Synaptic and cellular mechanisms underlying functional responses in mouse primary visual cortex

par Marta Gajowa

Thèse de doctorat en Interdisciplinaire

Sous la direction de Lyle Graham.

Soutenue le 23-11-2018

à Sorbonne Paris Cité , dans le cadre de École doctorale Frontières de l'innovation en recherche et éducation (Paris ; 2006-....) , en partenariat avec Université Paris Descartes (1970-2019) (établissement de préparation) et de Laboratoire de Neurophotonique / UMR 8250 (laboratoire) .

Le président du jury était Alain Destexhe.

Le jury était composé de Lyle Graham, Alain Destexhe, Brice Bathellier, Laurence Cathala, Federico Francisco Trigo Quiñones.

Les rapporteurs étaient Alain Destexhe, Brice Bathellier.

mots clés

• Cortex visuelle
• Électrophysiologie in vivo
• Pince dynamique
• Conductance synaptique
• Biophysique neuronale
• Optogénétique
• Synapses
• Transmission nerveuse
• Aire visuelle

Titre traduit

Mécanismes synaptiques et cellulaires sous-tendant aux réponses fonctionnelles dans le cortex visuel primaire de la souris

Résumé

L'élaboration de l'information dans le cerveau est basée sur les propriétés des neurones qui analysent leurs inputs et génèrent les potentiels d'actions, ainsi que sur un réseau synaptique d'une complexité beaucoup plus importante que ce que l'homme peut créer. Mon projet consiste à étudier ces éléments dans le cortex visuel de la souris, pour décrire comment ils permettent aux neurones de répondre à des caractéristiques du scène visuelle. Je développe des outils optogénétiques pour pouvoir stimuler des neurones individuels in vivo, ce qui va ensuite être intégré avec des mesures de leur réponse visuelle pour déterminer le circuit synaptique fonctionnel Je vais ensuite faire des mesures précises des inputs synaptiques évoqués par les stimuli visuels, suivies des réinjections des reconstructions statistiques de ces inputs dans le même neurone, établir des limites biophysiques permettant de déchiffrer le code neuronal dans des conditions normales et pathologiques.

mots clés

• Visual cortex
• Electrophysiology in vivo
• Dynamic clamp
• Synaptic conductance
• Neuronal biophysics
• Optogenetics

Résumé

Feature selectivity of cortical neurons, one example of functional properties in the brain, is the ability of neurons to respond to particular stimulus attributes - e.g. the receptive field of a neuron in the primary visual cortex (V1) with respect to object movement direction. This thesis contributes to understanding how feature selectivity arises in mouse V1. It is divided into two parts, each based on distinct approaches to elucidate visual processing mechanisms, the first at a population level and the second at the single neuron level. First, on a population level, I have developed tools towards an eventual project that combines 2-photon optogenetics, 2-photon imaging and traditional whole-cell electrophysiology to map functional connectivity in V1. This map will provide a link between cell tuning (i.e. cell function) and network architecture, enabling quantitative and qualitative distinction between two extreme scenarios in which cells in mouse V1 are either randomly connected, or are associated in specialized subnetworks. Here I describe the technical validation of the method, with the main focus on finding the appropriate biological preparation and reagents. Second, based on whole-cell patch recordings of single mouse V1 neurons in vivo, I characterize the neuronal input-output (I/O) transfer function using current and conductance inputs, the latter intended to mimic the biophysical properties of synapses in a functional context. I employ a novel closed-loop in vivo protocol based on a combination of current, voltage and dynamic clamp recording modes. I first measure the basic I/O transfer function of a given neuron with current and conductance steps, under current and dynamic clamp, respectively. I then measure the visually evoked spiking output, under current clamp, and the synaptic conductance input, under voltage clamp, to that neuron. Finally, I reintroduce variations of the visually-evoked conductance input to the same cell under dynamic clamp. In that manner, I describe an I/O transfer function which allows a characterization of the mathematical operations performed by the neuron during functional processing. Furthermore, modifications of the relative scaling and the temporal characteristics of the excitatory and inhibitory components of the reintroduced synaptic input, enables dissection of each component's role in shaping the spiking output, as well as to infer overall differences between various physiological cell types (e.g. regular-adapting, presumably excitatory, versus fast-spiking, presumably inhibitory, neurons). Finally, examination of the transfer functions, in particular their dependence on temporal modifications, provides insights on the relationship between the neuronal code and the biophysical properties of neurons and their network.