@PHDTHESIS{menou2014,
url = "http://www.theses.fr/2014AIXM4008",
title = "Maintien des prophages dans les génomes d' entérobactéries",
author = "Menouni, Rachid",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ansaldi, Mireille Microbiologie Aix-Marseille 2014",
note = "2014AIXM4008",
}

@PHDTHESIS{cornu2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SACLA020",
title = "Impact des phages tempérés sur la stabilité du microbiote intestinal : la lysogénie n'est pas un long fleuve tranquille",
author = "Cornuault, Jeffrey",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Petit, Marie-Agnès Microbiologie Université Paris-Saclay (ComUE) 2018",
note = "2018SACLA020",
url = "http://www.theses.fr/2018SACLA020/document",
}

@PHDTHESIS{lemir2006,
url = "http://www.theses.fr/2006PA112321",
title = "Les prophages de Salmonella Thyphimurium : régulation lysogénique et contribution à la pathogénicité",
author = "Lemire, Sébastien",
year = "2006",
pages = "1 vol. (139 p.)",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bossi, Lionello Sciences biologiques  Paris 11 2006",
note = "2006PA112321",
}

@PHDTHESIS{moume2009,
url = "http://www.theses.fr/2009AIX30009",
title = "Génomique comparative et analyse in silico des prophages dans le groupe Bacillus cereus",
author = "Moumen, Bouziane",
year = "2009",
pages = "1 vol. (224-30 f.)",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Nguyen-The, Christophe Biochimie. Nutrition, aspects moléculaires et cellulaires Aix-Marseille 3 2009",
note = "2009AIX30009",
}

@PHDTHESIS{delan2016,
url = "http://www.theses.fr/2016AIXM4107",
title = "Rôle des facteurs de l’hôte dans le maintien des prophages chez les entérobactéries",
author = "Delannoy, Maëlle",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ansaldi, Mireille Microbiologie Aix-Marseille 2016",
note = "2016AIXM4107",
}

@PHDTHESIS{morea1996,
url = "http://www.theses.fr/1996REN10023",
title = "Isolement de prophages de corynebacterium glutamicum : caracterisation genetique des fonctions integratives phagiques",
author = "MOREAU, SYLVIE",
year = "1996",
pages = "75 P.",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Trautwetter, Annie Sciences biologiques Rennes 1 1996",
note = "1996REN10023",
}

@PHDTHESIS{cande2004,
url = "http://www.theses.fr/2004PA112128",
title = "Caractérisation des opérons ARN ribosomiques et des prophages comme facteurs potentiels de la plasticité génomique chez Bacillus cereus",
author = "Candelon, Benjamin",
year = "2004",
pages = "Pagination multiple, environ 190 f.",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ehrlich, Stanislav Dusko Sciences biologiques. Microbiologie Paris 11 2004",
note = "2004PA112128",
}

@PHDTHESIS{bobay2014,
url = "http://www.theses.fr/2014PA066154",
title = "L'évolution des phages tempérés d'entérobactéries",
author = "Bobay, Louis-Marie",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pimentel Cachapuz Rocha, Eduardo et Touchon, Marie Biologie Paris 6 2014",
note = "2014PA066154",
}

@PHDTHESIS{schie2018,
url = "http://www.theses.fr/2018USPCC278",
title = "Rôle des phages dans l'évolution des leptospires",
author = "Schiettekatte, Olivier",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bourhy, Pascale Sciences de la vie et de la santé. Microbiologie Sorbonne Paris Cité 2018",
note = "2018USPCC278",
}

@PHDTHESIS{clavi2019,
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0465",
title = "Adaptation de la thérapie phagique contre Xylella fastidiosa",
author = "Clavijo-Coppens, Degly Fernando",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ansaldi, Mireille et Jacques, Marie-Agnès Microbiologie Aix-Marseille 2019",
note = "2019AIXM0465",
}

@PHDTHESIS{denay1994,
url = "http://www.theses.fr/1994BOR20289",
title = "Génétique de la fermentation malolactique : Caractérisation génétique et essais d'électrotransformation de Leuconostoc œnos : Clonage, séquençage et étude du gène de l'enzyme malolactique de Lactococcus lactis",
author = "Denayrolles, Muriel",
year = "1994",
pages = "1 vol. (184 f.)",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Lonvaud, Aline Sciences biologiques et médicales. Œnologie-ampélologie Bordeaux 2 1994",
note = "1994BOR20289",
}

@PHDTHESIS{jaoma2014,
url = "http://www.theses.fr/2014BORD0394",
title = "Diversité des bactériophages infectant la bactérie lactique Oenococcus oeni, responsable de la fermentation malolactique des vins",
author = "Jaomanjaka, Fety",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Marrec, Claire Oenologie Bordeaux 2014",
note = "2014BORD0394",
url = "http://www.theses.fr/2014BORD0394/document",
}

@PHDTHESIS{argem2017,
url = "http://www.theses.fr/2017STRAJ024",
title = "Etude de la virulence de Staphylococcus lugdunensis",
author = "Argemi, Xavier",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Hansmann, Yves Bactériologie médicale Strasbourg 2017",
note = "2017STRAJ024",
url = "http://www.theses.fr/2017STRAJ024/document",
}

@PHDTHESIS{mouni2013,
url = "http://www.theses.fr/2013PAUU3017",
title = "Caractérisation fonctionnelle de gènes de Marinobacter hydrocarbonoclasticus lors du développement de biofilms sur composés organiques hydrophobes",
author = "Mounier, Julie",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Grimaud, Régis et Sivadon, Pierre Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Pau 2013",
note = "2013PAUU3017",
url = "http://www.theses.fr/2013PAUU3017/document",
}

@PHDTHESIS{zairi2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SACLS140",
title = "GP12 : a collagen-like protein that binds to the SPP1 capsid",
author = "Zairi, Mohamed",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Tavares, Paulo Biochimie et biologie structurale Université Paris-Saclay (ComUE) 2019",
note = "2019SACLS140",
url = "http://www.theses.fr/2019SACLS140/document",
}

@PHDTHESIS{panis2010,
url = "http://www.theses.fr/2010AIX22089",
title = "Caractérisation du module de recombinaison spécifique de site du prophage KplE1 d'Escherichia coli : de l'assemblage de l'intasome à la régulation des gènes",
author = "Panis, Gaël",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ansaldi, Mireille et Méjean, Vincent Microbiologie, biologie végétale et biotechnologies Aix-Marseille 2 2010",
note = "2010AIX22089",
}

@PHDTHESIS{lelam2015,
url = "http://www.theses.fr/2015PA112216",
title = "Regulatory RNAs in Staphylococcus aureus : Function and Mechanism",
author = "Le Lam, Thao Nguyen",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bouloc, Philippe Microbiologie Paris 11 2015",
note = "2015PA112216",
url = "http://www.theses.fr/2015PA112216/document",
}

@PHDTHESIS{sassi2013,
url = "http://www.theses.fr/2013AIXM5041",
title = "La diversité des espèces du groupe Mycobacterium abscessus et leurs mycobactériophages",
author = "Sassi, Mohamed",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Drancourt, Michel et Cambillau, Christian Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2013",
note = "2013AIXM5041",
url = "http://www.theses.fr/2013AIXM5041/document",
}

@PHDTHESIS{maiko2019,
url = "http://www.theses.fr/2019UNIP7091",
title = "The CRISPR-Cas system of human pathogen Clostridium difficile : function and regulation",
author = "Maikova, Anna",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Soutourina, Olga et Severinov, Konstantin Sciences de la vie et de la santé Université de Paris (2019-....) 2019",
note = "Thèse de doctorat Sciences de la vie et de la santé Skolkovo Institute of Science and Technology (Moscou) 2019",
note = "2019UNIP7091",
url = "http://www.theses.fr/2019UNIP7091/document",
}

@PHDTHESIS{regul2012,
url = "http://www.theses.fr/2012PA112313",
title = "Influence of peptidoglycan metabolism on  immunomodulatory properties of Lactobacillus casei",
author = "Regulski, Krzysztof",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Chapot-Chartier, Marie-Pierre Biologie Paris 11 2012",
note = "2012PA112313",
}

@PHDTHESIS{bernh2017,
url = "http://www.theses.fr/2017USPCB070",
title = "The distribution of CRISPR-Cas systems is affected by interactions with DNA repair pathways",
author = "Bernheim, Aude",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pimentel Cachapuz Rocha, Eduardo et Bikard, David Microbiologie Sorbonne Paris Cité 2017",
note = "2017USPCB070",
url = "http://www.theses.fr/2017USPCB070/document",
}

@PHDTHESIS{domel2009,
url = "http://www.theses.fr/2009TOUR3137",
title = "Etude des phages de streptococcus agalactiae en lien avec l'origine anatomique, la phylogénie et les propriétés métaboliques des isolats",
author = "Domelier, Anne-Sophie",
year = "2009",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Quentin, Roland Sciences de la Vie et de la Santé Tours 2009",
note = "2009TOUR3137",
url = "http://www.theses.fr/2009TOUR3137/document",
}

@PHDTHESIS{phili2017,
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0936",
title = "Bactériophages infectant la bactérie lactique Oenococcus oeni : diversité et rôles dans l'écosystème oenologique",
author = "Philippe, Cécile",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Marrec, Claire et Cluzet, Stéphanie Oenologie Bordeaux 2017",
note = "2017BORD0936",
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0936/document",
}

@PHDTHESIS{humie2020,
url = "http://www.theses.fr/2020UNIP7014",
title = "Impact des antibiotiques sur le phageome intestinal humain : de la méthode à l’application",
author = "Humières, Camille d'",
year = "2020",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Denamur, Erick et Pimentel Cachapuz Rocha, Eduardo Sciences. Génétique Université de Paris (2019-....) 2020",
note = "2020UNIP7014",
url = "http://www.theses.fr/2020UNIP7014/document",
}

@PHDTHESIS{sallo2010,
url = "http://www.theses.fr/2010TOUR3144",
title = "Les infections à "Streptococus agalactiae" chez l'adulte : emergence et impact de la lysogénie.",
author = "Salloum, Mazen",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Quentin, Roland Sciences de la Vie et de la Santé Tours 2010",
note = "2010TOUR3144",
url = "http://www.theses.fr/2010TOUR3144/document",
}

@PHDTHESIS{coluz2017,
url = "http://www.theses.fr/2017LORR0352",
title = "L'exploration des génomes par l'outil ICEFinder révèle la forte prévalence et l'extrême diversité des ICE et des IME de streptocoques",
author = "Coluzzi, Charles",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Leblond-Bourget, Nathalie et Guedon, Gérard Écotoxicologie, biodiversité, écosystèmes Université de Lorraine 2017",
note = "2017LORR0352",
url = "http://www.theses.fr/2017LORR0352/document",
}

