Auteur / Autrice : | Pierre-Jean Matteï |
Direction : | Andréa Dessen |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biochimie et biologie structurale |
Date : | Soutenance en 2010 |
Etablissement(s) : | Grenoble |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale chimie et science du vivant (Grenoble ; 199.-....) |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
La première partie de cette thèse s'intéresse au complexe PBP2 :MreC impliqué dans l'élongation d' Helicobacter pylori, pathogène responsable de pathologies gastriques. Ce complexe a pu être mis en évidence in vitro dont nous avons déterminé la stoechiométrie par différentes méthodes. Ce complexe 1 : 1 a été analysé par diffusion des rayons X aux petits angles permettant de modéliser une enveloppe du complexe à basse résolution. Des cristaux du complexe ont été obtenus ainsi qu'un jeu de données à 2. 7 A. Par remplacement moléculaire, un domaine très conservé des PBP a pu être placé mais la présence de MreC est encore discutable. La seconde partie s'intéresse au système de sécrétion de type III, facteur de virulence majeur chez Pseudomonas a eruginosa , bactérie causant des maladies nosocomiales. PopB et PopD, deux protéines membranaires, forment un pore au niveau de la membrane d'une cellule-cible, nécessaire à la translocation de toxines. PopB a été purifiée sous forme soluble en présence de sa chaperonne, PcrH, complexe dissociable en présence de détergents et lipides. PopB seule, serait capable d'oligomériser en hexamère en formant des structures annulaires. La topologie du pore a également été déterminée dans des liposomes montrant ainsi que Po pB est insérée dans la membrane alors que PopD n'est associée que superficiellement. Pour finir, la structure de PcrH, a été résolue avec un peptide de PopD. Les résidus de Pc rH intervenant dans ce complexe sont essentiels à la sécrétion de PopD et à la formation du pore de translocation. Nous cherchons actuellement de petites molécules qui seraient capables d'interagir avec Pc rH et empêcheraient son interaction avec PopB et PopD.