Projet de thèse en Sciences de la Vie et de la Santé
Sous la direction de Carlos Lopez-vaamonde et de Sébastien Moreau.
Thèses en préparation à Tours en cotutelle avec l'Université d'Al Jazirah , dans le cadre de Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant - SSBCV , en partenariat avec Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte (laboratoire) depuis le 14-08-2016 .
Les outils de diagnostic moléculaires constituent un support précieux pour l'identification rapide et précise d'espèces exotiques morphologiquement indistinctes. Parmi ceux-ci, le codage à barres de l'ADN pourrait constituer un outil efficace et précis pour l'identification des espèces envahissantes. Ce projet est proposé pour mesurer la diversité et l'abondance relative des abeilles dans DNP et pour identifier les origines végétales du miel produit à l'aide de techniques de codage à barres. Les résultats seront évalués en fonction de la probabilité de lacunes dans les codes à barres, suffisante pour distinguer les Apidae invasifs et l'origine végétale du miel. Diversité génétique des abeilles mellifères au Soudan et dans le Dindir National Pakr Objectif: caractériser les sous-espèces et les écotypes d'abeilles du Soudan à l'aide de données moléculaires et morphométriques. L'objectif est d'étudier les variations génétiques parmi les populations d'abeilles mellifères au Soudan et dans le parc national du Dindir afin d'identifier une possible structuration géographique. Nous proposons une stratégie d'identification des abeilles mellifères africaines utilisant la morphométrie et une procédure améliorée de mitotypage par réaction en chaîne de la polymérase (PCR) qui distingue les abeilles sauvages de manière maternelle. Pour ce faire, nous allons collecter des échantillons d'abeilles lors de nombreux voyages d'enquête. 500 échantillons de colonies de l'abeille indigène soudanaise Apis mellifera seront récoltés. Les échantillons seront prélevés entre 3º N et 22º de latitude nord, 23º E et 38º de longitude ouest et au moins trois zones géographiques différentes du Soudan; à savoir le désert, la savane et les zones forestières. L'ADN génomique total sera extrait à l'aide du protocole Promega, conformément aux instructions du fabricant. La région intergénique COI-COII de l'ADNmt sera ensuite amplifiée à l'aide d'amorces spécifiques d'un gène. Le concept de taxonomie numérique introduit dans la taxonomie des abeilles par Du Praw (1964) et développé par Rutter et ses collaborateurs (1978) sera utilisé L'analyse morphométrique intègre la longueur de l'aile ainsi que plusieurs autres mesures du corps. Ceux-ci incluent les largeurs antérieures et postérieures, le nombre de hamuli, les angles et les longueurs de nageoire des ailes, les longueurs de tibia et de fémur postérieurs, les mesures de sternite, Comportement défensif, recherche de nourriture et production de miel des abeilles soudanaises soudanaises dans les régions semi-désertiques et la savane: Il est urgent de mieux comprendre l'incidence du climat sur l'habitat, les modes de vie et l'efficacité globale des abeilles mellifères. Ce type de recherche peut être facilité par l'utilisation de différentes régions géographiques (désert et savane). Des inquiétudes ont été soulevées sur le point de savoir si une telle «gestion migratoire de sous-espèces géographiques» causait un stress excessif aux abeilles. Pour résoudre ce problème, nous mènerons des expériences sur le terrain en comparant les abeilles dans leur région géographique d'origine, comme indiqué dans le chapitre 1. Ensuite, nous allons créer des foyers croisés hébergés dans des ruches d'observation et comparer leurs performances à celles de colonies similaires situées au même endroit pas été déplacé.
The use of morphometric and geometric analysis to assess wild honeybee ecotypes (Hymenoptera: Apidae) composition and studies of The ecological impact of colonies relocation on indigenous honey bee performance under Semi-arid and Tropical savanna
Molecular diagnostic tools provide valuable support for the rapid and accurate identification of morphologically indistinct alien species. Among these, the DNA barcoding has the potential to be an efficient and accurate tool for the identification of invasive species. This project is proposed to measure the diversity and relative abundance of honeybees in DNP and to identify the plant origins of produced honey using Barcoding techniques. The results will be assessed for the probability of barcode gaps sufficient to discriminate the invasive Apidae and plant origin of honey. Genetic diversity of honey bee in Sudan and the Dindir National Pakr Objective: To characterize subspecies and ecotypes of Sudan honey bees using molecular and morphometric data. The aim is to investigate genetic variations among honeybee populations in Sudan and in the Dindir National Park in order to identify potential geographic structuring. We propose an African honey bee identification strategy using morphometrics and an improved polymerase chain reaction (PCR)-based prototyping procedure that distinguishes between feral bees maternally. To do that we will collect samples of bees in a number of survey trips, 500 colony samples of the native Sudanese honeybee Apis mellifera workers will collect. Samples will be collected within the latitude 3º N to 22º N and longitude 23º E and 38º E. and from at least three different geographical zones of Sudan; namely desert, savannah and forest zones. Total genomic DNA will extract using the promega protocol according to the manufacturer's instructions. The COI-COII intergenic region of the mtDNA will then amplified using gene-specific primers. The concept of numerical taxonomy which introduced into honey bee taxonomy by Du Praw (1964) and further elaborated by Rutter et al.(1978) will be used The morphometric analysis incorporates wing length as well as several other body measurements. These include forewing and hindwing widths, number of hamuli, wing venation angles and lengths, hind tibia and femur lengths, sternite measurements, Defensive behaviour, foraging activity, and honey production of the Sudanese honey bees in semi-desert and savannah regions: There is an urgent need to better understand how climate affects habitat, life patterns, and the overall effectiveness of honey bees. This type of research can be facilitated through the use of different geographic regions (desert and savannah). Concerns have been raised about whether such migratory management of geographical sub-species causes bees undue stress. To address this issue, we will conduct field experiments comparing bees in their original geographical region as mentioned in chapter one. Then we will cross-foster colonies housed in observation hives onto the migratory operation and compare their performance to similar colonies at the same location that had not been moved.