Caractérisation fonctionnelle de BamB, protéine impliquée dans la biogénèse de la membrane externe et la virulence de Salmonella

Functional caracterization of BamB, a protein involved in outer-membrane biogenesis and Salmonella virulence

• Auteur / Autrice : Fatémeh Namdari
• Direction : Isabelle Virlogeux-Payant
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la Vie et de la Santé
• Date : Soutenance le 26/03/2013
• Etablissement(s) : Tours
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Infectiologie et santé publique (Tours)
• Jury : Président / Présidente : Agnès Rosenau-Ilias
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean Yves Madec, Christophe Grangeasse
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Françoise Norel-Bozouklian, Rome Voulhoux

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bactéries Gram négatives

Salmonelloses

Cytoplasme

Sérine / thréonine kinases

Lipoprotéines

Triiodothyronine

Virulence (microbiologie)

Membranes (biologie)

Origine de la vie

Résistance aux antibiotiques

Salmonelles

Mots clés libres

Salmonella

BamB

Complexe BAM

Biogénèse de la membrane externe

Protéines de membrane externe (PME)

Appareils de sécrétion de type III (T3SS)

Virulence

Salmonella

BamB

BAM complex

Outer-membrane biogenesis

Outer membrane proteins (OMP)

Type III-secretion systems (T3SS)

Virulence

Résumé

La protéine BamB est une lipoprotéine de membrane externe appartenant au complexe BAM (β-Barrel Assembly Machinery) et impliquée dans l’assemblage des protéines de membrane externe (PME), la sensibilité aux antibiotiques, le contrôle de l’expression des trois systèmes de sécrétion de type III (T3SS) et la virulence de Salmonella. Chez E. coli, au sein du complexe BAM, elle interagit directement avec la protéine BamA. De plus, chez cette bactérie, BamB présente une activité sérine-thréonine kinase. Afin de mieux caractériser le rôle de BamB, nos objectifs ont été d’étudier (1) l’impact de l’altération de l’interaction de BamB avec le complexe BAM ou de sa séquestration dans le cytoplasme sur l’ensemble des rôles décrits de BamB et (2) l’activité kinase putative de BamB chez Salmonella. Nos résultats montrent que certains rôles de BamB sont dissociables entre eux et que l’interaction BamA/BamB n’est pas requise pour le rôle de BamB dans le contrôle de l’expression des T3SS, la virulence de Salmonella et l’assemblage des PME à la membrane externe. Aucune activité kinase ni aucune activité cytoplasmique de la protéine n’a pu être formellement démontrée.

BamB is an outer-membrane lipoprotein belonging to the BAM complex (β-Barrel Assembly Machinery). In Salmonella, it is involved in the assembly of outer membrane proteins (OMP), in antibiotic susceptibility, in the transcriptional control of the three Type-Three-Secretion-Systems (T3SS) related genes and also in virulence. In E. coli, BamB interacts directly with the BamA protein. Moreover, BamB has been shown to have a serine-threonin kinase activity in this bacterium. In order to better characterize the roles of the BamB protein, our purposes were to study (1) the impact of the alteration of the interaction of BamB with the BAM complex or of its cytoplasmic sequestration and (2) its putative kinase activity in Salmonella. Our results show that some of the BamB roles are dissociable and that the BamA/BamB interaction is not required for T3SS expression, Salmonella virulence or OMP assembly in the outer membrane. Currently, neither a kinase activity nor a cytoplasmic activity has been clearly demonstrated for this protein.