Evaluation des interactions entre co-médications et survie sans rechute dans le cancer du sein à partir des données du SNDS
Auteur / Autrice : | Elise Dumas |
Direction : | Fabien Reyal, Chloé-Agathe Azencott |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Recherche clinique, innovation technologique, santé publique |
Date : | Soutenance le 14/12/2022 |
Etablissement(s) : | université Paris-Saclay |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Cancérologie, Biologie, Médecine, Santé |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Immunité et cancer (Paris ; 2009) |
référent : Université Paris-Saclay. Faculté de médecine (Le Kremlin-Bicêtre, Val-de-Marne ; 2020-....) | |
graduate school : Université Paris-Saclay. Graduate School Life Sciences and Health (2020-....) | |
Institution : École nationale supérieure des mines (Paris ; 1783-....) | |
Jury : | Président / Présidente : Emmanuel Bacry |
Examinateurs / Examinatrices : Emmanuel Bacry, Julie Josse, Charlotte Vaysse, Paul-Henry Cournède | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Julie Josse, Charlotte Vaysse |
Mots clés
Résumé
En 2018, 18,1 millions de nouveaux cas de cancers et 9,6 millions de décès par cancer ont été dénombrés dans le monde. Environ 50% des patients atteints de cancer ont de plus des pathologies au moment du diagnostic (co-morbidités) associées à la prise de médications chroniques (co-médications). Plusieurs études ont illustré l'influence des co-médications sur l'évolution à long-terme des cancers du sein (CS). L'objectif de la thèse est d'étudier l'impact des co-médications sur la survie pour l'ensemble de la population française des patientes atteintes de CS, à partir des données du Système National des Données de Santé (SNDS).Dans une première partie, nous présentons la construction de FRESH, une base de données structurée à partir du SNDS, incluant les informations socio-démographiques, les traitements reçus, les co-médications, les co-morbidities et la survie globale de l'ensemble des femmes françaises traitées pour un CS incident non métastatique d'emblée entre 2011 et 2017.Dans une deuxième partie, nous développons un algorithme d'apprentissage automatique capable d'identifier et de dater les récidives de CS à partir des séquences de traitements issues du SNDS. Cet algorithme permettra la structuration des rechutes dans la cohorte FRESH. Dans la troisième partie, nous analysons l'impact des co-medications sur la survie après CS à partir de méthodes d'inférence causale appliquées à la cohorte FRESH. Les molécules ayant un impact significatif sur le pronostic de CS font l'objet d'une étude mécanistique (médiation). En conclusion, nous dressons un atlas des interactions entre co-médications et survie après CS à l'échelle de la population française. Les interactions suggérées seront validées expérimentalement, et les molécules associées pourront faire l'objet d'alertes de pharmacovigilance ou être testés dans le cadre du repositionnement de médicaments.