Séquences génétiques et évolution moléculaire des végétaux : contribution à l'étude de l'endosymbiose, de l'usage du code génétique et des modalités de l'évolution moléculaire

(contribution to the study of endosymbiosis, codon usage and modalities of molecular evolution)

• Auteur / Autrice : Mustapha Boudraa
• Direction : Richard Grantham
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences
• Date : Soutenance en 1990
• Etablissement(s) : Lyon 1
• Jury : Président / Présidente : Richard Grantham

Mots clés

Mots clés contrôlés

Génétique végétale

Séquence nucléotidique

Endosymbiose

Évolution moléculaire

Code génétique

Résumé

Le presente travail montre la coexistence dans la meme cellule de deux strategies de codage diffrentes, l'une nucleaire et l'autre chloroplastique. En nous referant a la theorie endosymbiotique de l'evolution, nous avons compare les genomes chloroplastiques et bacteriens. Bien que plusieurs donnees de la biologie molecuaire rapprochent ces genomes, ils different par leur usage du code genetique. Parmi les genes hautement exprimes, seuls, le schema bacterien presente par gouy et gautier (82). Ces differences ne doivent pas etre interpretees comme un argument contre l'hypothese de l'endosymbiose, mais plutot comme le resltat de l'accumulatin de plusieurs changements au cours de l'evolution. Nous avons tente de retracer l'histoire evolutive dela rbcl par une etude phylogenetique. Nous disposons, dans des especes differentes, de 11 genes codant par le rbcl. Trois de ces genes sont issus de genomes bacteriens et les autres des genomes chloroplastiques. Les distances genetiques entre les especes ont ete calculees en utilisant le modele de kimura (81). L'arbre phylogenetique obtenu reste en accord avec nos connaissances actuelles sur l'ordre d'apparition des especes etudiees. L'analyse du pourcentage de g+c en position iii des codons quartets, montre un changement radical dans l'usage du code entre les bacteries et les chloroplastes, ceci suppose une certaine directionalite dans les mutations, hypothese en desaccord avec la theorie neutraliste de l'evolution. Nos resultats contredisent une deuxieme hypothese de cette ecole, a savoir la constance de la vitesse d'evolution moleculaire. Nous nous sommes interesse aux dinucleotides et plus particulierement aux cpg et tpa, du fait de leur rarete tres frappante dans les sequences. Bird (80) attribue la rarete du premier au phenomene de la methylation, et certains aueurs expliquent le deuxieme par l'absence des terminateurs dans les cadres de lec