Cartographie génétique comparée chez les Fagacées

Comparative genetic mapping in fagaceae

• Auteur / Autrice : Manuela Casasoli
• Direction : Antoine Kremer
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences du vivant, géosciences et sciences de l'environnement. Biologie cellulaire et moléculaire
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Bordeaux 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Adaptation (biologie)

Chromosomes végétaux -- Cartes

Châtaigniers

Chêne pédonculé

Résumé

La cartographie génétique comparée, portant sur la comparaison de cartes génétiques d'espèces phylogénétiquement proches, permet de reconstituer l'histoire évolutive des génomes grâce à l'identification des réarrangements chromosomiques qui se sont produits au cours du temps. De la même manière, la conservation du contenu et de l'ordre des gènes entre les espèces donne la possibilité de transférer les connaissances moléculaires et génétiques d'une espèce à l'autre. Chez les arbres forestiers, peu d'études de ce type ont été menées jusqu'à présent. Dans le cadre de cette thèse, les cartes génétiques et la position des QTL contrôlant des caractères d'adaptation ont été comparées entre Quercus robur L. Et Castanea sativa Mill. (2n = 2x = 24), deux espèces forestières majeures en Europe, appartenant à la famille des Fagacées. Les 12 groupes de liaison des cartes génétiques des deux espèces ont été associés à l'aide de marqueurs microsatellites et de STS dérivés de séquences EST. La comparaison des deux cartes génétiques a montré que la macro synténie et la macro colinéarité sont conservées entre les deux espèces. Le génome des Fagacées ne semble pas avoir subi des réarrangements majeurs au cours de l'évolution. Les QTL impliqués dans trois caractères adaptatifs, le débourrement, la croissance en hauteur et la discrimination isotopique du carbone 13, ont été détectés chez le châtaignier et leur position comparée avec celle des QTL impliqués dans les mêmes caractères chez le chêne. Le déterminisme génétique (nombre et effet des QTL détectés) est conservé entre les deux espèces. La position des QTL impliqués dans le débourrement est remarquablement conservée, en revanche peu de QTL contrôlant la croissance en hauteur et la discrimination isotopique du carbone 13 correspondent entre les deux espèces. Les différences d'héritabilité et de complexité entre les trois caractères étudiés peuvent expliquer les résultats obtenus.