Thèse soutenue

Réalisation d'ontologies de tâches et de domaine en bioinformatique et utilisation de la sémantique pour l'appariement semi-automatique de services Web
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Auteur / Autrice : Nicolas Lebreton
Direction : Anita BurgunOlivier Dameron
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Médecine. Génie biologique et médical
Date : Soutenance en 2010
Etablissement(s) : Rennes 1
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Vie-Agro-Santé (Rennes)
Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université européenne de Bretagne (2007-2016)

Mots clés

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Résumé

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Les tâches bioinformatiques impliquent une analyse des données à une grande échelle qui requiert l'intégration de services Web à partir de plates-formes hétérogènes. La composition des services Web est faite en utilisant des workflows qui sont paramétrés manuellement par des utilisateurs. Il est désirable de pouvoir améliorer cette composition pour faciliter les analyses biologiques. La contribution de notre travail est de valider notre approche en démontrant comment une description suffisamment riche des services Web autorise leur composition semi-automatique. Nous proposons un algorithme qui une fois l'ordre des services déterminé par l'utilisateur, va vérifier la compatibilité sémantique des sorties des services Web avec les entrées des services Web suivants. Les résultats montrent que les technologies existantes supportent la semi-automatisation de la composition des services Web, et que le facteur limitant est le manque d'ontologies de domaine et de tâches suffisamment précises.