@PHDTHESIS{midon2016,
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS314",
title = "Mécanisme d'intégration du phage TLC dans le génome de Vibrio cholerae",
author = "Midonet, Caroline",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Barre, François-Xavier Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2016",
note = "2016SACLS314",
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS314/document",
}

@PHDTHESIS{Cury2017,
url = "http://www.theses.fr/2017USPCB062",
title = "Evolutionary genomics of conjugative elements and integrons",
author = "Cury, Jean",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pimentel Cachapuz Rocha, Eduardo Bioinformatique, biologie structurale et génomique Sorbonne Paris Cité 2017",
note = "2017USPCB062",
url = "http://www.theses.fr/2017USPCB062/document",
}

@PHDTHESIS{essoh2013,
url = "http://www.theses.fr/2013PA112072",
title = "Étude épidémiologique de souches de Pseudomonas aeruginosa responsables d’infections et de leurs bactériophages pour une approche thérapeutique",
author = "Essoh, Christiane you",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pourcel, Christine Biologie Paris 11 2013",
note = "Thèse de doctorat Biologie Université de Cocody (Abidjan, Côte d'Ivoire) 2013",
note = "2013PA112072",
url = "http://www.theses.fr/2013PA112072/document",
}

@PHDTHESIS{puymè2013,
url = "http://www.theses.fr/2013LORR0147",
title = "Diversité, dynamique et mobilité des éléments intégratifs conjugatifs (ICE) de Streptococcus agalactiae intégrés dans l'extrémité 3' du gène codant un ARNt Lysine",
author = "Puymège, Aurore",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Payot-Lacroix, Sophie et Guedon, Gérard Procédés biotechnologiques et alimentaires Université de Lorraine 2013",
note = "2013LORR0147",
url = "http://www.theses.fr/2013LORR0147/document",
}

@PHDTHESIS{carra2011,
url = "http://www.theses.fr/2011NAN10080",
title = "Analyse comparative de la dynamique de deux éléments intégratifs conjugatifs de streptococcus thermophilus",
author = "Carraro, Nicolas",
year = "2011",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Guedon, Gérard Sciences de la Vie et de la Santé Nancy 1 2011",
note = "2011NAN10080",
url = "http://www.theses.fr/2011NAN10080/document",
}

@PHDTHESIS{parik2013,
url = "http://www.theses.fr/2013BRES0066",
title = "Exploration des communautés virales thermophiles dans les écosystèmes chauds des terres australes et antarctiques françaises",
author = "Parikka, Kaarle Joonas",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Romancer, Marc Microbiologie Brest 2013",
note = "2013BRES0066",
url = "http://www.theses.fr/2013BRES0066/document",
}

@PHDTHESIS{bella2009,
url = "http://www.theses.fr/2009NAN10125",
title = "Transfert, accrétion et mobilisation des éléments intégratifs conjugatifs et des îlots génomiques apparentés de "Streptococcus termophilus" : Un mécanisme clef de l'évolution bactérienne ?",
author = "Bellanger, Xavier",
year = "2009",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Decaris, Bernard Génomique Nancy 1 2009",
note = "2009NAN10125",
url = "http://www.theses.fr/2009NAN10125/document",
}

@PHDTHESIS{Lee2020,
url = "http://www.theses.fr/2020LYSEC020",
title = "Virus-host interactions across a soil pH gradient at the community and individual scale",
author = "Lee, Sungeun",
year = "2020",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Nicol, Graeme W. et Emerson, Joanne Ingénierie pour le vivant Lyon 2020",
note = "2020LYSEC020",
url = "http://www.theses.fr/2020LYSEC020/document",
}

@PHDTHESIS{raesi2014,
url = "http://www.theses.fr/2014GRENV070",
title = "Plasticité du génome au cours d'une expérience d'évolution au long terme chez Escherichia Coli",
author = "Raeside, Colin",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Schneider, Dominique et Gaffé, Joël Virologie microbiologie immunologie Grenoble 2014",
note = "2014GRENV070",
url = "http://www.theses.fr/2014GRENV070/document",
}

@PHDTHESIS{cheva2017,
url = "http://www.theses.fr/2017USPCC162",
title = "Comprehensive study of new virulent bacteriophages : from transcriptomic and mechanistic characterisations towards evolutionary perspectives",
author = "Chevallereau, Anne",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Debarbieux, Laurent Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie. Microbiologie procaryote et eucaryote Sorbonne Paris Cité 2017",
note = "2017USPCC162",
url = "http://www.theses.fr/2017USPCC162/document",
}

@PHDTHESIS{ratov2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS527",
title = "Etudes descriptive, épidémiologique, moléculaire et spatiale des souches Mycobacterium tuberculosis circulant à Antananarivo, Madagascar",
author = "Ratovonirina, Noël Harijaona",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Sola, Christophe et Rasolofo, Voahangy Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "Thèse de doctorat Sciences de la vie et de la santé Université d'Antananarivo 2017",
note = "2017SACLS527",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS527/document",
}

@PHDTHESIS{mlaga2017,
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0594",
title = "Real-time genomics to decipher atypical bacteria in clinical microbiology",
author = "Mlaga, Kodjovi Dodji",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Rolain, Jean-Marc Biologie. Génomique et bioinformatique Aix-Marseille 2017",
note = "2017AIXM0594",
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0594/document",
}

@PHDTHESIS{Piel2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS462",
title = "Évolution de la virulence de V. crassostreae en lien avec l’huître en tant qu’hôte et les phages en tant que prédateurs",
author = "Piel, Damien",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Roux, Frédérique Microbiologie Sorbonne université 2019",
note = "2019SORUS462",
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS462/document",
}

@PHDTHESIS{meneg2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLA030",
title = "Study of the cryopreservation-related stresses in the lactic acid bacterium Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus through a global and multi-scale approach",
author = "Meneghel, Julie",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fonseca, Fernanda Irene et Dumas, Paul Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "2017SACLA030",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLA030/document",
}

@PHDTHESIS{saneu2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS071",
title = "Development of a functional screen for MreB mutants in Bacillus subtilis and characterization of a putative MreB effector",
author = "San Eustaquio Campillo, Alba de",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Chastanet, Arnaud Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "2017SACLS071",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS071/document",
}

@PHDTHESIS{riffa2019,
url = "http://www.theses.fr/2019REN1B021",
title = "Etude fonctionnelle et régulations croisées de systèmes toxine-antitoxine de type I exprimés par Staphylococcus aureus",
author = "Riffaud, Camille",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Felden, Brice et Pinel-Marie, Marie-Laure Biochimie, biologie moléculaire et cellulaire Rennes 1 2019",
note = "2019REN1B021",
url = "http://www.theses.fr/2019REN1B021/document",
}

@PHDTHESIS{latin2016,
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS274",
title = "Pseudolysogeny and sequential mutations build multiresistance to virulent bacteriophages in Pseudomonas aeruginosa",
author = "Latino, Libera",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Vergnaud, Gilles et Pourcel, Christine Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2016",
note = "2016SACLS274",
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS274/document",
}

@PHDTHESIS{gaboy2014,
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0082",
title = "Potentiels physiologiques et métaboliques de communautés microbiennes de sédiments de subsurface : approches culturale, génomique et métagénomique",
author = "Gaboyer, Frédéric",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Romancer, Marc et Alain, Karine Microbiologie Brest 2014",
note = "2014BRES0082",
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0082/document",
}

@PHDTHESIS{dahma2017,
url = "http://www.theses.fr/2017LORR0269",
title = "Caractérisation des éléments intégratifs conjugatifs de la famille ICESt3 et des facteurs influençant leur mobilité",
author = "Dahmane, Narimane",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Payot-Lacroix, Sophie et Guedon, Eric Écotoxicologie, biodiversité, écosystèmes Université de Lorraine 2017",
note = "2017LORR0269",
url = "http://www.theses.fr/2017LORR0269/document",
}

@PHDTHESIS{bonne2018,
url = "http://www.theses.fr/2018MONTG053",
title = "Bases génétiques et mécanismes cytologiques à l'origine de la diversité de l'incompatibilité cytoplasmique induite par Wolbachia chez le moustique Culex pipiens",
author = "Bonneau, Manon",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Sicard, Mathieu et Weill, Mylène Evolution des systèmes infectieux Montpellier 2018",
note = "2018MONTG053",
url = "http://www.theses.fr/2018MONTG053/document",
}

@PHDTHESIS{lebeu2018,
url = "http://www.theses.fr/2018NORMR081",
title = "Analyse comparative de génomes complets de souches pathogènes et de portage de Staphylococcus lugdunensis et caractérisation du système de sécrétion Ess/type VII",
author = "Lebeurre, Jérémie",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pestel-Caron, Martine Aspects moleculaires et cellulaires de la biologie Normandie 2018",
note = "2018NORMR081",
url = "http://www.theses.fr/2018NORMR081/document",
}

@PHDTHESIS{trand2018,
url = "http://www.theses.fr/2018IAVF0001",
title = "Génomique épidémiologique de Salmonella",
author = "Tran Dien, Alicia",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Weill, François-Xavier Sciences de la vie et de la santé Paris, Institut agronomique, vétérinaire et forestier de France 2018",
note = "2018IAVF0001",
url = "http://www.theses.fr/2018IAVF0001/document",
}

@PHDTHESIS{meygr2019,
url = "http://www.theses.fr/2019BORD0177",
title = "Caractérisation d'éléments conjugatifs intégratifs (ICE) chez Mycoplasma hominis",
author = "Meygret, Alexandra",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pereyre, Sabine Microbiologie -immunologie Bordeaux 2019",
note = "2019BORD0177",
url = "http://www.theses.fr/2019BORD0177/document",
}

@PHDTHESIS{sangu2015,
url = "http://www.theses.fr/2015ECDL0033",
title = "Exploration des interactions virus-hôte et leur importance pour l'adaptation microbienne à travers du CRISPRs",
author = "Sanguino Casado, Laura",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Vogel, Timothy et Larose, Catherine Microbiologie environnementale Ecully, Ecole centrale de Lyon 2015",
note = "2015ECDL0033",
url = "http://www.theses.fr/2015ECDL0033/document",
}

@PHDTHESIS{wouds2016,
url = "http://www.theses.fr/2016PESC1020",
title = "Clostridium botulinum, du génotypage de la toxine en passant par les flagellines jusqu'au séquençage de génomes : un aperçu de la diversité génétique des Clostridies associés au botulisme animal et humain",
author = "Woudstra, Cedric",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fach, Patrick Sciences de la vie et de la santé Paris Est 2016",
note = "2016PESC1020",
url = "http://www.theses.fr/2016PESC1020/document",
}

