Thèse soutenue

Signatures métabolomiques et transcriptomiques de l'immunité antivirale chez Ostreococcus mediterraneus
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Auteur / Autrice : Rémy Marcellin-Gros
Direction : Gwenaël PiganeauDidier Stien
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie
Date : Soutenance le 11/12/2020
Etablissement(s) : Sorbonne université
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la nature et de l'Homme - Évolution et écologie (Paris)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Biologie intégrative des organismes marins (Banyuls-sur-Mer, Pyrénées-Orientales ; 2011-....)
Jury : Président / Présidente : Marcelino Suzuki
Examinateurs / Examinatrices : Eve Toulza, Jean-Luc Wolfender, Juliette Jouhet
Rapporteurs / Rapporteuses : Yonghua Li-Beisson, Sylvie Michel

Résumé

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Ostreococcus mediterraneus est un phytoplancton (microalgue) picoeucaryote à la base des réseaux trophiques marins côtiers. Ce phytoplancton est soumis à des attaques virales de grands virus nucléocytoplasmiques à ADN du genre Prasinovirus dont la souche Ostreococcus mediterraneus Virus 2 (OmV2) fait partie. Au sein de populations de microalgues sensibles au virus il a été observé l’émergence spontanée de phénotypes immunitaires résistants. Les bases génétiques de cette résistance ont récemment été décrites chez Ostreococcus : elles semblent véhiculées par un chromosome immunitaire atypique appelé SOC (Small Outlier Chromosome). Dans ce contexte nous avons cherché à caractériser les signatures métabolomiques et transcriptomiques de cette immunité au travers d’une approche visant à corréler ces deux niveaux d’expression. Des métabolites lipidiques biomarqueurs (galactolipides, phytostérols, sphingolipides) de chaque profil immunitaire ainsi que les gènes associés à leur métabolisme ont été identifiés. Ces données ont été mis en perspective des résultats de l’analyse métabolomique du virus afin d’identifier des voies métaboliques sollicitées et détournées par le virus lors de l’infection.