Conséquences des extinctions d’espèces sur les pertes d’histoire évolutive

Consequences of species extinctions on evolutionary history loss

• Auteur / Autrice : Simon Veron
• Direction : Philippe Clergeau, Sandrine Pavoine
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé
• Date : Inscription en doctorat le 07/11/2013; Soutenance le 28/11/2016
• Etablissement(s) : Paris, Muséum national d'histoire naturelle
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la nature et de l'Homme - Évolution et écologie (Paris)

Mots clés

Mots clés libres

Co-extinctions

Conservation

Espèces à données insuffisantes

Extinctions d’espèces

Diversité phylogénétique

Originalité phylogénétique

Co-extinctions

Conservation

Data-deficient species

Species extinctions

Phylogenetic diversity

Evolutionary distinctiveness

Résumé

Du fait des activités humaines les espèces s’éteignent à un rythme si rapide qu’une sixième crise d’extinction a probablement débuté. Il est de plus probable que ces phénomènes d’extinction s’intensifient dans le futur. Néanmoins toutes les espèces ne peuvent être sauvées et les biologistes doivent faire des choix pour protéger au mieux la biodiversité. Un défi crucial est alors d’estimer et quantifier quelle biodiversité est menacée ainsi que de proposer des stratégies de conservation adaptées. Cette thèse s’intéresse aux conséquences des extinctions d’espèces sur l’histoire évolutive, principalement mesurée par des indices de diversité et d’originalité phylogénétique (la phylogénie représentant les relations évolutives entre espèces sous une forme proche de celle d’un arbre). Nous montrons comment les extinctions d’espèces peuvent appauvrir ‘l’arbre du vivant’ et mettons en avant pourquoi la conservation de l’histoire évolutive permettrait de réduire les conséquences des extinctions d’espèces sur la biodiversité. Nous analysons pour quels taxons et dans quelles régions du monde l’histoire évolutive est menacée. En particulier nous identifions les sites prioritaires du bassin méditerranéen, un point chaud de biodiversité, pour la conservation de la diversité et de l’originalité phylogénétique menacée de la région. Puis nous nous intéressons à deux risques peu étudiés sur les pertes d’histoire évolutive. Dans un premier temps nous estimons les possibles impacts des espèces à « Données insuffisantes » sur les pertes de diversité et d’originalité phylogénétique. Puis nous proposons une méthode pour mesurer les conséquences des co-extinctions sur l’histoire évolutive. Enfin nous discutons de projets et de recherche prometteurs pour inclure des critères de diversité et d’originalité phylogénétique dans les actions de conservation.

Species go extinct at disproportionate rates due to human activities such that a sixth mass extinction crisis has probably begun. In the future extinction risks are believed to intensify. However all species may not be saved and conservationists have to make choice about how to best protect biodiversity. A crucial challenge is thus to assess what and how much biodiversity is threatened and to design appropriate conservation strategies. This thesis focus on the impact of species extinctions on evolutionary history, especially measured through indices of phylogenetic diversity and evolutionary distinctiveness (phylogeny is a tree-like figure which represents evolutionary relationships among species). Preserving phylogenetic diversity and evolutionary distinctiveness are valuable measures for biodiversity conservation as they depict Earth evolutionary heritage, may sustain important ecological functions and provide current and future benefits for human well-being. We show how species extinctions can prune the ‘tree of life’ and highlight why conserving evolutionary history can mitigate the effects of extinctions on biodiversity. We review in which groups and in which regions of the world evolutionary history is at risk. Especially we identify priority areas for the conservation of threatened phylogenetic diversity and evolutionary distinctiveness in the Mediterranean Basin, one of the richest and most endangered area of biodiversity in the world. We then address two important gaps in assessments of evolutionary history at risk. First we estimate the likely impact of data-deficient species (species whose threat status in poorly known) on the loss of phylogenetic diversity and evolutionary distinctiveness. Second we propose a method to measure the consequences of co-extinctions on evolutionary history. From this we discuss on promising projects and research to include phylogenetic diversity and evolutionary distinctiveness in conservation programs.