@PHDTHESIS{plain2013,
url = "http://www.theses.fr/2013PA05T034",
title = "Etude de la biodiversité des souches de Streptococcus pyogenes responsables d'infections invasives et de cas groupés par une approche de génomique comparative",
author = "Plainvert, Céline",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fouet, Agnès et Poyart, Claire Microbiologie Paris 5 2013",
note = "2013PA05T034",
}

@PHDTHESIS{baudr2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS026",
title = "Investigating chromosome dynamics through Hi-C assembly",
author = "Baudry, Lyam",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Koszul, Romain Bio-informatique Sorbonne université 2019",
note = "2019SORUS026",
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS026/document",
}

@PHDTHESIS{medve2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS538",
title = "Natural Diversity of CRISPR Spacers",
author = "Medvedeva, Sofia",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Krupovic, Mart et Severinov, Konstantin Microbiologie Sorbonne université 2019",
note = "Thèse de doctorat Microbiologie Skolkovo Institute of Science and Technology (Moscou) 2019",
note = "2019SORUS538",
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS538/document",
}

@PHDTHESIS{Diop2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0276",
title = "Analyse des séquences des génomes bactériens en tant que source d'information taxonomique",
author = "Diop, Awa",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fournier, Pierre-Edouard Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0276",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0276/document",
}

@PHDTHESIS{tsarm2017,
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0787",
title = "Ingénierie de génome de bactéries minimales par des outils CRISPR/Cas9",
author = "Tsarmpopoulos, Iason",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Sirand-Pugnet, Pascal Microbiologie - immunologie Bordeaux 2017",
note = "2017BORD0787",
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0787/document",
}

@PHDTHESIS{mbogn2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0693",
title = "Exploration du microbiote respiratoire humain",
author = "Mbogning Fonkou, Maxime Descartes",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0693",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0693/document",
}

@PHDTHESIS{mauro2017,
url = "http://www.theses.fr/2017REN1B005",
title = "Etude de la régulation transcriptionnelle de deux ARN régulateurs de Staphylococcus aureus : implication d'un facteur de transcription de la famille SarA",
author = "Mauro, Tony",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Felden, Brice et Rouillon, Astrid Biologie et sciences de la santé Rennes 1 2017",
note = "2017REN1B005",
url = "http://www.theses.fr/2017REN1B005/document",
}

@PHDTHESIS{Jain2017,
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0184",
title = "Comparative genomic study for identifying gene acquisitions in Megavirales",
author = "Jain, Sourabh",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pontarotti, Pierre et Raoult, Didier Biologie.Génomique et bioinformatique Aix-Marseille 2017",
note = "2017AIXM0184",
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0184/document",
}

@PHDTHESIS{Togo2019,
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0237",
title = "Evaluation du microbiote du lait maternel",
author = "Togo, Amadou Hamidou",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Maladies infectieuses Aix-Marseille 2019",
note = "2019AIXM0237",
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0237/document",
}

@PHDTHESIS{iskan2015,
url = "http://www.theses.fr/2015LORR0245",
title = "Analyse par génomique comparée de Carnobacterium maltaromaticum : étude de la diversité et de l’adaptation à différents environnements",
author = "Iskandar, Christelle",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Junelles, Anne-Marie et Cailliez-Grimal, Catherine Procédés biotechnologiques et alimentaires Université de Lorraine 2015",
note = "2015LORR0245",
url = "http://www.theses.fr/2015LORR0245/document",
}

@PHDTHESIS{bihan2015,
url = "http://www.theses.fr/2015LYO10316",
title = "Caractérisation de nouveaux variants des fimbriae F17 et association à la virulence chez des souches pathogènes d’Escherichia coli isolées chez le veau",
author = "Bihannic, Morgan",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Madec, Jean-Yves et Oswald, Eric Microbiologie Lyon 1 2015",
note = "2015LYO10316",
url = "http://www.theses.fr/2015LYO10316/document",
}

@PHDTHESIS{aboua2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0256",
title = "La génomique : un outil robuste et émergent utilisé dans la taxonomie bactérienne et l'analyse comparative",
author = "Abou Abdallah, Rita",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fournier, Pierre-Edouard Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0256",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0256/document",
}

@PHDTHESIS{bouzi2017,
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0548",
title = "La Canettose, une maladie infectieuse émergente dans la corne de l'Afrique",
author = "Bouzid, Feriel",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Drancourt, Michel et Canaan, Stéphane Biologie. Microbiologie Aix-Marseille 2017",
note = "2017AIXM0548",
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0548/document",
}

@PHDTHESIS{masso2018,
url = "http://www.theses.fr/2018USPCC328",
title = "Etude de la dynamique temporelle du microbiote digestif des bovins domestiques pour la compréhension du potage de clones d'Escherichia coli pathogènes et résistants aux antibiotiques",
author = "Massot, Méril",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Denamur, Erick et Mentré, France Sciences de la vie et de la santé Sorbonne Paris Cité 2018",
note = "2018USPCC328",
url = "http://www.theses.fr/2018USPCC328/document",
}

@PHDTHESIS{garde2019,
url = "http://www.theses.fr/2019CLFAC075",
title = "Virulence des Escherichia coli entérohémmoragiques : rôle central du monoxyde d'azote dans le devenir de l'infection et identification de nouveaux déterminants impliqués dans l'adaptation du pathogène à l'envirronement digestif",
author = "Gardette, Marion",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Jubelin, Grégory Génétique et Physiologie Université Clermont Auvergne‎ (2017-2020) 2019",
note = "2019CLFAC075",
url = "http://www.theses.fr/2019CLFAC075/document",
}

@PHDTHESIS{dimit2014,
url = "http://www.theses.fr/2014PA05T005",
title = "The coevolution of gene mobility and sociality in bacteria",
author = "Dimitriu, Tatiana",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Taddei, François Biologie Paris 5 2014",
note = "2014PA05T005",
}

@PHDTHESIS{rédo2014,
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0095",
title = "Communautés fongiques de sédiments marins de subsurface : diversité, origine et rôle écologique",
author = "Rédou, Vanessa",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Barbier, Georges Microbiologie Brest 2014",
note = "2014BRES0095",
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0095/document",
}

@PHDTHESIS{chuze2012,
url = "http://www.theses.fr/2012LORR0261",
title = "Caractérisation des fonctions codées par les éléments intégratifs conjugatifs (ICE) intégrés dans un gène codant un ARNt lysine chez Streptococcus agalactiae : rôle dans le maintien des ICE, l'adaptation et la virulence de l'hôte",
author = "Chuzeville, Sarah",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Payot-Lacroix, Sophie et Madec, Jean-Yves Procédés biotechnologiques et alimentaires Université de Lorraine 2012",
note = "2012LORR0261",
url = "http://www.theses.fr/2012LORR0261/document",
}

@PHDTHESIS{losso2014,
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0058",
title = "Découverte et caractérisation des premiers virus de Thermotogales (bactéries thermophiles et anaérobies) issus de sources hydrothermales océaniques profondes",
author = "Lossouarn, Julien",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Jebbar, Mohamed et Geslin, Claire Microbiologie Brest 2014",
note = "2014BRES0058",
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0058/document",
}

@PHDTHESIS{schmi2017,
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0649",
title = "Développement de modèles spécifiques aux séquences génomique virales",
author = "Schmitt, Louise-Amelie",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Blin, Guillaume Informatique Bordeaux 2017",
note = "2017BORD0649",
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0649/document",
}

@PHDTHESIS{maler2018,
url = "http://www.theses.fr/2018USPCB059",
title = "The immunomodulatory role of epidermal hepcidin in infectious condition",
author = "Malerba, Mariangela",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Peyssonnaux, Carole Physiopathologie Sorbonne Paris Cité 2018",
note = "2018USPCB059",
url = "http://www.theses.fr/2018USPCB059/document",
}

@PHDTHESIS{miser2021,
url = "http://www.theses.fr/2021NORMC209",
title = "Etude des écosystèmes microbiens cidricoles : quel impact sur la qualité organoleptique ?",
author = "Misery, Boris",
year = "2021",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Laplace, Jean-Marie Sciences agronomiques, biotechnologies agro-alimentaires Normandie 2021",
note = "2021NORMC209",
url = "http://www.theses.fr/2021NORMC209/document",
}

@PHDTHESIS{merci2016,
url = "http://www.theses.fr/2016BRES0125",
title = "De nouveaux systèmes hôtes-virus associés aux sources hydrothermales océaniques profondes",
author = "Mercier, Coraline",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Jebbar, Mohamed Microbiologie Brest 2016",
note = "2016BRES0125",
url = "http://www.theses.fr/2016BRES0125/document",
}

@PHDTHESIS{gayet2018,
url = "http://www.theses.fr/2018LYSES015",
title = "Impact de la réponse IgA dans une nouvelle stratégie de vaccination muqueuse contre Salmonella et dans la régulation de la réponse adaptative",
author = "Gayet, Rémi",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Paul, Stéphane et Corthésy, Blaise Sciences de la vie et de la sante Lyon 2018",
note = "2018LYSES015",
url = "http://www.theses.fr/2018LYSES015/document",
}

@PHDTHESIS{bilen2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0177",
title = "Description of the human gut microbiota by culturomics",
author = "Bilen, Melhem",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier et Daoud, Ziad Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0177",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0177/document",
}

@PHDTHESIS{guilh2017,
url = "http://www.theses.fr/2017CLFAS015",
title = "Caractérisations transcriptionnelle et phénotypique de bactéries dispersées de biofilm à Klebsiella pneumoniae",
author = "Guilhen, Cyril",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Balestrino, Damien Sciences de la vie et de la sante Université Clermont Auvergne‎ (2017-2020) 2017",
note = "2017CLFAS015",
url = "http://www.theses.fr/2017CLFAS015/document",
}

@PHDTHESIS{campb2015,
url = "http://www.theses.fr/2015BORD0311",
title = "Phylogenomic Structure of Oenococcus oeni and its Adaptation to Different Products Unveiled by Comparative Genomics and Metabolomics.",
author = "Campbell-Sills, Hugo",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Lucas, Patrick et Spano, Giuseppe Oenologie Bordeaux 2015",
note = "Thèse de doctorat Oenologie Università degli studi di Foggia (Foggia, Italie) 2015",
note = "2015BORD0311",
url = "http://www.theses.fr/2015BORD0311/document",
}

@PHDTHESIS{brons2019,
url = "http://www.theses.fr/2019REN1B014",
title = "Identification et caractérisation de nouveaux ARN régulateurs chez Staphylococcus aureus : mise en évidence d’un regroupement de 5 transcrits",
author = "Bronsard, Julie",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Augagneur, Yoann et Felden, Brice Biochimie, biologie moléculaire et cellulaire Rennes 1 2019",
note = "2019REN1B014",
url = "http://www.theses.fr/2019REN1B014/document",
}

