Structures d'oligonucleotides revelees par rmn homo et heteronucleaire

Oligonucleotides structures revealed by homo and heteronuclear nmr

• Auteur / Autrice : OLIVIER BORNET
• Direction : Gérard Lancelot
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1994
• Etablissement(s) : Orléans

Résumé

La determination de la structure et de la dynamique des macromolecules biologiques, proteines et acides nucleiques principalement, est indispensable a la comprehension de leur fonction et de leur mecanisme d'action, de la catalyse enzymatique a l'expression des genes ou a la reconnaissance moleculaire. Les techniques experimentales les mieux adaptees pour de telles etudes sont la resonance magnetique nucleaire (rmn) et la radiocristallographie des rayons x (rx). Ces deux techniques sont complementaires. Alors que la premiere methode s'applique aux molecules en solution et donne des informations sur les distances inter-atomiques, les angles diedres, et la dynamique interne de la molecule, les rx etudient la forme cristalline et donnent des informations sur la position des atomes dans l'espace. En combinant une de ces deux methodes avec les techniques de modelisation moleculaire, on est en mesure de determiner la conformation qu'adopte la molecule etudiee. Nous avons entrepris deux etudes structurales differentes. Elles ont consiste a determiner par rmn multi-impulsionnelles et par modelisation moleculaire les structures tridimensionnelles d'un oligonucleotide lie par covalence a une molecule de psoralene et d'une triple helice d'adn. Sous irradiation uv, le psoralene photo-reagit avec les thymines, liant ainsi les deux brins de la mini double helice d'adn. L'etude par rmn 2d et 3d du duplex photoponte par le psoralene nous a permis de reveler une structure particuliere. Les caracteristiques structurales d'une triple helice ont pu etre obtenus par rmn heteronucleaire. Le marquage isotopique au 13c permet en effet d'augmenter la taille limite des macromolecules biologiques etudiables par rmn et d'aborder des structures reputees difficiles comme les triples helices