Thèse soutenue

Dissémination sous pression anthropique et de la saisonnalité de bactéries résistantes dans les fleuves du Liban
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Auteur / Autrice : Wadad Hobeika
Direction : Christophe DagotDolla Karam Sarkis
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Santé publique, épidémiologie, environnement et sociétés
Date : Soutenance le 16/12/2021
Etablissement(s) : Limoges en cotutelle avec Université Saint-Joseph (Beyrouth)
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences Biologiques et Santé (Limoges ; 2018-2022)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (Limoges)
Jury : Président / Présidente : Marie-Cécile Ploy
Examinateurs / Examinatrices : Christophe Dagot, Dolla Karam Sarkis, Gaby Khalaf, Carole Ayoub-Moubareck
Rapporteurs / Rapporteuses : Fabienne Petit, Thomas Guillard

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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L’évaluation de la contamination des fleuves majeurs au Liban par des bactéries résistantes aux agents antimicrobiens (BRAs) et des bactéries pathogènes à haut risque a été effectuée à travers des méthodes de culture standard en hiver 2018. Ainsi, la détection d’Enterobacterales et de Pseudomonas spp. résistants et de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline (SARM) a permis de déterminer des points sous haute pression anthropique de la (des) source(s) jusqu’aux estuaires des fleuves majeurs. Les estuaires de ces fleuves et des souches d’Enterobacterales sécrétrices de β-lactamase à spectre étendu isolées dans ces estuaires ont en plus fait l’objet d’une recherche du résistome à deux saisons différentes (au printemps et en hiver) par qPCR à haut débit. Deux indicateurs viraux de contamination fécale humaine, le crAssphage et le Torque Teno virus (TTV), ont été recherchés aux deux saisons au niveau des estuaires pour étudier l’association entre l’abondance en gènes de résistance aux agents antimicrobiens (GRAs) et la contamination fécale. L’approche combinée utilisant des techniques de culture et une qPCR à haut débit pour la détection de GRAs et de BRAs a permis d'identifier des points sous haute pression anthropique au niveau des fleuves majeurs libanais.