Contribution à l'analyse fonctionnelle de protéines conservéesLes protéines de fonction inconnue d'E. Coli : le cas des oxydoréductases, YeaZ, produit d'un gène essentielLa première nucléoside diphosphate kinase virale

Structural and functional analysis of conserved proteins : the E.coli proteins of unknown function : the first viral Nucleoside Diphosphate Kinase

• Auteur / Autrice : Sandra Jeudy
• Direction : Chantal Abergel
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génomique structurale
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 1
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université de Provence. Section sciences

Mots clés

Mots clés contrôlés

Diffractomètres de rayons X

Nucléosides

Ciblage d'un gène

Génétique microbienne

Résumé

Le séquençage de génomes de divers organismes a permis d'accéder à l'ensemble de leur séquences protéiques et a entraîné la mise en place de nombreux projets de génomique structurale. Le laboratoire IGS est impliqué dans plusieurs projets de génomique structurale. Au cours de ma thèse, j'ai d'abord participé à un projet dont l'objectif était de découvrir de nouvelles protéines cibles pour la conception d'agents antibactériens. Dans ce cadre, je présente l'étude structurale et fonctionnelle de quatre protéines de fonction inconnue d'Escherichia coli. J'ai ensuite participé à l'étude de protéines d'Acanthamoeba polyphaga Mimivirus qui n'avaient jamais été identifiées auparavant dans un virus. L'objectif de ce projet est de déterminer leur origine et leur rôle pour le virus. Les résultats présentés sur la Nucléoside Diphosphate Kinase de Mimivirus suggèrent que le gène n'a pas été acquis par transfert latéral et que la protéine joue un rôle majeur dans le cycle réplicatif du virus

The complete genome sequencing of several organisms has made their protein sequences available. This has led to many structural and functional genomics projects all over the world. The IGS laboratory is involved in such projects. During my thesis, I first worked on a project aiming at the discovery of new antibacterial targets. I describe here a structural and functional study of four E. Coli proteins of unknown function. I was also involved in a study of Acanthamoeba polyphaga mimivirus proteins never identified before in a virus. The goal of this project is to determine the origin of these genes and their functional role in Mimivirus physiology. Here I describe the structural and functional study of Mimivirus Nucleoside Diphosphate Kinase. The results suggest that the gene encoding the NDK protein was not acquired from the host and that this protein plays a major role in Mimivirus DNA replication process