Ecologie et physiologie des microorganismes hydrogénotrophes des écosystèmes digestifs : étude particulière de l'écosystème ruminal

Ecology and physiology of the hydrogen-utilizing microorganisms of digestive ecosystems. Particular study of the ruminal ecosystem

• Auteur / Autrice : Brieuc Morvan
• Direction : Gérard Fonty
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences. Écologie microbienne
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Lyon 1
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Gérard Fonty

Mots clés

Mots clés contrôlés

Cellulose -- Biodégradation

Bactéries sulfato-réductrices

Hydrogène

Méthanogènes

Panse -- Microbiologie

Résumé

L'hydrogene est un intermediaire important de la degradation microbienne anaerobie de la matiere organique. Dans les ecosystemes digestifs, l'hydrogene produit par des microorganismes hydrolytiques et fermentaires peut etre potentiellement reutilise par trois groupes microbiens majeurs: les archa methanogenes, les bacteries sulfato-reductrices et les bacteries acetogenes. Nous avons compare le niveau de population de ces hydrogenotrophes dans divers ecosystemes digestifs, caracterise quelques souches et etudie les interactions entre ces microorganismes et ceux producteurs d'h#2. Les methanogenes representent la population hydrogenotrophe dominante dans la plupart des ecosystemes digestifs etudies. Les sulfato-reductrices sont toujours presentes quel que soit l'ecosysteme avec un niveau de population similaire. La flore acetogene, bien que premiere a s'etablir dans le rumen, est presente en plus grand nombre chez les non-ruminants. Les acetogenes, mixotrophes, sont capables d'utiliser un plus grand nombre de substrat que les methanogenes mais l'affinite de ces dernieres pour l'hydrogene est plus elevee. Des cocultures in vitro ont montre que les acetogenes sont capables, comme les methanogenes d'influencer le metabolisme des producteurs d'h#2. Les sulfato-reductrices detournent egalement le metabolisme des producteurs d'h#2 bien que le sulfure produit soit toxique pour certains microbes. A l'aide d'agneaux gnotobiotiques, nous avons montre que les methanogenes peuvent, in vivo, augmenter l'activite metabolique des souches productrices d'h#2 et nous avons mis au point un modele exempt d'acetogenes pour etudier leur role in vivo