Interactions microbiennes et adaptations en milieu extrême : peptides antimicrobiens d’archées halophiles

Microbial interplays and adaptations in extreme environment : antimicrobial peptides produced by halophilic archaea

• Auteur / Autrice : Alison Besse
• Direction : Sylvie Rebuffat, Alyssa Carré-Mlouka
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance le 23/09/2016
• Etablissement(s) : Paris, Muséum national d'histoire naturelle
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la nature et de l'Homme - Évolution et écologie (Paris)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : UMR 7245 - Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM)
• Jury : Président / Présidente : Alain Dufour
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Arnaud Huguet, Mohamed Jebbar

Mots clés

Mots clés contrôlés

Compétition (biologie)

Archéobactéries

Mots clés libres

Milieux extrêmes

Environnements hypersalins

Archées

Compétitions microbiennes

Peptides antimicrobiens

Halocines

Extreme environments

Hypersaline Environments

Archea

Microbial Competitions

Antimicrobial peptides

Halocines

Résumé

Les archées halophiles sont des procaryotes vivant dans des conditions d’extrême salinité. Ces micro-organismes colonisent les environnements hypersalins et synthétisent des peptides antimicrobiens appelés halocines, qui pourraient leur conférer un avantage sélectif sur leurs compétiteurs. Parmi les peptides antimicrobiens d’archées halophiles décrits, on distingue l’halocine C8, initialement purifiée à partir de la souche halophile Natrinema sp. AS7092. Ce travail de thèse a permis de montrer que la production d’halocine C8 était conservée chez plusieurs archées halophiles appartenant aux genres : Natrinema, Haloterrigena, Haloferax et Halobacterium. Une activité antimicrobienne associée des particules supérieures à 100 kDa non infectieuses suggère que l’halocine C8 pourrait être localisée dans des vésicules membranaires. Ce travail présente des résultats qui déboucheront sur une meilleure compréhension des compétitions microbiennes dans les environnements hypersalins et du rôle écologique des halocines.

Halophilic archaea are prokaryotes living in extremely high salinity conditions. Those microorganisms thrive in hypersaline environments and produce antimicrobial peptides named halocins, which may confer them a selective advantage over competitors. Among the known antimicrobial peptides produced by halophilic archaea, halocin C8 had been initially purified from the halophilic strain Natrinema sp. AS7092. This work demonstrates that halocin C8 production is conserved among several halophilic archaea belonging to genera Natrinema, Haloterrigena, Haloferax and Halobacterium. An antimicrobial activity has been associated with non-infectious particles larger than 100 kDa, suggesting that halocin C8 could be localized in membrane vesicles. Results obtained from this work will lead to a better understanding of microbial competitions arising in hypersaline environments and the ecological role of halocins