Thèse soutenue

Mesure et causes écologiques de la phénologie des naissances chez les grands mammifères herbivores
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Auteur / Autrice : Lucie Thel
Direction : Christophe BonenfantSimon Chamaillé-Jammes
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Écologie
Date : Soutenance le 30/11/2021
Etablissement(s) : Lyon
Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation
Partenaire(s) de recherche : établissement opérateur d'inscription : Université Claude Bernard (Lyon ; 1971-....)
Laboratoire : Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive
Jury : Président / Présidente : Dominique Allainé
Examinateurs / Examinatrices : Christophe Bonenfant, Simon Chamaillé-Jammes, Anne Loison, Leif Egil Loe, Elise Huchard
Rapporteurs / Rapporteuses : Anne Loison, Leif Egil Loe

Résumé

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La phénologie des naissances est l’étude du positionnement et de la durée des périodes de naissance en lien avec ses facteurs directeurs et les conséquences qu’elle peut avoir sur les individus et les populations. Principalement régulée par des facteurs environnementaux, biotiques et internes à travers des processus évolutifs et des ajustements phénotypiques, la date de naissance a des répercussions à court et long terme sur la survie et le succès reproducteur des individus et sur la dynamique des populations. Discipline à l’origine ancienne, l’étude de la phénologie suscite à l’heure actuelle un vif intérêt en raison de sa sensibilité aux changements climatiques. Les méthodes employées pour l’étudier sont nombreuses et en constante évolution, mais des interrogations subsistent quant à la diversité des phénologies observables dans la nature et aux modifications auxquelles elles sont exposées. L’objectif de cette thèse est d’étudier la phénologie des naissances, depuis la validation des méthodes de collecte des données jusqu’à la mise en évidence des processus écologiques et évolutifs associés, avec pour objet d’étude les grands mammifères herbivores. Dans le premier chapitre, j’ai étudié la capacité des volontaires non-spécialistes à identifier la présence ou absence de jeunes individus sur des photographies produites par piégeage photographique dans le Parc National du Serengeti, en Tanzanie. Certaines limitations doivent encore être prises en compte afin d’utiliser ce type de données pour reconstruire une phénologie des naissances. Dans le deuxième chapitre, j’ai exploré et comparé les différentes méthodes utilisées pour décrire la phénologie des naissances chez les grands herbivores sur la base de simulations. J’ai ainsi réexaminé le cadre d’étude de la phénologie en termes de concepts et descripteurs mathématiques, discuté la diversité des métriques, et proposé des guides pour aider au choix de la méthode la plus adaptée. Dans le troisième chapitre, j’ai exploré l’effet de la date de naissance sur la survie des poulains, des jeunes d’un à deux ans et des juments chez les zèbres du Parc National de Hwange, au Zimbabwe. Leur survie diminuant à mesure que le temps passé en saison sèche augmente, les changements climatiques pourraient avoir des conséquences néfastes sur la dynamique de la population en lien avec leur phénologie des naissances. L’étude de la phénologie des naissances revêt un intérêt majeur dans la compréhension des risques encourus par les populations sauvages face aux changements climatiques, et l’inclusion du grand public à travers les sciences participatives permet une sensibilisation vis-à-vis de ces enjeux.