Analyse exhaustive et modèles chémoinformatiques prédictifs des données physicochimiques et (éco)toxicologiques concernées par REACH

Comprehensive data analysis and predictive chemoinformatics models for REACH related physicochemical and (eco)toxicity properties

• Auteur / Autrice : Filippo Lunghini
• Direction : Alexandre Varnek, Gilles Marcou
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chemoinformatique
• Date : Soutenance le 29/09/2020
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Chimie de la matière complexe (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Ronan Bureau
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Alexandre Varnek, Gilles Marcou, Ronan Bureau, Patricia Rotureau, Philippe Azam, Ester Papa
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Ronan Bureau, Patricia Rotureau

Mots clés

Mots clés contrôlés

Union européenne. Règlement (CE) n°1907/2006 du Parlement européen et du Conseil du 18 décembre 2006 concernant l'enregistrement, l'évaluation et l'autorisation des substances chimiques, ainsi que les restrictions applicables à ces substances (REACH), instituant une agence européenne des produits chimiques, modifiant la directive 1999/45/CE et abrogeant le règlement (CEE) n° 793/93 du Conseil et le règlement (CE) n° 1488/94 de la Commission ainsi que la directive 76/769/CEE du Conseil et les directives 91/155/C EE, 93/67/CEE, 93/105/ CE et 2000/21/CE de la Commission

Dissertation universitaire

Relation quantitative structure-activité

Santé publique -- Droit européen

QSAR (biochimie)

Modélisation prédictive

Informatique

Écotoxicologie

Chimie -- Informatique

Mots clés libres

REACH

QSAR

Ecotoxicologie

REACH

QSAR

Ecotoxicology

Résumé

Cette thèse concerne la modélisation de propriétés environnementales et (éco)-toxicologiques pertinentes dans le cadre du règlement de l'Union Européenne sur l'enregistrement, l'évaluation, l'autorisation et la restriction des substances chimiques (REACH, CE n ° 1907/2006). Des modèles statistiques ont été générés à l'aide de méthodes d'apprentissage automatique, telles que les Séparateurs à Vaste Marge (SVM) ou les Forêts Aléatoires (Random Forest), et des descripteurs moléculaires. Les modèles sont conçus pour être utilisés comme une alternative crédible aux tests expérimentaux et pour compléter les données manquantes dans le cadre du règlement REACH. Les nouveaux modèles présentent plusieurs avantages par rapport aux modèles existants: (i) ils sont construits sur des ensembles de données sensiblement plus grands; (ii) ils sont validés sur des données externes de tailles significatives composés d’exemples issus d’un contexte industriel (l’entreprise Solvay); (iii) la précision des modèles est améliorée et leurs domaines d'applicabilité sont étendus.

This thesis concerns the modelling of several environmental fate and (eco)toxicological properties relevant under the European Union Registration, Evaluation, Authorisation and Restriction of Chemical Substances Regulation (REACH, EC No 1907/2006). Statistical models have been generated using state-of-the-art machine learning methods, such Support Vector Machine and Random Forest and molecular descriptors. Models have been internally and externally validated following internationally recognized guidelines, especially the OECD principles. The models are designed to be used as valid alternative to experimental testing and data-gap filling under the REACH regulation. New models possess several advantages over already existing ones: (i) noticeable larger training sets; (ii) external validation on a significant number of compounds coming from the Industrial context (Solvay portfolio); (iii) better accuracy and extended applicability domain.