@PHDTHESIS{rayna2020,
url = "http://www.theses.fr/2020REN1B011",
title = "Etude fonctionnelle et cibles d'un ARN régulateur exprimé par le pathogène humain Staphylococcus aureus et impliqué dans l'internalisation des bactéries par les cellules humaines",
author = "Raynaud, Simon",
year = "2020",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Felden, Brice et Le Pabic, Hélène Biologie moléculaire et structurale, biochimie Rennes 1 2020",
note = "2020REN1B011",
url = "http://www.theses.fr/2020REN1B011/document",
}

@PHDTHESIS{miszc2013,
url = "http://www.theses.fr/2013CLF22349",
title = "Croissance et survie des Escherichia Coli producteurs de Shiga Toxines (STEC) en fonction des technologies fromagères mettant en oeuvre du lait cru",
author = "Miszczycha, Stéphane Dimitri",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Montel, Marie-Christine et Thévenot-Sergentet, Delphine Physiologie et Génétique Moléculaires Clermont-Ferrand 2 2013",
note = "2013CLF22349",
url = "http://www.theses.fr/2013CLF22349/document",
}

@PHDTHESIS{vigli2017,
url = "http://www.theses.fr/2017MNHN0011",
title = "Etude de l'impact d'un changement de régime alimentaire sur le microbiome intestinal de Podarcis sicula",
author = "Vigliotti, Chloé",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bapteste, ÉricHerrel, Anthony et Lopez, Philippe Sciences de la vie et de la santé Paris, Muséum national d'histoire naturelle 2017",
note = "2017MNHN0011",
url = "http://www.theses.fr/2017MNHN0011/document",
}

@PHDTHESIS{thiro2019,
url = "http://www.theses.fr/2019BRES0096",
title = "Etudes des interactions entre virus et hôtes archéens hydrothermaux hyperthermophiles",
author = "Thiroux, Sarah",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Geslin, Claire Microbiologie Brest 2019",
note = "2019BRES0096",
url = "http://www.theses.fr/2019BRES0096/document",
}

@PHDTHESIS{Seck2017,
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0608",
title = "Etude de la diversité des procaryotes halophiles du tube digestif par approche de culture",
author = "Seck, El Hadji",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2017",
note = "2017AIXM0608",
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0608/document",
}

@PHDTHESIS{demor2017,
url = "http://www.theses.fr/2017PA066167",
title = "Impact de la température sur le phytoplancton et ses interactions avec les virus",
author = "Demory, David",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bernard, OlivierRabouille, SophieSciandra, Antoine et Baudoux, Anne-Claire Océanographie Paris 6 2017",
note = "2017PA066167",
url = "http://www.theses.fr/2017PA066167/document",
}

@PHDTHESIS{masac2018,
url = "http://www.theses.fr/2018BORD0191",
title = "When mRNA folding rules gene expression : lessons from type I toxin-antitoxin systems",
author = "Masachis Gelo, Sara",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Darfeuille, Fabien Biochimie Bordeaux 2018",
note = "2018BORD0191",
url = "http://www.theses.fr/2018BORD0191/document",
}

@PHDTHESIS{gautr2020,
url = "http://www.theses.fr/2020UPASE001",
title = "Conceptualisation et exploitation d’un graphe de pangénome partitionné comme représentation compacte de la diversité du répertoire génique des espèces procaryotes",
author = "Gautreau, Guillaume",
year = "2020",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Médigue, Claudine et Vallenet, David Sciences de la vie et de la santé université Paris-Saclay 2020",
note = "2020UPASE001",
url = "http://www.theses.fr/2020UPASE001/document",
}

@PHDTHESIS{treep2017,
url = "http://www.theses.fr/2017UBFCD065",
title = "Bioinformatic analysis of the genomes of epidemic pseudomonas aeruginosa",
author = "Treepong, Panisa",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Guyeux, Christophe et Valot, Benoît Informatique Bourgogne Franche-Comté 2017",
note = "2017UBFCD065",
url = "http://www.theses.fr/2017UBFCD065/document",
}

@PHDTHESIS{Pham2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SACLA035",
title = "Analyses génomiques comparatives de souches de Brevibacterium et étude de leurs interactions biotiques avec Hafnia alvei dans un fromage modèle",
author = "Pham, Nguyen Phuong",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Monnet, Christophe Génie des procédés Université Paris-Saclay (ComUE) 2018",
note = "2018SACLA035",
url = "http://www.theses.fr/2018SACLA035/document",
}

@PHDTHESIS{vasse2015,
url = "http://www.theses.fr/2015MONTS041",
title = "Evolutionary ecology of social bacterial populations under antibiotic and bacteriophage pressure",
author = "Vasse, Marie",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Hochberg, Michael Ecologie, évolution, ressources génétiques, paléontologie Montpellier 2015",
note = "2015MONTS041",
url = "http://www.theses.fr/2015MONTS041/document",
}

@PHDTHESIS{dhall2018,
url = "http://www.theses.fr/2018LIL2S008",
title = "Etude du transcriptome primaire codant et non-codant de Bordetella pertussis, caractérisation de l'impact des séquences d'insertion",
author = "D'Halluin, Alexandre",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Hot, David Biochimie et biologie moléculaire Lille 2 2018",
note = "2018LIL2S008",
url = "http://www.theses.fr/2018LIL2S008/document",
}

@PHDTHESIS{Ma2019,
url = "http://www.theses.fr/2019BORD0134",
title = "Les viromes associés aux plantes sauvages : vers des stratégies de caractérisation optimisées et variabilité dans divers environnements",
author = "Ma, Yuxin",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Candresse, Thierry Biologie Végétale Bordeaux 2019",
note = "2019BORD0134",
url = "http://www.theses.fr/2019BORD0134/document",
}

@PHDTHESIS{plaza2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SACLV068",
title = "Reconstitution de pan-génomes microbiens par séquençage métagénomique aléatoire : Application à l’étude du microbiote intestinal humain",
author = "Plaza onate, Florian",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ehrlich, Stanislav Dusko et Magoulès, Frédéric Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2018",
note = "2018SACLV068",
url = "http://www.theses.fr/2018SACLV068/document",
}

@PHDTHESIS{afoud2019,
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0581",
title = "Microbiote ancien versus microbiote contemporain : analyses culturomics, métagénomique et comparaisons génomiques",
author = "Afouda, Pamela",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Microbiologie Aix-Marseille 2019",
note = "2019AIXM0581",
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0581/document",
}

@PHDTHESIS{macca2015,
url = "http://www.theses.fr/2015ECDL0021",
title = "L'écosystème neige, structure et fonctionnement des communautés microbiennes du manteau neigeux en Arctique",
author = "Maccario, Lorrie",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Vogel, Timothy et Larose, Catherine Ingéniérie du vivant Ecully, Ecole centrale de Lyon 2015",
note = "2015ECDL0021",
url = "http://www.theses.fr/2015ECDL0021/document",
}

@PHDTHESIS{arant2014,
url = "http://www.theses.fr/2014PAUU3032",
title = "Mécanismes moléculaires impliqués dans la formation de biofilm à l’interface eau-composés organiques hydrophobes",
author = "Arantxa, Camus Etchecopar",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Grimaud, Régis Biologie Pau 2014",
note = "2014PAUU3032",
url = "http://www.theses.fr/2014PAUU3032/document",
}

@PHDTHESIS{berry2019,
url = "http://www.theses.fr/2019GREAV015",
title = "Premiers mécanismes de régulation d'exlBA, le facteur de virulence des souches de Pseudomonas aeruginosa de type PA7",
author = "Berry, Alice",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Elsen, Sylvie Virologie microbiologie immunologie Université Grenoble Alpes (ComUE) 2019",
note = "2019GREAV015",
url = "http://www.theses.fr/2019GREAV015/document",
}

@PHDTHESIS{majed2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS107",
title = "Etude de Eps1 et Eps2, deux exopolysaccharides du biofilm chez Bacillus thuringiensis",
author = "Majed, Racha",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Gohar, Michel et Kallassy-Awad, Mireille Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "Thèse de doctorat Sciences de la vie et de la santé Université Saint-Joseph (Beyrouth). Faculté des Sciences 2017",
note = "2017SACLS107",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS107/document",
}

@PHDTHESIS{jameh2012,
url = "http://www.theses.fr/2012LORR0197",
title = "Systeme protéolytique de surface de "streptococcus thermophilus" : variabilité des capacités d'hydrolyse des caséines : caractérisation d'un nouveau système de transport de peptides",
author = "Jameh, Nawara",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Dary, Annie et Perrin, Clarisse Sciences Agronomiques Université de Lorraine 2012",
note = "2012LORR0197",
url = "http://www.theses.fr/2012LORR0197/document",
}

@PHDTHESIS{zimme2016,
url = "http://www.theses.fr/2016STRAJ113",
title = "Internalisation des leucotoxines de S. aureus dans les cellules cibles et conséquences cellulaires associées",
author = "Zimmermann-Meisse, Gaëlle",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Prévost, Gilles Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 2016",
note = "2016STRAJ113",
url = "http://www.theses.fr/2016STRAJ113/document",
}

@PHDTHESIS{velly2014,
url = "http://www.theses.fr/2014AGPT0050",
title = "Etude de l’évolution de l’état physiologique de L. lactis TOMSC161 au cours de la fermentation et de son incidence sur la résistance à la lyophilisation et au stockage",
author = "Velly, Helene",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bouix, Marielle Génie Microbiologique Paris, AgroParisTech 2014",
note = "2014AGPT0050",
url = "http://www.theses.fr/2014AGPT0050/document",
}

@PHDTHESIS{nadir2018,
url = "http://www.theses.fr/2018ORLE2033",
title = "Etude des mécanismes de reconnaissance du transcrit dans la terminaison de la transcription Rho-dépendante",
author = "Nadiras, Cédric",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Boudvillain, Marc Biologie Moléculaire et Cellulaire Orléans 2018",
note = "2018ORLE2033",
url = "http://www.theses.fr/2018ORLE2033/document",
}

@PHDTHESIS{gdour2019,
url = "http://www.theses.fr/2019NSARB324",
title = "Maitrise des risques de contamination des produits alimentaires tunisiens par le groupe Bacillus cereus",
author = "Gdoura épouse Ben Amor, Maroua",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Gautier, Michel et Gdoura, Maroua Biochimie, biologie moléculaire et cellulaire Rennes, Agrocampus Ouest 2019",
note = "Thèse de doctorat Biochimie, biologie moléculaire et cellulaire Université de Sfax. Faculté des sciences 2019",
note = "2019NSARB324",
url = "http://www.theses.fr/2019NSARB324/document",
}

