Impact d'un stress viral sur la transcription des SINE d'Arabidopsis thaliana et influence de l'ARN SINE sur la kinase GCN2

Impact of viral stress on SINE transcription and impact of SINE RNA on the GCN2 kinase

• Auteur / Autrice : Sébastien Lageix
• Direction : Jean-Marc Deragon
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physiologie et génétique moléculaire
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Clermont-Ferrand 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Biologie moléculaire végétale

Plantes -- Génétique moléculaire

ARN

Transcription génétique

Arabidopsis thaliana

Résumé

Chez les plantes, l'activation de la transcription des éléments SINE à la suite d'un stress comme l'infection virale reste à démontrer. Cependant, le virus FBNYV possède au sein de son gènome une protéine CLINK, qui est entre autre constituée d'un domaine de liaison à RB. La première étape de ce travail de thèse a porté sur l'analyse de la protéine CLINK et plus particulièrement l'effet de cette protéine sur le cycle cellulaire, sur la transcription pol III en général et sur la transcription des SINE endogènes de plantes. La seconde partie de cette étude porte sur la fonction des éléments SINE de plantes au sein de la cellule. La seule kinase d'eIF2alpha identifiée chez les plantes est la protéine GCN2. Nous avons choisi de caractériser la fonction de cette protéine chez Arabidopsis. Nous avons déterminé les mécanismes de régulation de la protéine en mettant en évidence certains inducteurs spécifiques aux plantes. Ce travail a permis de montrer l'importance de la protéine pour la plante et de découvrir des fonctions potentielles de la protéine dans des voies de stress typiques des végétaux. Enfin, l'impact des SINE sur l'activité de GCN2 a été analysé