Thèse soutenue

Importance de la variabilité verticale dans un lac méromictique profond : diversité et activité lysogène des communautés virales
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Auteur / Autrice : Jonathan Colombet
Direction : Télesphore Sime Ngando
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Écologie microbienne
Date : Soutenance en 2008
Etablissement(s) : Clermont-Ferrand 2

Mots clés

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Résumé

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Les objectifs de ce travail visaient à déterminer l'importance qualitative, quantitative et fonctionelle des virus dans le Lac Pavin, en tenant compte des gradients liés à la profondeur. Nous montrons que la dynamique de la diversité de l'abondance et de l'activité lytique du virioplancton du lac est étroitement associée à celle des communautés microbiennes. La prise en compte de l'ensemble de la colonne d'eau indique que la structure des réseaux trophiques microbiens et la place des virus dans ces réseaux dépendent de la profondeur. Finalement, jusqu'à 16% du bactérioplancton serait lysogène. Ce mode de vie, antagoniste à celui lytique, dépend de la disponibilité de l'hôte et serait un mécanisme de survie virale, pouvant avoir une incidence sur l'évolution adaptative des hôtes. Ces résultats montrent que les virus seraient essentiels dans la diversification et l'écologie des communautés microbiennes, et dans les flux de matière et d'énergie circulant dans la colonne d'eau