Auteur / Autrice : | Catherine Voegele |
Direction : | James McKay |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Bioinformatique |
Date : | Soutenance le 27/11/2015 |
Etablissement(s) : | Lyon 1 |
Ecole(s) doctorale(s) : | École Doctorale de Biologie Moléculaire Intégrative et Cellulaire (Lyon) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Centre international de recherche sur le cancer |
Jury : | Président / Présidente : Joël Lachuer |
Examinateurs / Examinatrices : Françoise Galateau-Sallé, David Cox | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Anke Van den Berg, Tom Gaunt |
Mots clés
Résumé
L'objectif de mon travail de thèse était de développer des outils bio informatiques permettant d'améliorer la traditionnelle gestion de l'information scientifique au sein d'un grand centre de recherche et en particulier au sein d'une plateforme de génomique. Trois outils ont été développés: un cahier de laboratoire électronique, un système de gestion de l'information de laboratoire pour des applications de génomique dont le séquençage de nouvelle génération, ainsi qu'un système de gestion des échantillons pour de grandes bio-banques. Ce travail a été réalisé en étroite collaboration avec des biologistes, épidémiologistes et informaticiens. Il a également inclus la mise en place d'interactions entre les différents outils pour former un système informatique intégré. Les trois outils ont été rapidement adoptés par l'ensemble des scientifiques du centre de recherche et sont désormais utilisés au quotidien pour le suivi de toutes les activités de laboratoire mais aussi plus globalement pour les autres activités scientifiques du centre de recherche. Ces outils sont transposables dans d'autres instituts de recherche