@PHDTHESIS{mougi2020,
url = "http://www.theses.fr/2020DUNK0569",
title = "Approches microbiologiques et moléculaires pour lutter contre la vibriose du bar (Dicentrarchus labrax)",
author = "Mougin, Julia",
year = "2020",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Grard, Thierry BIOLOGIE, MEDECINE ET SANTE, Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Littoral 2020",
note = "2020DUNK0569",
url = "http://www.theses.fr/2020DUNK0569/document",
}

@PHDTHESIS{laoua2012,
url = "http://www.theses.fr/2012AVIG0325",
title = "Métabolisme et toxinogénèse de Bacillus cereus : rôles de l’enzyme fermentaire LdhA et du régulateur rédox Rex",
author = "Laouami, Sabrina",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Duport, Catherine Génétique et microbiologie Avignon 2012",
note = "2012AVIG0325",
url = "http://www.theses.fr/2012AVIG0325/document",
}

@PHDTHESIS{laure2014,
url = "http://www.theses.fr/2014PA066280",
title = "Study of the natural transformation pilus in streptococcus pneumoniae",
author = "Laurenceau, Raphael",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fronzes, Rémi Microbiologie Paris 6 2014",
note = "2014PA066280",
url = "http://www.theses.fr/2014PA066280/document",
}

@PHDTHESIS{court2017,
url = "http://www.theses.fr/2017BRES0149",
title = "Génomique comparative d'isolats phylogénétiquement proches appartenant au genre Thermococcus, une archée hyperthermophile",
author = "Courtine, Damien",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Alain, Karine Microbiologie Brest 2017",
note = "2017BRES0149",
url = "http://www.theses.fr/2017BRES0149/document",
}

@PHDTHESIS{Hage2019,
url = "http://www.theses.fr/2019INPT0062",
title = "Salmonelles dans l'industrie avicole libanaise : prévalence, antibiorésistance, caractérisation moléculaire et lutte alternative par les Lactobacilles",
author = "Hage, Rima el",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Mathieu, Florence et El Rayess, Youssef Genie des Procédés et de l'Environnement Toulouse, INPT 2019",
note = "2019INPT0062",
url = "http://www.theses.fr/2019INPT0062/document",
}

@PHDTHESIS{franç2017,
url = "http://www.theses.fr/2017MONTT106",
title = "Diversité et écologie des virus associés aux arthropodes : des communautés aux génomes",
author = "François, Sarah",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ogliastro, Mylène et Froissart, Rémy Ecologie de la santé Montpellier 2017",
note = "2017MONTT106",
url = "http://www.theses.fr/2017MONTT106/document",
}

@PHDTHESIS{thome2018,
url = "http://www.theses.fr/2018REN1B045",
title = "Stress and translation : implication of 16S rRNA methylations in Escherichia coli and characterization of a toxin-antitoxin system of Sinorhizobium meliloti",
author = "Thomet, Manon",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Ermel, Gwennola et Moll, Isabella Microbiologie, Virologie, Parasitologie Rennes 1 2018",
note = "2018REN1B045",
url = "http://www.theses.fr/2018REN1B045/document",
}

@PHDTHESIS{strei2015,
url = "http://www.theses.fr/2015ANTI0016",
title = "Mycobactérium tuberculosis and non tuberculous Mycobacteria in the French Departments of the Americas and in the Caribbean : studying epidemiological aspects and transmission using molecular tools and database comparison",
author = "Streit, Elisabeth Silvia",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Rastogi, Nalin et Millet, Julie Recherche clinique, innovation technologique, sante publique Antilles 2015",
note = "2015ANTI0016",
url = "http://www.theses.fr/2015ANTI0016/document",
}

@PHDTHESIS{yousf2019,
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0234",
title = "Développement de nouvelles stratégies thérapeutiques pour pallier l'émergence de la résistance aux antifongiques",
author = "Yousfi, Hanane",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Rolain, Jean-Marc Maladies infectieuses Aix-Marseille 2019",
note = "2019AIXM0234",
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0234/document",
}

@PHDTHESIS{segur2018,
url = "http://www.theses.fr/2018CLFAC002",
title = "Portage animal des Escherichia coli entérohémorragiques : colonisation et interaction avec le microbiote digestif animal",
author = "Segura, Audrey",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Forano, Évelyne Génétique et Physiologie Université Clermont Auvergne‎ (2017-2020) 2018",
note = "2018CLFAC002",
url = "http://www.theses.fr/2018CLFAC002/document",
}

@PHDTHESIS{zaval2019,
url = "http://www.theses.fr/2019UNIP7173",
title = "Role of PerR regulators in oxidative stress response and virulence of pathogenic leptospira",
author = "Zavala-Alvarado, Jose Crispin",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Benaroudj, Nadia Microbiologie Université de Paris (2019-....) 2019",
note = "2019UNIP7173",
url = "http://www.theses.fr/2019UNIP7173/document",
}

@PHDTHESIS{kénan2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SACLS242",
title = "Staphylococcus aureus se met transitoirement en dormance pour utiliser les acides gras de l'hôte et échapper à une inhibition par un anti-FASII : quel signal active son réveil ?",
author = "Kénanian, Gérald",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Gruss, Alexandra Microbiologie Université Paris-Saclay (ComUE) 2018",
note = "2018SACLS242",
url = "http://www.theses.fr/2018SACLS242/document",
}

@PHDTHESIS{vonda2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS090",
title = "Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) : Prevention and fight against this pathogen",
author = "Von Dach (Saouter), Elodie",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Harbarth, Stephan Santé publique - recherche clinique Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "2017SACLS090",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLS090/document",
}

@PHDTHESIS{fréno2014,
url = "http://www.theses.fr/2014PA05T050",
title = "Second order selection pressures promoting the evolution and maintenance of cooperation in microbial and in silico systems",
author = "Frénoy (Frénoy), Antoine",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Taddei, François Biologie évolutive Paris 5 2014",
note = "2014PA05T050",
url = "http://www.theses.fr/2014PA05T050/document",
}

@PHDTHESIS{saric2020,
url = "http://www.theses.fr/2020UPASL021",
title = "Identification de contraintes locales impactant l’expression des gènes chez Escherichia coli",
author = "Sarica, Nazim",
year = "2020",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Jannière, Laurent Sciences de la vie et de la santé université Paris-Saclay 2020",
note = "2020UPASL021",
url = "http://www.theses.fr/2020UPASL021/document",
}

@PHDTHESIS{poiri2014,
url = "http://www.theses.fr/2014ECDL0033",
title = "Discrimination analytique des génomes bactériens",
author = "Poirion, Olivier",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Krähenbühl, Laurent et Lafay, Bénédicte Ingéniérie pour le vivant Ecully, Ecole centrale de Lyon 2014",
note = "2014ECDL0033",
url = "http://www.theses.fr/2014ECDL0033/document",
}

@PHDTHESIS{briel2016,
url = "http://www.theses.fr/2016REN1B037",
title = "Etude fonctionnelle d’un système toxine-antitoxine de type I exprimé par Staphylococcus aureus et d’ARN régulateurs associés aux ribosomes bactériens",
author = "Brielle, Régine",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Felden, Brice et Pinel-Marie, Marie-Laure Biologie et sciences de la santé Rennes 1 2016",
note = "2016REN1B037",
url = "http://www.theses.fr/2016REN1B037/document",
}

@PHDTHESIS{duche2017,
url = "http://www.theses.fr/2017NORMR005",
title = "Rôles du facteur sigma à fonction extracytoplasmique SigX dans l'adaptation, la formation de biofilm et la réponse à des stress de l'enveloppe chez Pseudomonas aeruginosa.",
author = "Duchesne, Rachel",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Chevalier-Laurency, Sylvie Aspects moleculaires et cellulaires de la biologie Normandie 2017",
note = "2017NORMR005",
url = "http://www.theses.fr/2017NORMR005/document",
}

@PHDTHESIS{magin2019,
url = "http://www.theses.fr/2019IMTA0146",
title = "Exploitation du potentiel des bactériophages dans le traitement des surfaces en contact avec l'eau, contaminées par un biofilm de P. aeruginosa",
author = "Magin, Vanessa",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Andres, Yves Génie des Procédés et Bioprocédés Ecole nationale supérieure Mines-Télécom Atlantique Bretagne Pays de la Loire 2019",
note = "2019IMTA0146",
url = "http://www.theses.fr/2019IMTA0146/document",
}

@PHDTHESIS{ageor2019,
url = "http://www.theses.fr/2019CLFAC019",
title = "Caractérisation du rôle de l'Antigène 43 dans le processus de colonisation d'Escherichia coli O157∶H7",
author = "Ageorges, Valentin",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Desvaux, Mickaël Microbiologie Université Clermont Auvergne‎ (2017-2020) 2019",
note = "2019CLFAC019",
url = "http://www.theses.fr/2019CLFAC019/document",
}

@PHDTHESIS{khodr2011,
url = "http://www.theses.fr/2011DENS0072",
title = "Etude des protéines de la famille H-NS : régulation différentielle des opérons LEE par les protéines H-NS et Ler chez les EPEC",
author = "Khodr, Ahmad",
year = "2011",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Rimsky, Sylvie Sciences de la vie et de la santé Cachan, Ecole normale supérieure 2011",
note = "2011DENS0072",
url = "http://www.theses.fr/2011DENS0072/document",
}

@PHDTHESIS{balie2016,
url = "http://www.theses.fr/2016BRES0003",
title = "Les Escherichia coli potentiellement pathogènes dans l'environnement littoral : cas des STEC et des EPEC",
author = "Balière, Charlotte",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Gourmelon, Michèle et Rincé, Alain Microbiologie Brest 2016",
note = "2016BRES0003",
url = "http://www.theses.fr/2016BRES0003/document",
}

@PHDTHESIS{faugi2010,
url = "http://www.theses.fr/2010ECDL0008",
title = "Diversité bactérienne des sols : accès aux populations à effectifs minoritaires "the rare biosphere"",
author = "Faugier, Aurélie",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Simonet, Pascal Microbiologie Ecully, Ecole centrale de Lyon 2010",
note = "2010ECDL0008",
url = "http://www.theses.fr/2010ECDL0008/document",
}

@PHDTHESIS{henry2011,
url = "http://www.theses.fr/2011NAN10087",
title = "Caractérisation des régulateurs transcriptionnels Rgg et étude du rôle de la protéine Rgg0182 de Streptococcus thermophilus",
author = "Henry, Romain",
year = "2011",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Decaris, Bernard et Leblond-Bourget, Nathalie Sciences de la Vie et de la Santé Nancy 1 2011",
note = "2011NAN10087",
url = "http://www.theses.fr/2011NAN10087/document",
}

