Thèse soutenue

Rôle complexe de l’uridylation dans le métabolisme des ARNm chez Arabidopsis thaliana
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Auteur / Autrice : Hélène Scheer
Direction : Dominique Gagliardi
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Date : Soutenance le 28/09/2018
Etablissement(s) : Strasbourg
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg)
Jury : Président / Présidente : Sébastien Pfeffer
Examinateurs / Examinatrices : Dominique Gagliardi, Sébastien Pfeffer, Dominique Weil, Jean-Marc Deragon
Rapporteurs / Rapporteuses : Dominique Weil, Jean-Marc Deragon

Résumé

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La dégradation des ARNm participe à la régulation de l’expression des gènes, régulation essentielle au développement et à la survie des organismes. L’uridylation des ARNm favorise leur dégradation et est un processus conservé chez la plupart des eucaryotes. Mes travaux de thèse ont porté sur la caractérisation de URT1, une TUTase responsable de l’uridylation des ARNm chez Arabidopsis. J’ai notamment établi une chaine d’interactions entre URT1 et des facteurs impliqués dans l’inhibition de la traduction. Ces interactions sont probablement conservées dans l’ensemble des plantes terrestres. De plus, je montre grâce à une méthode d’analyse par séquençage à haut-débit des extrémités 3’ d’ARNm candidats que le niveau d’expression de URT1 ou de différentes versions mutées ou tronquées peut contrôler les profils de distributions de taille des queues poly(A) uridylées et non-uridylées. De manière très intéressante, la modification de ces profils de distributions est associée à la répression de l’expression d’un gène rapporteur, sans modification de l’accumulation des ARNm correspondants. Mes résultats contribuent à une meilleure compréhension des rôles moléculaires de l’uridylation des ARNm chez Arabidopsis et ouvrent des perspectives nouvelles quant à la diversité des rôles de l’uridylation dans le métabolisme des ARNm.