Méthodologies de simulation moléculaire pour le calcul de grandeurs thermodynamiques d'association : théorie et application à différents types de complexes

Methodologies of molecular simulation to the calculation of the binding thermodynamic properties : theory and application to differents complexes

• Auteur / Autrice : Aziz Ghoufi
• Direction : Patrice Malfreyt
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie - Physique
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Clermont-Ferrand 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Mécanique statistique

Dynamique moléculaire

Cations

Composés macrocycliques

Thermodynamique

Méthodes de simulation

Résumé

Le développement de nouvelles méthodes de perturbation, d'intégration thermodynamique et de potentiel de forces moyennes nous a permis de caractériser thermodynamiquement (delta r G, delta r H, delta r S) des processus d'association entre un macrocycle et différents types de cations en solution aqueuse. Différentes méthodologies ont été développées en fonction de la nature des interactions non-covalentes mises en jeu entre le macrocycle et le cation (interaction-pi, électrostatique, van des Waals). Lorsque les grandeurs d'association calculées étaient en accord avec l'expérience, l'aspect description moléculaire des complexes et des phénomènes associés a permis le couplage entre le microscopique et le macroscopique complétant ainsi l'analyse des grandeurs thermodynamiques