Recherche Avancée

Thèse soutenue

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Auteur / Autrice : Luis Barbosa Fernandes Barreiro
Direction : Lluis Quintana-Murci
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Génomes et protéines
Date : Soutenance en 2008
Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

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La détection de l'action de la sélection naturelle sur le génome humain représente un outil puissant pour identifier des régions génomiques ayant joué un rôle biologique majeur dans la survie de notre espèce et qui peuvent également être associées à la susceptibilité aux maladies. Étant donné que les maladies infectieuses ont été un facteur de sélection majeur dans l'évolution de l'homme, l'identification de loci impliqués dans la réponse immunitaire qui ont été ciblés par la sélection naturelle peut d'une part apporter de nouvelles connaissances sur les mécanismes de défense immunologique et d'autre part identifier des voies de signalisation immunologiques jouant un rôle important dans la résistance aux pathogènes. Nous avons étudié dans quelle mesure la sélection naturelle a modulé les profils de diversité génétique des récepteurs de l'immunité innée DC-S/G/V, L-S/GA/, MBL2 et la famille des récepteurs Toll-like (TLRs) humains. Nous avons montré que les différents acteurs de la réponse immunitaire ont suivi des processus évolutifs entièrement différents. À l'échelle du génome entier, à travers des analyses du degré de différentiation des populations pour ~22. 8 million SNPs (Consortium HapMap), nous avons montré que la sélection positive a ciblé des régions géniques, principalement au niveau des variants soit non-synonymes soit localisés dans des régions régulatrices en 5'. Dans leur ensemble, nos différentes études ont montré que la sélection naturelle a significativement influencé l'évolution récente de notre espèce, et que les pressions de sélection exercées par les agents infectieux ont été particulièrement importantes dans le façonnement de la diversité du génome humain.