Thèse soutenue

Les protéines RGK, des petites protéines G atypiques : caractérisation structurale et biochimique du cycle GDP/GTP de Rem2
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Auteur / Autrice : Philippe Reymond
Direction : Julie Menetrey
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biochimie et Biologie Structurale
Date : Soutenance en 2012
Etablissement(s) : Paris 6

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Les protéines RGK sont une famille de petites protéines G, impliquées notamment dans la morphologie et la migration cellulaires. Les protéines RGK possèdent de larges extensions en N- et C-terminus du domaine G minimal, capables de recruter différents partenaires. Ces protéines présentent aussi des substitutions aux positions clés pour la reconnaissance et l'hydrolyse du GTP comme le motif [DTAGQ] remplacé par un motif [DxWEx]. Ces éléments soulèvent plusieurs questions comme la capacité des protéines RGK à sentir la présence du GTP ou un possible changement conformationnel des régions Switch lors du cycle GDP/GTP. La détermination de la structure du domaine G des protéines RGK a mis en lumière le motif [DxWEx] comme pouvant être à l’origine de ces propriétés structurales atypiques. Objectifs – Ma thèse a consisté à compléter la caractérisation structurale des protéines RGK en étudiant leur liaison au GTP ; le rôle des extensions ; et l’interaction avec deux de ces partenaires, la Calmoduline et GMIP. Résultats – Nous avons montré que les extensions sont des régions désordonnées qui rendent l’étude des protéines RGK entières en solution difficile. Nous avons mené une étude des propriétés cinétiques du cycle GDP/GTP du domaine G de Rem2 sauvage et d’un mutant du motif [DxWEx], et avons déterminé la structure de Rem2 liée au GDP. Conclusion – Ce travail met en lumière la flexibilité des régions Switch en absence des extensions et suggère que le tryptophane du motif [DxWEx] est un élément important. Il provoque un réarrangement drastique du Switch I et l’empêche de venir se replier sur le nucléotide. Le début du Switch II est contraint à adopter une conformation particulière