Variabilité génétique de l'enveloppe du virus de l'hépatite C de génotype 1b en relation avec la réponse au traitement antiviral : étude du polymorphisme des régions HVR1 et PePHD

Analysis of hepatis C virus

• Auteur / Autrice : Catherine Gaudy-Graffin
• Direction : Alain Goudeau
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Tours

Mots clés

Mots clés contrôlés

Résistance aux médicaments

Virus de l'hépatite C

Interférons

Variabilité génétique

Résistance aux substances

Interférons

Hepacivirus

Résumé

L'implication de la variabilité génétique du virus de l'hépatite C dans la résistance au traitement est encore mal connue. Deux régions du gène de l'enveloppe ont été explorées : la région hypervariable (HVR1) et le domaine PePHD. Nous avons exploré la diversité de HVR1 chez 15 patients infectés par un VHC de génotype 1b. Après analyse de 150 domaines pré-thérapeutiques de HVR1, aucune mutation de HVR1 ne paraît associée à la résistance ou à la sensibilité au traitement. Les domaines HVR1 issus des patients répondeurs ne présentent pas de trou antigénique régulièrement marqué aux positions 16 et 17, comme le montrent ceux issus des patients non répondeurs. L'implication de PePHD dans la résistance au traitement a été testée. Les résultats du séquençage, réalisé chez 25 patients, montrent une conservation du motif quel que soit le type de réponse, indiquant que le séquençage de PePHD n'est pas informatif pour prédire le type de réponse chez les patients infectés un VHC de génotype 1b.

The heterogeneite of hypervariable region 1 (HVR1), located in the E2 envelope, may be involved in resistance to IFN treatment. We investigated whether peculiar HVR1 domain profiles before treatment were associated with sensitivity or resistance to treatment. Fifteen patients infected with HCV-1b and treated with IFN +/- ribavirin were selected : ten responders (R1/R2) and five non-responders (NR). HVR1 sequences of 150 naturally occuring variants present in the sera previos therapy, were compared in correlation to treatment outcome. Antigenic prediction for HVR1 domains showed that NR variants had a constant no antigenic segment that was not found in variants from the R groups. Variability of PePHD domain, was explored in 25 HCV-1b-infected patients. The PePHD was conserved in resistant and susceptible genotype 1b strains. PePHD sequence cannot be used to predict reliably the outcome of treatment in HCV-1b-infected patients.