Dynamique des communautés bactériennes marines : structure spatio-temporelle des communautés bactériennes et particularités écologiques du groupe fonctionnel des photohétérotrophes

par Raphaël Lami

Thèse de doctorat en Océanologie biologique

Sous la direction de Philippe Lebaron.

Soutenue en 2008

à Paris 6 .

mots clés

• Bactéries marines
• Photohétérotrophie
• Bactéries PAA [Phototrophesaérobies anoxygéniques]
• Ce-sscp
• Ocean Pacifique Sud
• Méditerranée
• Observatoire microbiologique
• Bactéries marines -- Pacifique (océan)

Résumé

Les bactéries jouent un rôle important dans les cycles biogéochimiques marins. Dans ce travail de thèse, une série temporelle d’une année a été échantillonnée à haute fréquence, et la structure et l’activité des communautés bactériennes ont été analysées à l’aide de la technique de CE-SSCP. Les résultats obtenus suggèrent que les populations bactériennes dominantes ne présentent pas une activité proportionnelle à leur abondance relative. La dynamique du groupe des photohétérotrophes a ensuite été examinée. Il a été montré de fortes abondances de ces organismes dans l’Océan Pacifique Sud. La dynamique des bactéries PAA a été ensuite analysée en Méditerranée. Les données acquises suggèrent que les fortes abondances de bactéries PAA sont corrélées avec leur attachement à la matière particulaire. L’ensemble de ces résultats renforce l’hypothèse d’un rôle important des bactéries PAA dans le cycle biogéochimique marin du carbone

Titre traduit

Dynamic of marine bacterial communities : spatial-temporal bacterial community structure and ecological characteristics of the photohetrotrophic functional group

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