Etude de la régulation épigénétique de l'allèle Abr du gène Agouti chez la race bovine normande

par Fella Lamia Hadj-Rabia

Thèse de doctorat en Biologie, Sciences, Santé

Sous la direction de Ahmad Oulmouden.

Soutenue en 2011

à Limoges , en partenariat avec Université de Limoges. Faculté des sciences et techniques (autre partenaire) .

mots clés

• Agouti
• Allèle Abr
• Normande (race bovine) -- Thèses et écrits académiques
• Épigénétique -- Bovins -- Thèses et écrits académiques
• Séquences LINE -- Boeuf (viande) -- Thèses et écrits académiques
• Méthylation -- Boeuf (viande) -- Thèses et écrits académiques
• Pigments animaux -- Boeuf (viande) -- Thèses et écrits académiques

Résumé

Le travail décrit dans ce mémoire est une contribution apportée aux recherches axées sur les mécanismes épigénétiques. Plus particulièrement, ont été étudiées les mécanismes épigénétiques qui régissent l'expression du promoteur LINE porté par l'allèle Abr. La couleur de robe de la race bovine Normande se caractérise par un mélande de poils noirs et de poils rouges (bringeure) dont la proportion est variable entre les animaux et au niveau des différentes régions de la peau du même animal. Notre équipe a identifié l'allèle Abr du gène Agouti qui est responsable de ce paron de coloration complexe. Dans la première partie de ce travail nous démontrons que le promoteur du LINE possède une activité transcriptionnelle en utilisant différents gènes rapporteurs. Par ailleurs nous avons démontré que les sites d'initiation de la transcription sont influencés par les séquences adjacentes au promoteur. Dans la deuxième partie nous montrons que la méthylation du promoteur du LINE est l'une des facettes du processus épigénétique qui régule son expression variable entre les animaux et au sein du même animal. En effet, nous avons montré que l'expression variable du gène Agouti est proportionnelle au degré de méthylation du promoteur du LINE. Par ailleurs, nous montrons que cette régulation épigénétique dépend du fond génétique des animaux à l'instar des données acquises pour un allèle similaire chez la souris.

Titre traduit

Study of epigenetic regulation of Abr allele Agouti gene of the normande breed

Résumé

The work describeb in this manuscript is a contribution to the comprehension of the epigenetic mechanisms that control the variable expression ot the LINE promoter of the Abr allele. The coat color of the Normande cattle breed is characterized by a mixture of black and red hairs (brindle) whose proportion varies between animals and a different regions of the skin of the same animal. Our team has identified the Abr allele Agouti gene which is responsible for this coat color pattern. In the first part of this work we demonstrate, using different reporter genes, that the LINE promoter has a transcriptional activity. By RACE experiments wa have been able to determine the initiation sites of transcription which are influenced by adjacent sequences of the promoter. In the second part we show the methylation of the LINE promoter is one facet of epigenetic process that regulates its variable expression between animals and within the same animal. Indeed we have shown the the variable expression of Agouti gene is proportionnal to the degree of promoter methylation of the LINE. Furthermore, we show that this epigenic regulation depends on the genetic background of animals as reported for the allele of Agouti homologous in mice.