Thèse soutenue

Etude des mécanismes d'assemblage co-traductionnel des complexes protéiques impliqués dans la transcription dans les cellules de mammifère
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Auteur / Autrice : Pooja Mukherjee
Direction : Laszlo Tora
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Date : Soutenance le 20/09/2019
Etablissement(s) : Strasbourg
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
Jury : Président / Présidente : Martine Collart
Examinateurs / Examinatrices : Laszlo Tora, Martine Collart, Joseph Marsh, Thomas Sexton
Rapporteurs / Rapporteuses : Martine Collart, Joseph Marsh

Résumé

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La majorité des processus biologiques sont réalisés par des complexes protéiques multisubunités dans les cellules et une quantité importante d'énergie est requise par les cellules pour construire ces énormes complexes. Contrairement aux bactéries, les gènes codant pour les protéines sont dispersés dans le génome des eucaryotes, ce qui complique la compréhension de l'assemblage des complexes protéiques. En utilisant l'immunoprécipitation d'ARN suivie par la détection des ARNm à l'échelle du génome par analyse par micropuce, ARN molécule unique, FISH, immunofluorescence, cellules souches embryonnaires knock-out de souris et approches de permutation de domaines, nous montrons que les complexes de transcription multisubunit de mammifère s'assemblent de manière co-traductionnelle. Nous démontrons que les domaines de dimérisation et leurs positions dans les sous-unités en interaction déterminent la voie d'assemblage de co-traduction (simultanée ou séquentielle). En outre, les expériences cytoplasmiques IF-smFISH et bicolores smFISH indiquent que l'assemblage de co-traduction décrit se produit clairement dans le cytoplasme de cellules humaines. Des résultats identiques dans les cellules de levure, de souris et humaine suggèrent que l'assemblage par co-traduction est un mécanisme général chez les eucaryotes, qui pourrait être nécessaire pour éviter les interactions non spécifiques et l'agrégation de protéines dans la cellule.