Thèse soutenue

Segmentation d'images de microscopie en couleur pour l'analyse automatique de cultures cytologiques
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Auteur / Autrice : Estelle Glory
Direction : Georges Stamon
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences de la vie et de la matière. Informatique
Date : Soutenance en 2005
Etablissement(s) : Paris 5

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Cette thèse propose une stratégie de criblage à haut débit pour établir un protocole de thérapie cellulaire avec des cellules musculaires souches adultes. Elle présente une méthode complètement automatique pour quantifier les cultures cellulaires, de la culture à l’interprétation de données. L’analyse d’images repose sur la couleur des noyaux cellulaires. Les paramètres de l’algorithme sont déterminés par un critère spécialement conçu pour évaluer la qualité des segmentations d’images cytologiques. La deuxième contribution est le développement d’une classification adaptative qui distingue les noyaux individuels des agrégats, en utilisant une approche non-paramétrique. Les agrégats sont individualisés par une méthode de division-fusion combinant différentes implémentations de la ligne de partage des eaux. Les résultats produisent un taux d’erreur de dénombrement inférieur à 2%, avec 7% d’erreurs pour les agrégats et 0,5% pour les noyaux individuels, comparés à un comptage manuel.