Caractérisation de gènes impliqués dans la pathogénicité de Scedosporium apiospermum

Characterization of genes involved in the pathogenicity of Scedosporium apiospermum

• Auteur / Autrice : Samar Kabbara
• Direction : Nicolas Papon, Monzer Hamze
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie, Virologie, Parasitologie
• Date : Soutenance le 22/06/2021
• Etablissement(s) : Angers
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Pathogène (Angers ; ....-2021) - Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène / GEIHP
• Jury : Président / Présidente : Bruno Le Cam
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Karine Dementhon, Rayane Rafei
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Marie-Elisabeth Bougnoux, Verónica Rodriguez-Nava

Mots clés

Mots clés contrôlés

Transduction du signal

Facteurs de transcription

Histidine kinases

Scedosporium apiospermum

Mucoviscidose

Mots clés libres

Voie TOR

Cystic fibrosis

TOR pathway

Histidine kinases

Transcription factors

Scedosporium

Résumé

Les voies de signalisation sont des circuits cellulaires permettant aux organismes de percevoir des signaux environnementaux et de développer une réponse adaptée. Plus particulièrement chez les microorganismes, ces voies de transduction sont de première importance dans le but de s’adapter aux contraintes liées à l’hôte. Dans ce cadre, une meilleure connaissance de ces circuits chez les pathogènes humains pourrait amener à l’identification de nouvelles cibles pour le développement d’antimicrobiens. De telles recherches s’inscrivent donc dans une démarche globale visant à soutenir la lutte contre les maladies infectieuses. Dans ce contexte, la première partie de ce travail a consisté en l’exploration in silico de la structure et la distribution des protéines histidine kinases chez les organismes eucaryotes. Ces protéines ‘senseurs’ jouent en effet un rôle majeur dans l’adaptation et la virulence des microorganismes et, de par leur absence chez les mammifères, elles constituent aujourd’hui des cibles thérapeutiques intéressantes. Dans une seconde partie, nous proposons une étude fonctionnelle de deux gènes codant des éléments intervenant dans des voies de signalisation cellulaire potentiellement impliquées dans l’adaptation du champignon pathogène Scedosporium apiospermum au microenvironnement bronchique rencontré dans le contexte de la mucoviscidose. Le premier gène code un facteur de transcription de la famille des domaines à doigts de zinc et le second une proteine kinase de la voie TOR. A son échelle, ce travail fournit de nouvelles connaissances sur les voies de signalisation cellulaires chez les microorganismes

Signaling pathways are cellular circuits that allow organisms to perceive environmental signals and develop an adapted response. More particularly, in microorganisms, these transduction pathways are of utter importance to adapt to host constraints. In this context, a better knowledge of these circuits in human pathogens could lead to identifying new targets for the development of antimicrobials. Therefore, such research is part of a comprehensive approach aiming at supporting the fight against infectious diseases. In this context, the first part of this work consisted of the in silico exploration of the structure and distribution of protein histidine kinases in eukaryotic organisms.These "sensor" proteins play a significant role in the adaptation and virulence of microorganisms and, due to their absence in mammals, they constitute interesting therapeutic targets. In a second part, we propose a functional study of two genes encoding elements involved in cell signaling pathways potentially implicated in the adaptation of the pathogenic fungus Scedosporium apiospermum to the bronchial microenvironment encountered in the context of cystic fibrosis. The first gene encodes a transcription factor belonging to the zinc finger domain family and the second a protein kinase of the TOR pathway. This work provides new knowledge on cell signaling pathways in microorganisms