@PHDTHESIS{amari2012,
url = "http://www.theses.fr/2012PA112036",
title = "Évolution des génomes de bactériophages",
author = "Amarir-Bouhram, Jihane",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Petit, Marie-Agnès Microbiologie Paris 11 2012",
note = "2012PA112036",
url = "http://www.theses.fr/2012PA112036/document",
}

@PHDTHESIS{alsaf2010,
url = "http://www.theses.fr/2010TOUR4015",
title = "Impact d'éléments génétiques variables sur l'expression de quatre gènes de virulence chez streptococcus agalactiae",
author = "Al safadi, Rim",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Rosenau-Ilias, Agnès Sciences de la vie et de la santé, spécialité Infectiologie et vaccinologie Tours 2010",
note = "2010TOUR4015",
url = "http://www.theses.fr/2010TOUR4015/document",
}

@PHDTHESIS{yassi2015,
url = "http://www.theses.fr/2015BORD0405",
title = "Etude de la séquence d'insertion IS1294b et de son implication dans la dissémination des gènes de résistance aux antibiotiques chez les entérobactéries",
author = "Yassine, Haytham",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Arpin, Corinne Microbiologie-Immunologie Bordeaux 2015",
note = "2015BORD0405",
url = "http://www.theses.fr/2015BORD0405/document",
}

@PHDTHESIS{illik2018,
url = "http://www.theses.fr/2018NANT4020",
title = "Caractérisation des mécanismes d'altération des produits camés et de la mer par Brochothrix thermosphacta",
author = "Illikoud, Nassima",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Zagorec, Monique et Jaffrès, Emmanuel Microbiologie Nantes 2018",
note = "2018NANT4020",
url = "http://www.theses.fr/2018NANT4020/document",
}

@PHDTHESIS{soare2019,
url = "http://www.theses.fr/2019NORMR045",
title = "Exploration de l'adaptation de Pseudomonas aeruginosa en biofilm : rôle dans l'échec des traitements antibiotiques",
author = "Soares, Anaïs",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Étienne, Manuel et Caron, François Sciences de la vie et de la sante Normandie 2019",
note = "2019NORMR045",
url = "http://www.theses.fr/2019NORMR045/document",
}

@PHDTHESIS{méhe2016,
url = "http://www.theses.fr/2016PA066534",
title = "Étude des processus introgressifs en évolution par des méthodes de réseaux",
author = "Méheust, Raphaël",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bapteste, Éric et Lopez, Philippe Biologie Evolutive Paris 6 2016",
note = "2016PA066534",
url = "http://www.theses.fr/2016PA066534/document",
}

@PHDTHESIS{launa2016,
url = "http://www.theses.fr/2016PA066692",
title = "Etude de l'émergence de la diversité d'Escherichia coli in vivo par séquençage de génomes complets",
author = "Launay, Adrien",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Tenaillon, Olivier Complexité du Vivant Paris 6 2016",
note = "2016PA066692",
url = "http://www.theses.fr/2016PA066692/document",
}

@PHDTHESIS{pelle2017,
url = "http://www.theses.fr/2017PA066078",
title = "Contribution des polymorphismes d'insertions à la stérilité des hybrides chez Paramecium tetraurelia",
author = "Pellerin, Guillaume",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Meyer, Éric Biologie Paris 6 2017",
note = "2017PA066078",
url = "http://www.theses.fr/2017PA066078/document",
}

@PHDTHESIS{lewis2019,
url = "http://www.theses.fr/2019BORD0054",
title = "Identification de voies de résistance aux inhibiteurs de tyrosine kinase dans la leucémie myéloïde chronique par criblage CRISPR-Cas9.",
author = "Lewis, Matthieu",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Mahon, François-Xavier Génétique Bordeaux 2019",
note = "2019BORD0054",
url = "http://www.theses.fr/2019BORD0054/document",
}

@PHDTHESIS{moran2019,
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0566",
title = "Description du microbiote urinaire par méthodes de culturomics et de métagénomique",
author = "Morand, Aurélie",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Maladies infectieuses Aix-Marseille 2019",
note = "2019AIXM0566",
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0566/document",
}

@PHDTHESIS{james2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SORUS477",
title = "Ecology, evolution and virulence of environmental vibrios",
author = "James, Adèle",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Roux, Frédérique Microbiologie moléculaire Sorbonne université 2018",
note = "2018SORUS477",
url = "http://www.theses.fr/2018SORUS477/document",
}

@PHDTHESIS{carri2017,
url = "http://www.theses.fr/2017GREAV011",
title = "Etude sur la relation fonction-structure de la lysine décarboxylase de Pseudomonas aeruginosa",
author = "Carriel Lopez, Diego",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Gutsche, Irina et Elsen, Sylvie Biologie Structurale et Nanobiologie Université Grenoble Alpes (ComUE) 2017",
note = "2017GREAV011",
url = "http://www.theses.fr/2017GREAV011/document",
}

@PHDTHESIS{girau2015,
url = "http://www.theses.fr/2015AGPT0007",
title = "Développement d'outils de typage moléculaire de haute résolution pour la détection et la différenciation de Bacillus anthracis",
author = "Girault, Guillaume",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Derzelle, Sylviane Sciences du vivant Paris, AgroParisTech 2015",
note = "2015AGPT0007",
url = "http://www.theses.fr/2015AGPT0007/document",
}

@PHDTHESIS{mocae2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS553",
title = "From gene to ecosystem : an integrative study of polysaccharide depolymerases bound to marine viruses",
author = "Mocaër, Pierre-Yves",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Baudoux, Anne-Claire et Simon, Nathalie Microbiologie Sorbonne université 2019",
note = "2019SORUS553",
url = "http://www.theses.fr/2019SORUS553/document",
}

@PHDTHESIS{pandi2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SACLA025",
title = "Exploration des mécanismes impliqués dans la bioprotection d'Agaricus bisporus par les biofilms de Bacillus subtilis QST713",
author = "Pandin, Caroline",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Briandet, Romain Microbiologie Université Paris-Saclay (ComUE) 2018",
note = "2018SACLA025",
url = "http://www.theses.fr/2018SACLA025/document",
}

@PHDTHESIS{cardo2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SACLA010",
title = "Diversité et analyse fonctionnelle des systèmes Rap-Phr du groupe Bacillus cereus",
author = "Cardoso, Priscilla",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Lereclus, Didier et Lemes Trindade Vilas-Bôas, Gislayne Fernandes Microbiologie Université Paris-Saclay (ComUE) 2019",
note = "Thèse de doctorat Microbiologie Universidade Estadual de Londrina (Paraná, Brésil) 2019",
note = "2019SACLA010",
url = "http://www.theses.fr/2019SACLA010/document",
}

@PHDTHESIS{baudi2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SACLS202",
title = "How do the metabolites, GTP and (p)ppGpp, simultaneously control the occurrence of translational errors and resource allocation in bacteria?",
author = "Baudier, Claire",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Aymerich, StéphaneFromion, Vincent et Jules, Matthieu Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2018",
note = "2018SACLS202",
url = "http://www.theses.fr/2018SACLS202/document",
}

@PHDTHESIS{bredo2019,
url = "http://www.theses.fr/2019POIT2318",
title = "Caractérisation de l'holobionte des isopodes par des approches omiques : exemple du processus de dégradation de la lignocellulose",
author = "Bredon, Marius",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bouchon, Didier et Moumen, Bouziane Biologie de l'environnement, des populations, écologie Poitiers 2019",
note = "2019POIT2318",
url = "http://www.theses.fr/2019POIT2318/document",
}

@PHDTHESIS{sadik2018,
url = "http://www.theses.fr/2018ANTI0251",
title = "Influence des rejets humains et animaux sur la diffusion de l'antibiorésistance à l'homme, aux animaux et à l'environnement en Guadeloupe",
author = "Sadikalay, Syndia",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Talarmin, Antoine Physiologie et biologie des organismes - populations - interactions Antilles 2018",
note = "2018ANTI0251",
url = "http://www.theses.fr/2018ANTI0251/document",
}

@PHDTHESIS{gallo2007,
url = "http://www.theses.fr/2007NAN10108",
title = "Dynamique des extrémités du chromosome linéaire de Streptomyces ambofaciens",
author = "Gallois, Alexandre",
year = "2007",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Leblond, Pierre et Aigle, Bertrand Génétique Moléculaire Nancy 1 2007",
note = "2007NAN10108",
url = "http://www.theses.fr/2007NAN10108/document",
}

@PHDTHESIS{madei2016,
url = "http://www.theses.fr/2016AVIG0336",
title = "Dynamique de l'exoprotéome et homéostasie rédox chez Bacillus cereus : rôle de l'oxydation et réduction des résidus méthionines",
author = "Madeira, Jean-Paul",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Duport, Catherine Biologie Avignon 2016",
note = "2016AVIG0336",
url = "http://www.theses.fr/2016AVIG0336/document",
}

@PHDTHESIS{jobar2010,
url = "http://www.theses.fr/2010CLF22090",
title = "Diversité phylogénétique et fonctionnelle des Eumycètes dans les écosystèmes pélagiques",
author = "Jobard-Portas (Jobard), Marlène",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Sime Ngando, Télesphore Ecologie Microbienne Clermont-Ferrand 2 2010",
note = "2010CLF22090",
url = "http://www.theses.fr/2010CLF22090/document",
}

@PHDTHESIS{favie2012,
url = "http://www.theses.fr/2012BOR21984",
title = "Etude des plasmides et génomes d’Oenococcus oeni pour l’identification des gènes d’intérêt technologique",
author = "Favier, Marion",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Lucas, Patrick Sciences, technologie, santé. Oenologie Bordeaux 2 2012",
note = "2012BOR21984",
url = "http://www.theses.fr/2012BOR21984/document",
}

@PHDTHESIS{delpe2015,
url = "http://www.theses.fr/2015CLF22615",
title = "Antagonisme de lactococcus garvieae vis-à-vis de Staphylococcus aureus : étude physiologique et  transcriptomique des mécanismes",
author = "Delpech, Pierre",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Montel, Marie-Christine Nutrition et Sciences des aliments Clermont-Ferrand 2 2015",
note = "2015CLF22615",
url = "http://www.theses.fr/2015CLF22615/document",
}

@PHDTHESIS{korku2015,
url = "http://www.theses.fr/2015BORD0355",
title = "Identification et caractérisation structurale du système Toxine-Antitoxine aapA1/IsoA1 de Helicobacter pylori : De l’analyse globale des systémes par bio informatique à l’étude structurale par Résonnance Magnétique Nucluéaire",
author = "Korkut, Dursun Nizam",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Darfeuille, Fabien Biochimie Bordeaux 2015",
note = "2015BORD0355",
url = "http://www.theses.fr/2015BORD0355/document",
}

