Annotation fonctionnelle de groupes de gènes issus de l'analyse transcriptomique
par Marc Aubry
Thèse de doctorat en Médecine. Biologie et sciences de la santé
Sous la direction de Jean Mosser.
Soutenue en 2007
à Rennes 1 .
mots clés-
Résumé
Nous présentons ici une méthode d'annotation fonctionnelle basée sur le niveau de preuve (GOA) et sur l'exploitation des données issues de la littérature (Pubgene). Nous comparons et discutons ces deux aspects de notre méthodologie. En particulier, nous expliquons en quoi cette méthode hybride permet d'élaborer un meilleur profil fonctionnel pour un groupe de (produits de ) gènes. Nous évaluons également notre méthode à l'aune d'un outil académique disponible sur Internet (GO Tre Machine). Enfin, nous considérons les apports et les limites des relations d'association entre les terme des ontologies de GO dans la perspective d'enrichir le profil fonctionnel d'un groupe de (produits de ) gènes.
-
Titre traduit
Functional annotation of genes in transcriptomic studies
-
Pas de résumé disponible.
