Variabilité génétique des virus herpès simplex : épidémiologie moléculaire et résistance aux antiviraux

par Claire Deback

Thèse de doctorat en Virologie

Sous la direction de Henri Agut.

Soutenue en 2009

à Paris 6 .

mots clés

• HSV-1 [Virus herpes simplex]
• Hsv-2
• Pneumopathie herpétique
• Epidémiologie
• Microsatellite
• Résistance
• Cidofovir

Résumé

La variabilité génétique des virus herpes simplex 1 (HSV-1) et 2 (HSV-2) a été étudiée sur le plan épidémiologique et sur celui de leur résistance aux antiviraux. Dans une première partie, nos travaux portent sur la pneumopathie herpétique (HSV BPn). Lors d’une étude clinique prospective chez des patients intubés et ventilés, 42 patients (21%) ont présenté une HSV BPn Une association significative a été montrée entre la présence d’HSV-1 dans l’oropharynx et l’ HSV BPn. L’analyse moléculaire montre que les HSV BPn font suite à la réactivation d’HSV-1 dans l’oropharynx, sans transmission nosocomiale. Dans une seconde partie, un test de sensibilité aux antiviraux des HSV par PCR en temps réel a été mis au point. Ce test est corrélé avec la technique de réduction des plages de lyse pour l’aciclovir et le foscarnet, mais ne l’est pas pour le cidofovir (CDV). L’analyse phénotypique et génotypique des souches d’HSV-2 isolées de patients ayant présenté une résistance clinique au cidofovir, a révélé que des mutations de l’ADN polymérase, cible du CDV, n’étaient pas en cause, faisant envisager la possibilité d’une autre cible virale.

Titre traduit

Genetic variability of herpes simplex virus : molecular epidemiology and antiviral resistance

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