Facteurs de virulence et dissémination dans l'environnement via les effluents d'abattoirs d'animaux de boucherie d'Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC)

par Estelle Loukiadis

Thèse de doctorat en Microbiologie

Sous la direction de Eric Oswald et de Hubert Brugère.

Soutenue en 2007

à Toulouse 3 .

mots clés

• Ehec
• Gène stx
• Gène eae
• Gène cif
• Pseudogènes
• Phage
• Abattoir d'animaux de boucherie
• Effluents
• Environnement
• Déchets animaux
• Escherichia coli
• Contamination

Résumé

Les Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) sont des pathogènes majeurs en santé publique. Les Shiga-toxines et l'intimine sont leurs principaux facteurs de virulence mais d'autres, comme Cif, pourraient intervenir. Les animaux de boucherie constituent un réservoir important d'EHEC et la contamination des effluents des abattoirs reste à déterminer. Des souches d'EHEC potentielles ont été isolées dans les effluents des abattoirs étudiés. La diversité des facteurs de virulence détectés suggère que l'environnement interviendrait dans l'émergence de nouvelles souches EHEC. L'étude de la distribution, de la fonctionnalité et de l'organisation génétique de Cif a montré que cif est disséminé dans les populations d'E. Coli mais est souvent non fonctionnel. La caractérisation précise des souches devrait être inclue dans l'estimation de la virulence des EHEC. L'adoption de mesures d'hygiène peut réduire le risque de transmission d'EHEC de l'animal à l'homme via les effluents des abattoirs.

Titre traduit

Study of Xanthomonas campestris pv. Campestris TonB-dependent receptors and of a novel type III effector from this phytopathogenic bacterium

Résumé

Enterohaemorrhagic Escherichia coli (EHEC) are major human pathogens. Shiga-toxins and intimin are key virulence factors but others, such as Cif, could be involved. Livestock is the main reservoir of EHEC but contamination of sewage from slaughterhouses has to be checked. Sewage samples from slaughterhouses were tested for the presence and characteristics of putative EHEC. Potentially pathogenic strains were detected in the samples collected. The diversity observed among virulence factors suggests that the environment could play an important role in the emergence of EHEC strains. The study of distribution, functional expression and genetic organization of Cif has shown that cif has been spread within the natural population of E. Coli but was often not functional. Precise characterization of the strains should be included in the assessment of EHEC pathogenicity. Applying hygiene rules could reduce the risk of environmental transmission of EHEC from livestock to humans.