Thèse soutenue

Synthèse d’analogues d’aminoglycosides par voie chimique et ingénierie métabolique : Application à l’étude des ARN par RMN du fluor
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Auteur / Autrice : Thomas Lombès
Direction : Laurent MicouinFrédéric Dardel
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Chimie
Date : Soutenance le 26/10/2012
Etablissement(s) : Paris 5
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Frontières de l'innovation en recherche et éducation (Paris ; 2006-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Synthèse et structure de molécules d'interet pharmacologique - Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques
Jury : Président / Présidente : Jean-Luc Pernodet
Examinateurs / Examinatrices : Laurent Micouin, Frédéric Dardel, Jean-Luc Pernodet, Dominique Fourmy, Boris Vauzeilles, Andreas Kirschning
Rapporteurs / Rapporteuses : Dominique Fourmy, Boris Vauzeilles

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Les ARN constituent des cibles thérapeutiques extrêmement intéressantes bien qu’encore assez peu exploitées. En effet, les obstacles pour la conception de ligands spécifiques de ces cibles non traditionnelles, polyanioniques et très flexibles, sont encore loin d’être levés. Les aminoglycosides, utilisés depuis longtemps pour leurs propriétés antibiotiques, sont souvent décrits comme des « ligands universels » d’ARN. Leur structure constitue donc une architecture favorable pour l’élaboration de nouveaux ligands spécifiques des ARN.Le but de cette thèse a été de développer une méthode systémique originale combinant chimie organique et microbiologie pour synthétiser de nouvelles molécules de structure analogue aux aminoglycosides, se fixant de façon spécifique sur des cibles ARN. Ce travail repose sur la compréhension récente des voies de biosynthèse des aminoglycosides permettant leur ingénierie rationnelle selon une stratégie de mutasynthèse. Cette approche expérimentale s’appuie sur la conception de mimes de métabolites naturels pouvant être transformés par des bactéries génétiquement modifiées. Le développement de méthodologies novatrices en ingénierie métabolique, synthèse organique et chimie analytique nous a permis de concevoir des analogues d’aminoglycosides fluorés qui se sont avérées être d’excellentes sondes dans l’étude des ARN par RMN du fluor.