@PHDTHESIS{galia2011,
url = "http://www.theses.fr/2011INPL053N",
title = "Caractérisation de la variabilité du système protéolytique de surface de la bactérie lactique Streptococcus thermophilus",
author = "Galia, Wessam",
year = "2011",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Dary, Annie et Perrin, Clarisse Sciences agronomiques Vandoeuvre-les-Nancy, INPL 2011",
note = "2011INPL053N",
url = "http://www.theses.fr/2011INPL053N/document",
}

@PHDTHESIS{lecom2014,
url = "http://www.theses.fr/2014LORR0271",
title = "Contribution de protéases pariétales dans l'activité des systémes protéolytiques de surface de Lactobacillus helveticus et streptococcus thermophilus en matrice laitière",
author = "Lecomte, Xavier",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Dary, Annie et Gagnaire, Valérie Procédés biotechnologiques et alimentaires Université de Lorraine 2014",
note = "2014LORR0271",
url = "http://www.theses.fr/2014LORR0271/document",
}

@PHDTHESIS{selme2010,
url = "http://www.theses.fr/2010NAN10089",
title = "Les protéines PilB, nDsbD et DsbE1 de Neisseria meningitidis : caractérisation enzymatique, fonctionnelle et structurale",
author = "Selme-Roussel, Laure",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Boschi-Muller, Sandrine et Jacob, Christophe Sciences de la Vie et de la Santé Nancy 1 2010",
note = "2010NAN10089",
url = "http://www.theses.fr/2010NAN10089/document",
}

@PHDTHESIS{Eng2010,
url = "http://www.theses.fr/2010NAN10041",
title = "Développement de méthodes de fouille de données basées sur les modèles de Markov cachés du second ordre pour l'identification d'hétérogénéités dans les génomes bactériens",
author = "Eng, Catherine",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Leblond, Pierre et Mari, Jean-françois Génomique Nancy 1 2010",
note = "Thèse de doctorat Génomique Université de Metz 2010",
note = "2010NAN10041",
url = "http://www.theses.fr/2010NAN10041/document",
}

@PHDTHESIS{benma2016,
url = "http://www.theses.fr/2016REN1S108",
title = "Biodiversité des eaux souterraines dans un gradient de temps de résidence et d'influence anthropique : approches métagénomique et géochimique couplées",
author = "Ben Maamar, Sarah",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Aquilina, Luc et Pauwels, Hélène Sciences de la terre Rennes 1 2016",
note = "2016REN1S108",
url = "http://www.theses.fr/2016REN1S108/document",
}

@PHDTHESIS{romil2012,
url = "http://www.theses.fr/2012STRAJ024",
title = "Fonctions de nouveaux ARN non codant dans la régulation de l'expression des gènes chez Staphylococcus aureus : adaptation à l'environnement et virulence",
author = "Romilly, Cédric",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Romby, Pascale Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie Strasbourg 2012",
note = "2012STRAJ024",
url = "http://www.theses.fr/2012STRAJ024/document",
}

@PHDTHESIS{ngoub2017,
url = "http://www.theses.fr/2017LYSE1112",
title = "Recherche d’agents infectieux circulant dans une communauté d’hôtes, intérêt pour la conservation des PNHs et risque d’émergence de maladies zoonotiquesau Centre De Primatologie du CIRMF et dans les sanctuaires de PNHs (au Gabon)rimatologie du CIRMF (Gabon)",
author = "Ngoubangoye, Barthélémy",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pontier, Dominique et Renaud, François Micro-organismes, interactions, infections Lyon 2017",
note = "2017LYSE1112",
url = "http://www.theses.fr/2017LYSE1112/document",
}

@PHDTHESIS{leblo2016,
url = "http://www.theses.fr/2016BRES0119",
title = "Mode de reconnaissance hôte symbionte en milieux extrêmes : cas du modèle symbiotique Rimicaris exoculata",
author = "Le Bloa, Simon",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Cambon-Bonavita, Marie-Anne et Bazire, Alexis Ecologie microbienne Brest 2016",
note = "2016BRES0119",
url = "http://www.theses.fr/2016BRES0119/document",
}

@PHDTHESIS{Sall2013,
url = "http://www.theses.fr/2013GRENV051",
title = "Etude de la régulation du système de sécrétion de type 3 et du système de sécrétion de type 6 chez Pseudomonas aeruginosa : Approches de chémogénomique, mutagénèse aléatoire et étude d'isolat clinique",
author = "Sall, Khady",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Elsen, Sylvie Virologie, Microbiologie, Immunologie Grenoble 2013",
note = "2013GRENV051",
url = "http://www.theses.fr/2013GRENV051/document",
}

@PHDTHESIS{morge2018,
url = "http://www.theses.fr/2018LYSES054",
title = "Modélisation in vitro de la colonisation à staphylococcus aureus ; interactions avec l’infection à rhinovirus",
author = "Morgene, Mohamed Fedy",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pozzetto, Bruno et Verhoeven, Paul Sciences de la vie et de la sante Lyon 2018",
note = "2018LYSES054",
url = "http://www.theses.fr/2018LYSES054/document",
}

@PHDTHESIS{Kini2018,
url = "http://www.theses.fr/2018MONTG015",
title = "Pantoea spp : une nouvelle menace bactérienne pour la production rizicole en Afrique subsaharienne",
author = "Kini, Kossi",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Koebnik, Ralf et Silué, Drissa Evolution des systèmes infectieux Montpellier 2018",
note = "Thèse de doctorat Evolution des systèmes infectieux AfricaRice (Abidjan) 2018",
note = "2018MONTG015",
url = "http://www.theses.fr/2018MONTG015/document",
}

@PHDTHESIS{galli2017,
url = "http://www.theses.fr/2017NORMR087",
title = "Implication du système de sécrétion de type VI de la souche Pseudomonas fluorescens MFE01 dans l'activité antibactérienne, la formation de biofilm et l'inhibition de mobilité.",
author = "Gallique, Mathias",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Merieau, Annabelle Aspects moleculaires et cellulaires de la biologie Normandie 2017",
note = "2017NORMR087",
url = "http://www.theses.fr/2017NORMR087/document",
}

@PHDTHESIS{wecke2018,
url = "http://www.theses.fr/2018USPCB097",
title = "Molecular mechanisms of Streptococcus pyogenes tissue colonization and invasion",
author = "Weckel, Antonin",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fouet, Agnès Microbiologie Sorbonne Paris Cité 2018",
note = "2018USPCB097",
url = "http://www.theses.fr/2018USPCB097/document",
}

@PHDTHESIS{Um2016,
url = "http://www.theses.fr/2016TOU30161",
title = "Escherichia coli entérohémorragiques et/ou résistantes aux antibiotiques : contamination des effluents d'origine bovine",
author = "Um, Maryse Michèle",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Brugère, Hubert et Bibbal, Delphine Microbiologie Toulouse 3 2016",
note = "2016TOU30161",
url = "http://www.theses.fr/2016TOU30161/document",
}

@PHDTHESIS{gibol2016,
url = "http://www.theses.fr/2016CLF1MM22",
title = "Impact des facteurs micro-environnementaux de l'hôte sur la colonisation instestinale des Escherichia Coli adhérents et invasifs.",
author = "Gibold-Lyonne, Lucie",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Delmas, Julien Sciences de la vie et de la sante Clermont-Ferrand 1 2016",
note = "2016CLF1MM22",
url = "http://www.theses.fr/2016CLF1MM22/document",
}

@PHDTHESIS{danda2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0286",
title = "Multi drug resistant organisms in Lebanese livestock",
author = "Dandachi, Iman",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Rolain, Jean-Marc et Daoud, Ziad Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0286",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0286/document",
}

@PHDTHESIS{breni2017,
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0735",
title = "Étude de la tolérance à l’acidité et aux polyphénols chez Oenococcus oeni, de la caractérisation des effets à l’identification des mécanismes de réponse aux stress",
author = "Breniaux, Marion",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Lucas, Patrick Oenologie Bordeaux 2017",
note = "2017BORD0735",
url = "http://www.theses.fr/2017BORD0735/document",
}

@PHDTHESIS{goula2017,
url = "http://www.theses.fr/2017UBFCE013",
title = "Les ilôts de résistance de type SGI1 (Salmonella Genomic Island 1) et apparentés dans des souches humaines cliniques de Porteus mirabilis et Salmonella enterica",
author = "Goulard de Curraize, Claire",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Neuwirth, Catherine Médecine, microbiologie et maladies transmissibles Bourgogne Franche-Comté 2017",
note = "2017UBFCE013",
url = "http://www.theses.fr/2017UBFCE013/document",
}

@PHDTHESIS{Pham2019,
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0583",
title = "Caractérisation du microbiote intestinal des enfants atteints de la malnutrition aigüe sévère",
author = "Pham, Thi Phuong Thao",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Maladies infectieuses Aix-Marseille 2019",
note = "2019AIXM0583",
url = "http://www.theses.fr/2019AIXM0583/document",
}

@PHDTHESIS{arsen2018,
url = "http://www.theses.fr/2018SORUS399",
title = "Parasitisme et contrôle des blooms de diatomées en Manche occidentale",
author = "Arsenieff, Laure",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Simon, Nathalie et Baudoux, Anne-Claire Écologie microbienne marine Sorbonne université 2018",
note = "2018SORUS399",
url = "http://www.theses.fr/2018SORUS399/document",
}

@PHDTHESIS{conse2019,
url = "http://www.theses.fr/2019SACLA018",
title = "Mécanismes d'acquisition du fer de l'hôte chez Bacillus cereus : rôle du couple bacillibactine-FeuA et expression des gènes impliqués dans l'homéostasie du fer in vivo durant l’infection intestinale chez l’insecte.",
author = "Consentino, Laurent",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Nielsen-Leroux, Christina Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2019",
note = "2019SACLA018",
url = "http://www.theses.fr/2019SACLA018/document",
}

@PHDTHESIS{ceris2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLE018",
title = "Rational and evolution-based engineering of Clostridium phytofermentans",
author = "Cerisy, Tristan",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Salanoubat, Marcel et Tolonen, Andrew C. Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "2017SACLE018",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLE018/document",
}

@PHDTHESIS{elsay2016,
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS362",
title = "Mapping Topoisomerase IV Binding and Activity Sites on the E. coli genome",
author = "El Sayyed, Hafez",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Espéli, Olivier Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2016",
note = "2016SACLS362",
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS362/document",
}

@PHDTHESIS{cordo2015,
url = "http://www.theses.fr/2015CLF1MM21",
title = "Survie et pathogénicité des EHEC dans l'environnement digestif : Interactions avec le microbiote et l'épithélium intestinal. : Influence de l'administration de levures probiotiques.",
author = "Cordonnier, Charlotte",
year = "2015",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Livrelli, Valérie et Blanquet, Stéphanie Sciences de la vie et de la sante Clermont-Ferrand 1 2015",
note = "2015CLF1MM21",
url = "http://www.theses.fr/2015CLF1MM21/document",
}

