Epidémiologie de Tropheryma whipplei

Epidemiology of Tropheryma whipplei

• Auteur / Autrice : Alpha Kabinet Keita
• Direction : Florence Fenollar
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Pathologie humaine. Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 08/10/2013
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Unité de recherche sur les maladies infectieuses et tropicales émergentes (Marseille)
• Jury : Président / Présidente : Didier Raoult
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Florence Fenollar, Didier Raoult, Max Maurin, Patricia Renesto
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Max Maurin, Patricia Renesto

Mots clés

Mots clés contrôlés

Infections à Actinomycetales

Transmission de maladie infectieuse

Réservoirs d'agents pathogènes

physiologie

isolement et purification

Tropheryma

microbiologie

épidémiologie

Maladie de Whipple

Mots clés libres

Tropheryma whipplei, Epidemiologie, Salive, Selles

Tropheryma whipplei, Epidemiology, Saliva, Stools

Résumé

Tropheryma whipplei est détectée avec une prévalence variable dans les selles et de salive. Pour déterminer les facteurs épidémiologiques qui peuvent influencer l'histoire naturelle de la bactérie, nous avons réalisé des études sur l'ensemble de la population de 2 villages au Sénégal (Dielmo et Ndiop), chez les personnes sans domicile fixe (SDF) et dans les familles en France. Dans ces différentes populations, la prévalence du portage de T. whipplei dans les selles était respectivement de 31.2% (139/446), 12,9% (21/162) et 37,5% (24/64). En ce qui concerne les résultats des études phylogénétiques, nous avons identifié au Sénégal 22 génotypes, dont 16 étaient nouveaux. Un seul génotype (53) était commun aux deux villages. Parmi les génotypes spécifiques, l'un (n ° 52) était épidémie à Dielmo (15/28, 53,4%, p <10-3) et l'autre (n ° 49) à Ndiop (27,6%, p = 0,002). Deux génotypes, le génotype 3 et le génotype 85, circulent plus fréquemment chez les SDF par rapport à d'autres groupes personnes positives pour T. whipplei. Au Sénégal, la séroprévalence était estimée à 72,8% (291/400). Dans les familles, la séroprévalence était plus élevée chez les membres (23/30, 77%) par rapport à la population générale (143/300, 48%). Nos résultats montrent que T. whipplei est une bactérie fréquente et contagieuse qui est contractée très tôt dans l'enfance. La mise en évidence de génotypes épidémiques associée à l'absence de la bactérie dans des échantillons d'eau, chez les arthropodes vecteurs; la très faible présence (<1%) dans les selles des animaux domestiques et dans les écouvillons de poussière suggèrent une transmission interhumaine du T whipplei.

Tropheryma whipplei is detected with variable prevalence in stool and saliva. To investigate the epidemiological factors which influences the natural history of the bacterium; we performed studies in entire population of 2 villages in Senegal (Dielmo and Ndiop) in homeless people and in family in Marseille-France. In these populations, the prevalence of T. whipplei in stool was respectively 31.2% (139/446), 12.9% (21/162) and 37.5% (24/64).Regarding findings from phylogenetic studies we identified in Senegal 22 genotypes, 16 of which were new. Only one genotype (#53) was common to both villages. Among the specific genotypes, one (#52) was epidemic in Dielmo (15/28, 53.4%, p<10-3) and another (#49) in Ndiop (27.6%, p=0.002). Two genotypes, the genotype 3 and the genotype 85, circulate more frequently in the homeless people compared to other people positive for T. whipplei and are epidemic. The same circulating genotype was significantly more common in families compared to other people. In Senegal, the seroprevalence was estimated at 72.8% (291/400). In family study, the seroprevalence was higher in the relatives (23/30, 77%) compared to the general population (143/300, 48%). Our findings show that T. whipplei is a common and contagious bacterium that is contracted early in childhood. Epidemic genotypes associated with absence of the bacterium in water samples, arthropods vector; almost no presence (< 1%) in domestic animals and dust suggest a human transmission of T whipplei.