Le risque de brucellose bovine en Equateur : structuration par les mouvements de bovins, facteurs de risque d’infection des élevages et perception par les différents acteurs

The risk of bovine brucellosis in Ecuador: structuring by cattle movements, risk factors for infection of farms and perception by the various actors

• Auteur / Autrice : Rommel Vinueza sierra
• Direction : Gina Zanella, Benoit Durand
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Epidémiologie
• Date : Inscription en doctorat le ; Soutenance le 22/06/2023
• Etablissement(s) : Paris 12
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé Publique
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Epidémiologie des zoonoses virales, bactériennes et parasitaires
• Jury : Président / Présidente : Christine Fourichon
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Gina Zanella, Nathalie Bareille, Nicolas Moussiaux, Sophie Molia, Aurélien Madouasse, Benoit Durand
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Nathalie Bareille, Nicolas Moussiaux

Mots clés

Mots clés libres

Brucellose

Mouvements de bovins

Analyse des réseaux

Facteurs de risque

Equateur

Groupes focaux

Brucellosis

Cattle Movements

Network Analysis

Risk factors

Focus groups

Focal Groups

Résumé

La brucellose bovine est une maladie qui provoque des pertes économiques en Équateur et met en danger la santé publique des habitants. Certains éléments, tels que les mouvements de bovins dus au commerce, le type d'exploitation, certaines pratiques d'élevage, ainsi que le niveau de connaissance et la manière d'appréhender la maladie, peuvent entraîner la propagation de la brucellose et maintenir des taux de prévalence élevés dans différentes régions du pays. Le premier objectif de cette thèse était de comprendre comment une infection telle que la brucellose peut se propager à travers un réseau national de commerce de bétail. En utilisant les bases de données de l'inventaire national des bovins et les bases de données des mouvements de bovins de l'Équateur pour les années 2017 et 2018, nous avons construit deux réseaux de mouvements : le premier pour une maladie à propagation rapide telle qu'un sérotype de fièvre aphteuse absent du vaccin utilisé actuellement dans le pays, et un autre réseau pour représenter la propagation d'un agent à propagation lente tel que la brucellose. Les réseaux ont été analysés annuellement et mensuellement au niveau des paroisses en utilisant la méthodologie de l'analyse de réseaux. Pour les deux réseaux, la plus grande composante fortement connexe au niveau annuel comprenait 90 % des nœuds et la plus grande composante faiblement connexe tous les nœuds, ce qui indique une très faible fragmentation. Une analyse de percolation a révélé que la plupart des paroisses devaient être supprimées pour éliminer les plus grandes composantes fortement connexes. Sur la base de certaines caractéristiques du réseau, nous avons pu établir qu'une maladie hautement contagieuse pouvait se propager rapidement dans tout le pays et qu'une infection à transmission plus lente, telle que la brucellose, pouvait se propager au sein de groupes locaux de paroisses. Le deuxième objectif de la thèse était d'estimer la prévalence inter-exploitation, les facteurs de risque de la brucellose bovine et les pratiques à haut risque pour la santé humaine dans les petites et moyennes exploitations bovines d'une région tropicale de l'Équateur. La prévalence apparente dans les élevages était de 11,5 % (IC 95 % : 6,7-16,2). Le groupe d'exploitations de taille moyenne avait une prévalence significativement plus élevée que les petites exploitations. Deux analyses multivariables ont été réalisées pour identifier les facteurs de risque associés à la brucellose bovine ou aux problèmes de reproduction. La taille de l'exploitation a été identifiée comme un facteur de risque pour la brucellose bovine et l'incinération/l'enfouissement du matériel d'avortement comme un facteur de protection. La taille de l'exploitation et la positivité de la brucellose ont été identifiées comme des facteurs de risque pour les problèmes de reproduction. Le troisième objectif de cette étude était d'appliquer la méthode de recherche qualitative des groupes de discussion aux producteurs de petites et moyennes exploitations et aux vétérinaires des secteurs public, privé et universitaire afin de mieux comprendre les aspects sociaux liés à la présence éventuelle de la maladie dans les petites et moyennes exploitations. Nous avons constaté que le niveau de connaissance et de sensibilisation à la maladie chez les petits et moyens éleveurs ainsi que des éléments liés à leur éducation, âge et sexe seraient en train d’affecter la mise en œuvre des mesures de contrôle de la brucellose bovine en Équateur.

Bovine brucellosis is a disease that causes economical losses in Ecuador and puts the inhabitant's public health at risk. Some elements, such as cattle movements due to trade, the type of farms, certain livestock practices, and the level of knowledge and the way of understanding the disease, can cause brucellosis to spread and maintain high prevalence rates in different regions the country. The first objective of this thesis was to understand how an infection such as brucellosis can spread through a national livestock trade network. Using the databases of the nationwide bovine inventory and the databases of bovine movements of Ecuador for the years 2017 and 2018, we built two movement networks: the first for a rapidly spreading disease such as a serotype of foot-and-mouth disease currently absent in the vaccine used in the country, and the other for a network representing the spread of a slow-spreading agent such as brucellosis. The networks were analyzed annually and monthly at the parish level using the network analysis methodology. For both networks, the largest strong component at the annual level included 90% of the nodes, and the largest weak component had all nodes, indicating very low fragmentation. A percolation analysis revealed that most parishes needed to be removed to remove the largest strong components. Based on some network characteristics, we established that a highly contagious disease could spread rapidly and that a slower-transmitting infection, such as brucellosis, could spread within local groups. The second objective of the thesis was to estimate the between herd prevalence and risk factors of bovine brucellosis and high-risk practices for human health in small and medium-sized cattle farms in a tropical region of Ecuador. The apparent prevalence among farms was 11.5% (95% CI: 6.7-16.2). The medium-sized group of farms had a prevalence significantly higher than the small farms. Two multivariable analyses were conducted to identify risk factors associated with bovine brucellosis or reproductive problems. Farm size was identified as a risk factor for bovine brucellosis and incineration/burial of abortion material as a protective factor. Farm size and brucellosis positivity were identified as risk factors for reproductive problems. The third objective of this study was to apply the qualitative research method of focus groups in producers of small and medium farms and veterinarians from the public, private and academic sectors to achieve a better understanding of social aspects related to the possible presence of the disease in small and medium-sized farms. We found that the level of knowledge and awareness of the disease among small and medium-size farmer and that other elements related to education, age and gender, which could be affecting the implementation of measures for the bovine brucellosis control in Ecuador.