Thèse soutenue

Utilisation de l’ADN circulant pour l’étude de l'hétérogénéité tumorale et l'évolution clonale en oncologie pédiatrique
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Auteur / Autrice : Mathieu Chicard
Direction : Gudrun Schleiermacher
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Date : Soutenance le 02/09/2020
Etablissement(s) : université Paris-Saclay
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Cancérologie, Biologie, Médecine, Santé
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Cancer, Hétérogénéité, Instabilité et Plasticité
référent : Faculté de médecine
Jury : Président / Présidente : Gilles Vassal
Examinateurs / Examinatrices : Frédérique Penault-Llorca, Pierre Saintigny, Valérie Michèle Elise Combaret, Ludovic Lacroix
Rapporteurs / Rapporteuses : Frédérique Penault-Llorca, Pierre Saintigny

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Les cancers pédiatriques représentent un défi thérapeutique, et une compréhension des mécanismes d’échappement aux traitements est nécessaire pour pouvoir développer de nouvelles approches thérapeutiques. L'ADN circulant peut être libéré par une tumeur dans les fluides corporels et permet de détecter et suivre des altérations génétiques tumorales par des prélèvements successifs peu invasifs tels qu'une prise de sang. Dans ce travail, une technique de séquençage de type « whole exome » (séquençage de l’ensemble des exons) de l’ADN circulant a été mis au point pour permettre l’étude des altérations génétiques tumorales dans le plasma chez des enfants atteints de cancer.Ces analyses soulignent la grande hétérogénéité génétique spatiale et temporelle des cancers pédiatriques. De plus, un rôle important de l’évolution clonale dans la progression de la maladie a ainsi pu être mis en évidence. Des approches utilisant les caractéristiques particuliers de l'ADN circulant ont également permis d’inférer le profil d’expression, basées sur l’empreinte des sites de début de transcription, ou le profil épigénétique de la tumeur. En plus d'une aide à une classification des tumeurs, ces particularités pourront aider à l'observation d'un changement d'identité cellulaire sous traitement. L'ADN circulant est donc un formidable outil pour mieux comprendre l'échappement aux traitements d'une tumeur par son hétérogénéité spatiale et temporelle et sa plasticité.