Analyse de la diversité et de la structuration génétique d'une collection de blés tendres (Triticum aestivum) à l'aide de marqueurs agro-morphologiques, biochimiques et moléculaires

• Auteur / Autrice : Valérie Roussel
• Direction : François Balfourier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie et agronomie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Agrocampus Rennes (2004-2008)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Triticum aestivum

Ressources génétiques

Mots clés libres

Ressources génétiques,Triticum aestivum, marqueurs agro-morphologiques, marqueurs biochmiques, marqueurs microsatellites, structuration temporelle, structuration géographique

Résumé

Le centre de ressources biologiques de l'INRA de Clermont Ferrand regroupe environ 10 000 accessions de blé tendre conservées ex situ et provenant du monde entier. Dans un souci de gestion efficace des ressources génétique, l'un des objectifs du centre est de constituer une ou plusieurs core collections afin de pouvoir utiliser au mieux la diversité génétique de la collection de base. Une description préalable de cette collection a donc été nécessaire. L'objectif de cette thèse était de mettre en évidence d'éventuelles structurations génétiques présentes dans une collection d'environ 4 000 génotypes sélectionnés pour représenter tous les pays présents dans la colelction de base ainsi que toutes les périodes d'inscription au catalogue des accessions. Ce travail a été effectué à trois niveaux géographiques différents. Tout d'abord, une première étude a été entreprise sur une sous collection de 559 blé français afin d'analyser l'existence éventuelle d'une structuration génétique temporelle, c'est-à-dire liée à la date d'inscription au catalogue. Trois types de marqueurs ont été utilisés (caractères agro-morphologiques, marqueurs moléculaires et biochimiques) et les structurations temporelles obtenues avec chacun ont été très similaires. Les trois types de marqueurs mettent en évidence une proximité des landraces et des variétés anciennes, puis une séparation des blés plus récents vers 1970 pour les caractères agro-morphologiques et les marqueurs moléculaires et vers 1980 pour les marqueurs biochimiques. Le clivage observé dans les années 1970 provient vraisemblablement de l'introduction des généteurs étrangers portants des gènes de nanisme au début des années 60 et le clivage observé en 1980 pour les marqueurs biochimiques explique la prise en compte des critères de qualité à cette période lors de la sélection du blé.

Genetical resources centre at INRA Clermont-Ferrand groups about 10 000 bread wheat accessions originating from all over the world and maintained using the ex-situ technique. To proceed an efficient management of these resources one of the aims o this centre is to create one or several core collections, to be able to use in the best way the genetic diversity presented in the entire collection. So, a preliminary description of this collection was necessary. The aim of this thesis was to evidence possible genetic structuration in a sub-collection composed with about 4 000 accessions representing all the countries presented in the whole collection, and all the periods or registratrions. This work was processed tat three different geographical levels. First a study was done using a sub-collection of 559 french bread wheat accessions to analyse a possible temporal structuration linked to the registration period. Three different markers were used (agro-morphologic, molecular and biochemical) and the structurations obtained wre quite similar. All the markers evidenced a nearness between landraces and old varieties and a separation of the most recent wheats in the 70ies for agro-morphological traits and molecular markers, and in the 80ies for biochimecal markers. The separation observed in the 70ies comes probably from the introduction at the early 60ies of foreign genitors possessing dwarf genes, while the separation observed in the 80ies for biochemical markers indicates the new interest for the quality criteria in selection at this time.