Études structurales et fonctionnelles de la nucléoprotéine et de la polymérase du virus de la grippe en association avec leur transporteur nucléaire humain

Functional and structural studies on influenza virus nucleoprotein and polymerase complexed with its human import factor

• Auteur / Autrice : Sébastien Boulo
• Direction : Vincent Lotteau, Florence Baudin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biochimie
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Lyon 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Nucléoprotéines

Influenzavirus

Résumé

Le virus de la grippe est un virus à ARN négatif de la famille des Orthomyxoviridae et représente l'un des rares virus à ARN à se répliquer dans le noyau. Les particules ribonucléoprotéiques (RNP) contiennent l'ARN viral protégé par les nucléoprotéines (NP) et associé à l'ARN polymérase virale (sous-unités PB1, PB2 et PA). Nous avons étudié, par des techniques de biochimie et de biophysique, l'interaction de la nucléoprotéine non seulement avec l'ARN viral mais aussi avec son transporteur nucléaire humain, l'importine alpha 5. D'autre part, nous avons résolu la structure cristallographique d'un domaine de la polymérase (PB2) en complexe avec l'importine alpha 5. L'ensemble des résultats obtenus nous permet de mieux comprendre les interactions mises en jeu entre protéines virales et protéines de l'hôte et ainsi de comprendre pourquoi certains acides aminés présents dans le virus aviaire augmentent la virulence de la grippe chez l'humain

The virus of influenza is a negative-sense RNA virus belonging to the family of Orthomyxoviridae and represents one of the rare RNA viruses to replicate in the nucleus. The ribonucleoprotein particles (RNP) contain the viral RNA, protected by the nucleoproteins (NP) and associated with the RNA viral polymerase (subunits PB1, PB2 and PA). Using biochemical and biophysical tools, we have studied the interaction of the nucleoprotein not only with the viral RNA but also with its human nuclear transporter importin alpha 5. Besides, we have solved the crystallographic structure of a domain of the polymerase (PB2) in complex with importin alpha 5. Our results enable us to better understand the interactions between viral proteins and host proteins and thus, to understand why some amino-acids in the avian influenza virus increase the virulence of the virus in humans