@PHDTHESIS{laenc2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLV090",
title = "Avantages génomiques conférés à Mycobacterium abscessus pour une existence intracellulaire",
author = "Laencina, Laura",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Herrmann, Jean-Louis et Girard-Misguich, Fabienne Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "2017SACLV090",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLV090/document",
}

@PHDTHESIS{mathi2014,
url = "http://www.theses.fr/2014ECDL0010",
title = "Etude fonctionnelle de la communauté microbienne de la peau par une approche métagénomique",
author = "Mathieu, Alban",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Simonet, Pascal Génomique microbienne Ecully, Ecole centrale de Lyon 2014",
note = "2014ECDL0010",
url = "http://www.theses.fr/2014ECDL0010/document",
}

@PHDTHESIS{saint2012,
url = "http://www.theses.fr/2012LAROS388",
title = "Modélisation du rôle du biofilm dans le fonctionnement du réseau trophique de la vasière de Brouage (Bassin de Marennes-Oléron) : influence sur les flux de carbone et conséquences sur la stabilité",
author = "Saint-Béat, Blanche",
year = "2012",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Niquil, Nathalie Océanologie biologique et environnement marin La Rochelle 2012",
note = "2012LAROS388",
url = "http://www.theses.fr/2012LAROS388/document",
}

@PHDTHESIS{duthe2013,
url = "http://www.theses.fr/2013PA112057",
title = "Reprogrammation du métabolisme cyanobactérien de Synechocystis sp. PCC6803 pour une meilleure photoproduction d’hydrogène",
author = "Dutheil, Jérémy",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Cassier-Chauvat, Corinne Biologie Paris 11 2013",
note = "2013PA112057",
url = "http://www.theses.fr/2013PA112057/document",
}

@PHDTHESIS{bouch2013,
url = "http://www.theses.fr/2013REN1S098",
title = "Potentiel probiotique des bactéries lactiques de l'écosystème mammaire bovin contre les mammites à Staphylococcus aureus",
author = "Bouchard, Damien",
year = "2013",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Le Loir, Yves et Even, Sergine Biologie Rennes 1 2013",
note = "2013REN1S098",
url = "http://www.theses.fr/2013REN1S098/document",
}

@PHDTHESIS{douar2011,
url = "http://www.theses.fr/2011TOUR4015",
title = "Mécanismes moléculaires impliqués dans le transfert horizontal de l'îlot génomique de multi-résistance aux antibiotiques Salmonella Genomic Island 1",
author = "Douard, Grégory",
year = "2011",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Cloeckaert, Axel et Doublet, Benoît Sciences de la Vie et de la Santé Tours 2011",
note = "2011TOUR4015",
url = "http://www.theses.fr/2011TOUR4015/document",
}

@PHDTHESIS{layec2008,
url = "http://www.theses.fr/2008NAN10066",
title = "Le gène cse, de création récente, code une hydrolase du peptidoglycane impliquée dans la séparation des cellules de Streptococcus thermophilus",
author = "Layec, Séverine",
year = "2008",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Decaris, Bernard Génétique Moléculaire Nancy 1 2008",
note = "2008NAN10066",
url = "http://www.theses.fr/2008NAN10066/document",
}

@PHDTHESIS{lelch2014,
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0070",
title = "Enzymes de dépolymérisation d'exopolysaccharides bactériens marins",
author = "Lelchat, Florian",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Colliec-Jouault, SylviaBaudoux, Anne-Claire et Boisset, Claire Microbiologie Brest 2014",
note = "2014BRES0070",
url = "http://www.theses.fr/2014BRES0070/document",
}

@PHDTHESIS{gamba2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0218",
title = "Biogenèse de la pellicule chez Shewanella oneidensis",
author = "Gambari, Cyril",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Méjean, Vincent et Jourlin, Cécile Biologie Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0218",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0218/document",
}

@PHDTHESIS{sofon2017,
url = "http://www.theses.fr/2017MONTT114",
title = "Évolution de la virulence et infections multiples",
author = "Sofonea, Mircea",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Michalakis, Ioannis et Alizon, Samuel Evolution des systèmes infectieux Montpellier 2017",
note = "2017MONTT114",
url = "http://www.theses.fr/2017MONTT114/document",
}

@PHDTHESIS{dahyo2019,
url = "http://www.theses.fr/2019NORMR046",
title = "Contribution à la compréhension des mécanismes moléculaires impliqués dans la virulence de Staphylococcus lugdunensis.",
author = "Dahyot, Sandrine",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pestel-Caron, Martine Sciences de la vie et de la sante Normandie 2019",
note = "2019NORMR046",
url = "http://www.theses.fr/2019NORMR046/document",
}

@PHDTHESIS{talag2017,
url = "http://www.theses.fr/2017MONTT123",
title = "Diversité, complexité et adaptation au comportement pathogène au sein du genre Aeromonas",
author = "Talagrand, Emilie",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Lamy, Brigitte et Bilak, Estelle Evolution des systèmes infectieux Montpellier 2017",
note = "2017MONTT123",
url = "http://www.theses.fr/2017MONTT123/document",
}

@PHDTHESIS{jagod2017,
url = "http://www.theses.fr/2017USPCC111",
title = "Multiples mécanismes de régulation post-transcriptionnelle chez les bactéries : des structures d’ARN messager aux ARN régulateurs",
author = "Jagodnik, Jonathan",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Chiaruttini, Claude et Guillier, Maude Sciences de la vie et de la santé. Microbiologie Sorbonne Paris Cité 2017",
note = "2017USPCC111",
url = "http://www.theses.fr/2017USPCC111/document",
}

@PHDTHESIS{comte2014,
url = "http://www.theses.fr/2014CLF22467",
title = "Evolution structurale et fonctionnelle des communautés microbiennes digestives sous l'influence de facteurs biotiques et abiotiques.  Développement d'une biopuce ADN ciblant les gènes impliqués dans la dégradation des glucides complexes alimentaires",
author = "Comtet-Marre, Sophie",
year = "2014",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Forano, Évelyne et Peyret, Pierre Génomique et Ecologie Microbienne Clermont-Ferrand 2 2014",
note = "2014CLF22467",
url = "http://www.theses.fr/2014CLF22467/document",
}

@PHDTHESIS{duran2018,
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0705",
title = "Incompatibilités de culture bactérienne",
author = "Durand, Guillaume",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Raoult, Didier Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2018",
note = "2018AIXM0705",
url = "http://www.theses.fr/2018AIXM0705/document",
}

@PHDTHESIS{lesci2019,
url = "http://www.theses.fr/2019NSARB323",
title = "Microbiote intestinal chez le porc, facteurs de variation et relations avecles performances des animaux",
author = "Le Sciellour Hazon, Mathilde",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Renaudeau, David et Zemb, Olivier Biologie et physiologie animales Rennes, Agrocampus Ouest 2019",
note = "2019NSARB323",
url = "http://www.theses.fr/2019NSARB323/document",
}

@PHDTHESIS{sagha2016,
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS502",
title = "Caractérisation phylogénétique et fonctionnelle de microbialites et de tapis microbiens",
author = "Saghaï, Aurélien",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par López-García, Purificación Sciences de la vie et de la santé Université Paris-Saclay (ComUE) 2016",
note = "2016SACLS502",
url = "http://www.theses.fr/2016SACLS502/document",
}

@PHDTHESIS{baudi2017,
url = "http://www.theses.fr/2017SACLC013",
title = "Couplage de rapporteurs génétiques et d’une molécule active pour l’étude de la dispersion de biofilms.",
author = "Baudin, Marine",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Pareau, Dominique et Sclavi, Bianca Biologie Université Paris-Saclay (ComUE) 2017",
note = "2017SACLC013",
url = "http://www.theses.fr/2017SACLC013/document",
}

@PHDTHESIS{rombo2010,
url = "http://www.theses.fr/2010LIL10145",
title = "Analyse structurale et fonctionnelle des glycolipides pariétaux de Mycobacterium marinum : une mycobactérie modèle dans l’étude de la tuberculose",
author = "Rombouts, Yoann",
year = "2010",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Guérardel, Yann et Elass-Rochard, Elisabeth Sciences de la vie et de la santé Lille 1 2010",
note = "2010LIL10145",
url = "http://www.theses.fr/2010LIL10145/document",
}

@PHDTHESIS{fatim2016,
url = "http://www.theses.fr/2016MONTT102",
title = "Réservoir environnemental, persistance et succès épidémiologique des populations de Pseudomonas aeruginosa dans un hôpital",
author = "Fatima, Abdouchakour",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Bilak, Estelle et Aujoulat, Fabien Ecologie de la santé Montpellier 2016",
note = "2016MONTT102",
url = "http://www.theses.fr/2016MONTT102/document",
}

@PHDTHESIS{dahma2017,
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0202",
title = "Les bactéries de la famille des Anaplasmataceae, agents pathogènes à transmission vectorielle",
author = "Dahmani, Mustapha",
year = "2017",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Fenollar, FlorenceMediannikov, Oleg et Davoust, Bernard Pathologie humaine. Maladies infectieuses Aix-Marseille 2017",
note = "2017AIXM0202",
url = "http://www.theses.fr/2017AIXM0202/document",
}

@PHDTHESIS{larab2019,
url = "http://www.theses.fr/2019CLFAS018",
title = "Les exosomes, médiateurs fondamentaux de la communication intercellulaire au cours de l'infection par les bactéries AIEC impliquées dans la maladie de Crohn",
author = "Larabi, Anaïs",
year = "2019",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Delmas, Julien et Nguyen, Hang Microbiologie Cellulaire Université Clermont Auvergne‎ (2017-2020) 2019",
note = "2019CLFAS018",
url = "http://www.theses.fr/2019CLFAS018/document",
}

@PHDTHESIS{dupon2016,
url = "http://www.theses.fr/2016MONTT105",
title = "Achromobacter & Pandoraea : diversité et évolution adaptative de populations persistantes au cours de la mucoviscidose et dans l'environnement",
author = "Dupont, Chloé",
year = "2016",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Marchandin, Hélène et Bilak, Estelle Evolution des systèmes infectieux Montpellier 2016",
note = "2016MONTT105",
url = "http://www.theses.fr/2016MONTT105/document",
}

@PHDTHESIS{kosty2018,
url = "http://www.theses.fr/2018PA01H225",
title = "La place des virus dans le monde vivant",
author = "Kostyrka, Gladys",
year = "2018",
note = "Thèse de doctorat dirigée par Morange, Michel et Gayon, Jean Philosophie Paris 1 2018",
note = "2018PA01H225",
url = "http://www.theses.fr/2018PA01H225/document",
}