Caractérisation moléculaire du VIH-1 et premières données de la résistance aux antirétroviraux au Cambodge

Molecular characterization of HIV-1 and first data on antiretroviral drugs resistance in Cambodia

• Auteur / Autrice : Nary Ly
• Direction : Hervé J. A. Fleury
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et médicales. Biologie-Santé
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Bordeaux 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Vecteurs de clonage

Infections à VIH

Thérapie génique

Résistance aux antirétroviraux

Cambodge

Variabilité

VIH (virus)

Résumé

La variabilité génétique du VIH-1 a de nombreuses implications en particulier au niveau de la résistance aux anti-retroviraux (ARVs). En effet les mutants résistants aux ARVs sont bien caractérisés pour le sous-type B mais des données nouvelles sont nécessaires pour les sous-types non-B. Dans ce travail mené au Cambodge, nous nous sommes intéressés au CRF01_AE. Dans une première étude nous avons caractérisé les isolats viraux de patients adultes naîfs d'ARVs ; nous avons montré la large prédominance (95,5 %) du CRF01_AR , en outre nous avons mis en évidence la faible prévalence de mutations de résistance (MDR), inférieure au seuil fixé par l'OMS (5 %). La seconde étude a concerné des femmes enceintes recevant une prophylaxie par une simple dose de nevirapine dans le cadre d'une prévention de la transmission du VIH-1 de la mère à l'enfant. Nous avons observé un taux d'incidence des MDR aux inhibiteurs non nucléosidique de la transcriptase inverse variant de 18,8 % à 31,3 %, selon la période de l'échantillonnage. Globalement les mutations du CRF01_AE cambodgien étaient similaires à celles des sous-types A, D et CRF02_AG. Une dernière étude a porté sur des patients adultes recevant une HAART et présentant un échec thérapeutique. Les MDR observées étaient celles attendues pour le sous-type B. Cependant, d'autres substitutions ont été détectées chez ces patients en échec qui devront être confirmées sur de plus larges séries. Ces données pourraient à terme plaider pour une réactualisation artielle des algorithmes.

Genetic variability of HIV-1 has multiple implications, especially in regard to antiretroviral (ARV) drug resistance. Mutant resistances to ARVs are well characterized for B subtype but new data are needed for non-B subtypes. This research project investigated CRF01_AE in Cambodia. A first study has characterized viral isolates from adult patients naive to ARVs. It showed a large predominance of CRF01_AE (95,5 %), and a low prevalence of drug resistance mutations (DRM), lower than World Health Organization's 5 % threshold. A second study involved pregnant women who received nevirapine single dose prophylaxis for prevention of mother-to-child HIV-1 transmission. We observed incidence rates of DRM to nonnucleoside reverse transcriptase inhibitors of 18,8 % to 31,3 % according to the sampling time. Cambodian CRF01_AE mutations are generally similar to those observed in A, D and CRF02_AG subtypes. A last study involved adult patients in therapy failure under HAART. The DRM observed were those expected for the B subtype. Other substitutions were also detected in these patients but should be confirmed on larger samples. These data could lead to the partial update of algorithms.