fait des millions de nouveaux cas diagnostiqués chaque année. Dans ce projet de thèse, qui sinscrit dans le cadre dune collaboration établie depuis plusieurs années entre une équipe de biologistes du cancer (équipe ITAV-IP3D) et une équipe dinformatique (équipe IRIT-REVA), nous proposons de construire une plateforme de simulation de croissance de microtumeurs en 3D dans différentes conditions environnementales. Cette plateforme permettra la réalisation dexpériences dans un environnement virtuel 3D dans lequel la physique et la physiologie cellulaire seront simulées. Lobjectif est que cette plateforme puisse devenir un outil pour les biologistes permettant lexploration et la mise au point de protocoles expérimentaux permettant doptimiser des stratégies de traitement. Des protocoles standardisés dexpériences à réaliser in vitro seront établis pour lobtention de données minimales permettant la calibration des modèles numériques. Les biologistes pourront alors interagir avec les simulations en modifiant les paramètres de la simulation, tout comme ils pourraient le faire au laboratoire par des approches biologiques ou pharmacologiques. Le but ultime dune telle plateforme est de permettre aux biologistes, de la manière la plus versatile possible, dévaluer rapidement de multiples hypothèses in silico avant de réaliser des expériences in vitro lourdes et coûteuses.