Réponses physiologiques et moléculaires d'une ultramicrobactérie marine oligotrophe Sphingopyxis alaskensis RB2256 à la lumière visible et au rayonnement ultraviolet
Auteur / Autrice : | Sabine Matallana Surget |
Direction : | Philippe Lebaron, Rick Cavicchioli |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Microbiologie marine |
Date : | Soutenance en 2009 |
Etablissement(s) : | Paris 6 en cotutelle avec University of New South Wales |
Mots clés
Résumé
Les rayonnements ultraviolets (UVR) pénétrent en profondeur dans les eaux claires oligotrophes affectant une large part de la couche euphotique. Les bactérie hétérotrophes marines jouent un rôle fondamental dans la reminéralisation de la matière organique dissoute et sont spécialement sensibles aux UVR à la surface des océans. Dans un contexte de changement climatique et réduction de la couche d'ozone, il est fondamental de mieux comprendre la physiologie et la réponse de bactéries marines abondantes, exposées aux UVR. Nous avons choisi comme modèle d'étude, la bactérie Sphingopyxis alaskensis, numériquement abondante dans les eaux oligotrophes et précédemment décrite comme photorésistante. Nous avons démontré que les dommages ADN sont fortement modulés par le GC%, la température de croissance et temps passé en phase stationnaire. Les modifications du protéome ont été également analysées par technique iTRAQ et des processus cellulaires originaux ont été caractérisés en réponse aux UVR.