Thèse soutenue

Dynamique spatio-temporelle des communautés adventices en réponse aux pratiques de gestion des sols et conséquences pour les processus de recyclage de la matière organique dans les vignobles ˸ une approche fonctionnelle

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Auteur / Autrice : Marie-Charlotte Bopp
Direction : Elena KazakouGuillaume Fried
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Ecologie fonctionnelle et Sciences Agronomiques
Date : Soutenance le 09/02/2023
Etablissement(s) : Montpellier, SupAgro
Ecole(s) doctorale(s) : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive (Montpellier)
Jury : Président / Présidente : Marie-Stéphane Tixier
Examinateurs / Examinatrices : Elena Kazakou, Guillaume Fried, Marie-Stéphane Tixier, Emmanuelle Porcher, Grégory Mahy, Virginie Baldy, Jean-Philippe Guillemin
Rapporteurs / Rapporteuses : Emmanuelle Porcher, Grégory Mahy

Résumé

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Les adventices constituent une part importante de la biodiversité végétale spontanée des agrosystèmes viticoles et leur gestion représente un levier majeur de la transition agroécologique. L'objectif de la thèse est de comprendre la réponse des communautés adventices aux pratiques de gestion (désherbage chimique, travail du sol, tonte), à différentes échelles spatiales et temporelles, et d'explorer leurs influences sur les processus de recyclage de la matière organique (décomposition, activité microbienne reliée au cycle de l'azote), en utilisant l'approche fonctionnelle. Pour cela, nous avons mobilisé plusieurs réseaux de parcelles viticoles français (Champagne, Vallée du Rhône, Bordelais et Occitanie), dont un réseau historique dans le Montpellierais mis en place en 1978. Nous démontrons que le désherbage chimique, appliqué consécutivement pendant au moins cinq ans, favorise des communautés adventices à stratégie foliaire de conservation de ressources, à potentiel de décomposition faible tandis que le travail du sol et la tonte favorisent des communautés adventices à stratégie foliaire acquisitive, à potentiel de décomposition élevé. Les herbicides favorisent des stratégies racinaires acquisitives d'exploration des ressources du sol tandis que la tonte et le travail du sol sont associées à des communautés adventices dont les stratégies s'appuient sur la collaboration avec les champignons mycorhiziens. Les communautés adventices à stratégie d'exploration racinaire des sols sont associées à une plus grande abondance de micro-organismes nitrifiants. En 40 ans (des années 1980s à aujourd'hui), le changement climatique (+2°C de température estivale) a induit des communautés adventices plus tolérantes au stress, tandis que la diversification des pratiques de gestion a favorisé des communautés moins compétitives. Les communautés adventices actuelles sont 41 % plus abondantes et 24 % plus riches qu'il y a 40 ans témoignant de leurs résiliences aux changements climatiques et de pratique. La thèse démontre que la pratique de la tonte est particulièrement prometteuse. Au bout de cinq ans, la tonte favorise des couverts très décomposables, à biomasse et teneur en azote élevées, à biomasse microbienne environ deux fois plus élevée que dans les sols des autres modes de gestion et promeut deux fois plus d'espèces d'adventices que dans les autres modes de gestion. Cette thèse démontre que la gestion des adventices est un indéniable levier d'action pour piloter les communautés d'adventices diverses et fonctionnelles de demain.