Nouvelles méthodes moléculaires de criblage haut débit d’Ehrlichia ruminantium dans les tiques et caractérisation génétique des souches au Mozambique et à échelle mondiale

par Michèle Cangi

Thèse de doctorat en Physiologie et biologie des organismes - populations - interactions

Sous la direction de Olivier Gros, Nathalie Vachiery et de Luis Neves.

Soutenue le 30-01-2017

à l'Antilles , dans le cadre de École doctorale pluridisciplinaire (Pointe-à-Pitre ; 19..-2015) .

Le jury était composé de Christine Maritz-Olivier, Eric Duchaud, Nicola Collins, Jérôme Guerlotte.

Les rapporteurs étaient Christine Maritz-Olivier, Eric Duchaud.

mots clés

• Ehrlichia ruminantium
• Typage de séquence multi locus
• Molecular diagnostic
• Maladie transmise par les tiques
• Cowdriose
• Prévalence
• Diversité génétique
• Génétique moléculaire -- Maladies -- Modèles animaux
• Cowdriose -- Ruminants -- Résistance aux acaricides -- Diagnostic moléculaire
• Diagnostic moléculaire -- Régions tropicales

Résumé

Ehrlichia ruminantium est l'agent causal de la cowdriose, une maladie tropicale mortelle des ruminantstransmis par les tiques Amblyomma. Jusqu'à présent, il n'existe pas de vaccin efficace dû à la faible protection croisée des souches vaccinales vis-à-vis des isolats de terrain. Ceci est principalement lié àdiversité génétique d'E. ruminantium au sein les zones géographiques. Par conséquent, la caractérisation de lastructure génétique de la population d'E. ruminantium à l'échelle mondiale et régionale est importante pour définir les meilleures stratégies de contrôle et améliorer les stratégies de surveillance de la cowdriose.

mots clés

• Ehrlichia ruminantium
• Multilocus sequence typing
• Molécular diagnostic
• Tick-borne disease
• Heartwater
• Prévalence
• Génétic Diversity

Titre traduit

New molecular high throughput methods for Ehrlichia ruminantium tick screening and characterization of strain genetic structure in Mozambique and at worldwide scale

Résumé

Ehrlichia ruminantium is the causal agent of heartwater, a ruminant tropical fatal diseasetransmitted by Amblyomma ticks. Up to now, no effective vaccine is available due to a limitedcross protection of vaccinal strains on field isolates mainly associated to a high geneticdiversity of E. ruminantium within geographical locations. Thus, both characterization of E.ruminantium genetic population structure at worldwide and regional scale and estimation of E.ruminantium tick prevalence are important to delimitate better control strategies and improveheartwater monitoring strategies