Restauration de population du denti Dentex dentex et du corb Sciaena umbra en Méditerranée : évaluation des performances individuelles, suivi individuel et populationnel des juvéniles

Population restoration of Dentex dentex and Sciaena umbra in the Mediterranean Sea : individual performances assessment, individual and population monitoring of juveniles

• Auteur / Autrice : Salomé Ducos
• Direction : Antoine Aiello, Éric Durieux
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physiologie et Biologie des Organismes - Populations - Interactions
• Date : Soutenance le 03/07/2023
• Etablissement(s) : Corte
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Environnement et sociéte (Corte ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Université de Corse (1975-....). UMR CNRS 6134 "Sciences pour l'Environnement" (SPE) - Université de Corse. UMS CNRS 3514 STELLA MARE (Sustainable TEchnologies for LittoraL Aquaculture and MArine REsearch)
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Éric Durieux, Philippe Lenfant, Fabrice Télétchea, Marie-Laure Acolas, Marie-Laure Bégout Anras
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Philippe Lenfant, Fabrice Télétchea

Mots clés

Mots clés contrôlés

Méditerranée (mer)

Empoissonnement

Poissons de mer

Dentex

Téléostéens

Mots clés libres

Comportements

Dentex dentex

Diversité génétique

Expérimentations

Recensements visuels en plongée

Sciaena umbra

Télémétrie acoustique

Acoustic telemetry

Behaviour

Dentex dentex

Experimental tests

Genetic diversity

Sciaena umbra

Underwater visual census

Résumé

Le denti, Dentex dentex, et le corb, Sciaena umbra, sont deux espèces de poissons Téléostéens vivants le long des côtes méditerranéennes. Il s’agit de deux espèces emblématiques d’intérêt écologique, économique et patrimonial dans cette région, où ils sont malheureusement considérés comme menacés d’extinction par l’UICN. Au coeur de la mer Méditerranée, la plateforme corse de recherche et de production aquacole STELLA MARE maîtrise actuellement la reproduction et l’élevage de larves et juvéniles de denti et de corb. Suite à l’acquisition de ce savoir-faire zootechnique, ce projet de thèse s’inscrit dans une volonté de tester la faisabilité d’utiliser les juvéniles de D. dentex et de S. umbra, produits au sein de cette plateforme, à des fins de restauration active de populations autour de la Corse. Dans ce but, divers aspects ont été considérés. Dans un premier temps, des réponses comportementales et des performances individuelles ont été étudiées, en lien avec les conditions d’élevage et la taille des individus testés, chez des juvéniles d’élevage de denti et de corb. Ces tests expérimentaux en bassins ont permis de mettre en évidence un important effet de la taille i) sur les comportements et performances de nage, sur les comportements d’audace et d’exploration, sur les performances de fuite et sur les performances de prédation de S. umbra, ainsi que ii) sur la sensibilité à la manipulation et sur les performances de nage de D. dentex. De plus, un entraînement au nourrissage sur proies vivantes durant six jours a permis l’amélioration des performances de prédation de juvéniles des deux espèces. Dans un second temps, des actions expérimentales de relâchés de juvéniles de denti et de corb ont été effectuées in situ afin d’étudier la survie, la dispersion et les comportements de ces individus dans le milieu naturel, par le biais i) de suivis en plongée (UVC) et ii) d’un suivi par télémétrie acoustique. Il a été signalé que les juvéniles doivent être consciencieusement sélectionnés avant les relâchés afin d’éviter de potentielles anomalies morpho-anatomiques, en particulier pour le denti. Ces études ont permis d’atteindre, chez ces deux espèces, un très bon taux de survie (> 99 %) suite au transport, à la manipulation et l’acclimatation dans le milieu, avant le relâché. Le suivi par télémétrie acoustique a mis en évidence que les juvéniles de ces deux espèces semblent être capables d’amorcer leur acclimatation dans le milieu naturel mais se dispersent assez rapidement loin de la zone de relâché. Les juvéniles de corb semblent largement se dissimuler dans l’herbier de posidonie, et les juvéniles de denti n’ont que très peu été ré-observés lors des suivis en plongée. Dans un troisième temps, la diversité génétique des lots de juvéniles d’élevage a été étudiée chez ces deux espèces afin de la comparer avec celle retrouvée dans les populations sauvages. Cette étude a mis en évidence que les lots de géniteurs étudiés présentent une diversité génétique représentative de celle retrouvée in situ. Cependant, les lots de juvéniles présentent une différentiation génétique notable d’avec les populations sauvages du fait de la contribution majoritaire de seulement quelques individus, parmi l’ensemble des géniteurs, à la production de juvéniles. Ces travaux ont permis l’acquisition de nouvelles connaissances sur l’utilisation potentielle de juvéniles de D. dentex et S. umbra d’élevage à des fins de restauration active de populations. Cette thèse correspond ainsi à une approche pluridisciplinaire constituant la base d’un travail expérimental préalable à toute action de repeuplement.

The common dentex, Dentex dentex, and the brown meagre, Sciaena umbra, are two teleost fish inhabiting Mediterranean coastal waters. Dentex dentex and S. umbra are emblematic species of ecological, economic and cultural interest in the Mediterranean Sea, where they are under threat of extinction and redlisted by the IUCN. Located in the heart of the Mediterranean Sea, the Corsican platform STELLA MARE is a centre of scientific research and aquaculture production that has succeeded in captive breeding D. dentex and S. umbra and rearing their hatchery-produced juveniles. Following these aquaculture innovations, this project aimed to investigate the feasibility of using hatchery-reared D. dentex and S. umbra juveniles for restocking efforts in Corsican waters. First, behavioural responses and performance of hatchery-reared D. dentex and S. umbra juveniles were studied, linked to their rearing conditions and body size. These experiments highlighted a significant effect of body size i) on swimming behaviour, swimming performance, exploratory behaviour, boldness, escape performance and feeding performance of S. umbra juveniles, and ii) on handling sensitivity and swimming performance of D. dentex juveniles. Moreover, six days of feeding training led to higher feeding performance on live prey for hatchery-reared D. dentex and S. umbra juveniles. Second, experimental releases of D. dentex and S. umbra juveniles were performed in the wild to estimate post-release survival, dispersion and behaviours. These outcomes were investigated through i) underwater visual census (UVC) surveys and ii) an acoustic telemetry survey. These studies highlighted a high survival rate (> 99%) following transportation, handling and in situ acclimation for the two species. The acoustic telemetry survey highlighted that both species seemed to start acclimating to the natural environment and quickly dispersed away from the release site. Sciaena umbra juveniles seem to mostly hide in Posidonia oceanica meadows, and D. dentex juveniles were rarely observed during the UVC surveys. Finally, the genetic diversity of hatchery stocks was studied and compared to the genetic diversity of wild populations. This study highlighted that broodstocks’ genetic diversity was fairly representative of wild populations. However, significant genetic differentiation was observed between wild and juvenile samples as well as between juvenile and broodstock samples in both species. This seemed to be due i) to a very small effective number of breeders in S. umbra, and ii) to the presence of a few dominant reproductive breeders producing the majority of juveniles in D. dentex. In conclusion, the combination of these results provides new knowledge on the potential use of hatchery-reared D. dentex and S. umbra juveniles for restocking purposes. This project employs a multi-disciplinary approach and acts as a pilot study, providing a foundation for future potential restocking efforts.