Reproductibilité en recherche thérapeutique : le rôle des financeurs et réanalyse d'essais cliniques via des plateformes de partage de données

Reproducibility in therapeutic research : Funders’ rôle and reanalysis of clinical trials available on data sharing platforms

• Auteur / Autrice : Jeanne Fabiola Gaba
• Direction : Florian Naudet, Alain Dupuy
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Épidémiologie, analyse de risque, recherche clinique
• Date : Soutenance le 08/12/2022
• Etablissement(s) : Rennes 1
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre d'investigation clinique -- Rennes
• Jury : Président / Présidente : Silvy Laporte
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Pascale Fabbro, François Montastruc, Clara Locher
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Agnès Dechartres, Jean-Christophe Lega

Mots clés

Mots clés contrôlés

Études cliniques

Données de la recherche

Données ouvertes

Reproductibilité (sciences)

Mots clés libres

Transparence de la recherche

Reproductibilité

Partage de données

Essais cliniques

Research transparency

Reproducibility

Open science

Data sharing

Clinical trials

Résumé

Cette thèse explore plusieurs facettes de la reproductibilité de la recherche thérapeutique, en s’intéressant aux initiatives d’ouverture et de partage de données mis en place pour endiguer la « crise de la reproductibilité » que connait la recherche en général et plus particulièrement la recherche biomédicale. Nous nous sommes intéressés aux politiques de partage de données des financeurs, et à l’impact de ces politiques sur la disponibilité, le partage et la réutilisation des données issues d’essais cliniques. Les indicateurs de disponibilité étudiés relèvent que les politiques actuelles sont inefficaces pour garantir un partage effectif des données. Les financeurs devraient adopter une politique plus forte sur le partage de données, incluant des méthodes d’évaluation, pour s’assurer que les objectifs du partage sont atteints, le tout appuyé par des actions concertées et conjointes avec les acteurs de l’écosystème scientifique tels que les chercheurs et le système éditorial scientifique.Nous avons également exploré la reproductibilité en recherche thérapeutique. Les données d’un échantillon aléatoire de 62 essais cliniques ont été demandées via des plateformes de partage puis réanalysées. Nous présentons ici les premiers résultats. Les résultats préliminaires portent sur 21 essais cliniques randomisés, dont la reproductibilité inférentielle a été évaluée. Les critères de jugements ont été reproduit à 85.7%. Les conclusions de cette thèse visent à informer les acteurs de la recherche et à contribuer à l’amélioration des politiques de données ainsi que des pratiques, qui cherchent à faire progresser la recherche thérapeutique vers plus de transparence et une meilleure reproductibilité.

This thesis explores several facets necessary for the reproducibility of therapeutic research, by focusing on the initiatives of openness and data sharing put in place to stem the "crisis of reproducibility" experienced by research in general and more particularly biomedical research. We looked at the data sharing policies of funders, and the impact of these policies on the availability, sharing and reuse of data from clinical trials. The studied availability indicators show that current policies are ineffective in ensuring effective data sharing. Funders should adopt a stronger policy on data sharing, including evaluation methods, to ensure that the objectives of sharing are met, all supported by concerted and joint actions with stakeholders such as researchers and the scientific editorial system. We also explored reproducibility in therapeutic research. Data from a random sample of 62 clinical trials were requested via data sharing platforms and then re-analysed. Here we present the first results. The preliminary results relate to 21 randomized clinical trials whose inferential reproducibility has been assessed. The primary outcomes of the reanalysed trials were reproduced at 85.7%. The conclusions of this thesis aim to enlighten research actors and contribute to the improvement of data policies as well as practices, which seek to advance therapeutic research towards more transparency and better reproducibility.